; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013002 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013002
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog 1A
Genome locationscaffold38:1383853..1387008
RNA-Seq ExpressionMS013002
SyntenyMS013002
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0041057.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucumis melo var. makuwa]4.4e-10698.52Show/hide
Query:  ILLLCSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNV
        +LL CSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNV
Subjt:  ILLLCSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNV

Query:  KQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGC
        KQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGC
Subjt:  KQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGC

Query:  CSS
        CSS
Subjt:  CSS

KAG7030156.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.2e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVN+KSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

XP_004147230.1 GTP-binding protein YPTM2 [Cucumis sativus]5.4e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

XP_022155520.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Momordica charantia]3.2e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTV+IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

XP_022948506.1 GTP-binding protein YPTM2-like [Cucurbita moschata]1.1e-104100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5E9 Uncharacterized protein2.6e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A5D3CJS0 GTP-binding protein YPTM2-like2.2e-10698.52Show/hide
Query:  ILLLCSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNV
        +LL CSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNV
Subjt:  ILLLCSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNV

Query:  KQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGC
        KQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVS+ETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGC
Subjt:  KQWLNEIDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGC

Query:  CSS
        CSS
Subjt:  CSS

A0A6J1DMM8 GTP-binding protein YPTM2-like1.5e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTV+IRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1G9D5 GTP-binding protein YPTM2-like5.3e-105100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

A0A6J1KZK2 GTP-binding protein YPTM25.3e-105100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a8.2e-9587.37Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+ + +ETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTVQIRGQPV QK+GCCS+
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

P40392 Ras-related protein RIC18.5e-9286.8Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYL+SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQ+SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVQIRGQPVNQKSGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNK DL  N+VVS+E  KA ADEIGIPF+ETSAK ATNVE+AFM MA EIKNRMA+QP  NA +P TVQ+RGQPV Q+S CCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNA-RPPTVQIRGQPVNQKSGCCS

Q05737 GTP-binding protein YPTM28.7e-9790.91Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTDQ+SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNKSDLTANKVV+ ETAKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV+QAFMAMAA IK+RMA+QP   NARP TVQIRGQPVNQK+ CCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQP-MNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b4.3e-9689.34Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c1.6e-9588.83Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 55.8e-9687.37Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTD++SFNNVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYAS+NVNKLLVGNKSDLT N+ + +ETAKAFADEIGIPFMETSAK ATNVEQAFMAM+A IK RMA+QP  NNARPPTVQIRGQPV QK+GCCS+
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPM-NNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E7.7e-6460Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVELDGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SFNN++ W+  
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK-VVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQ--------PVNQK
        I+++AS++VNK+LVGNK+D+  +K  V     +A ADE GI F ETSAK+  NVEQ F+++A +IK R+ T+    A P  ++I  Q          N+K
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANK-VVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQ--------PVNQK

Query:  SGCCS
        S CCS
Subjt:  SGCCS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein5.8e-8073.6Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+E DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYD T+ +SFNNVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVQIRGQPVNQKSGCC
        IDRYA+E+V KLL+GNK+D+  +KVVS ET +A ADE+GIPF+ETSAK + NVEQAF+ +A EIK +M +Q   N  + P TVQ++GQP+ Q +G C
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNN--ARPPTVQIRGQPVNQKSGCC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C1.2e-9688.83Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   ++PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A3.1e-9789.34Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIV YDVTD +SFNNVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS
        IDRYASENVNKLLVGNK+DLT+ KVVS ETAKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAM A IK RMA+QP   A+PPTVQIRGQPVNQ+SGCCSS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATTTTACTTCTGTGCAGTGATTATTTGTTTAAGCTCTTGCTTATTGGAGATTCTGGTGTTGGCAAATCATGTCTCCTTTTGAGGTTTGCAGACGATTCATATTTGGATAG
CTACATTAGCACCATTGGGGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTGGAACTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGCCAAGAACGTTTTAGAACAA
TAACCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCATGGCATTATTGTTGTTTATGATGTTACAGATCAAGACAGTTTCAATAATGTTAAGCAATGGTTAAATGAAATTGATCGTTAT
GCAAGTGAAAACGTGAATAAGCTTCTTGTGGGTAATAAGTCCGACCTGACGGCAAACAAAGTCGTCTCCCACGAGACAGCAAAGGCATTTGCGGATGAAATTGGAATCCC
CTTTATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCGACTCAACCAATGAACAATGCGCGGC
CGCCAACCGTGCAAATTCGAGGACAGCCAGTGAACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCGTCG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTACTTCTGTGCAGTGATTATTTGTTTAAGCTCTTGCTTATTGGAGATTCTGGTGTTGGCAAATCATGTCTCCTTTTGAGGTTTGCAGACGATTCATATTTGGATAG
CTACATTAGCACCATTGGGGTTGACTTTAAAATCCGCACAGTGGAACTCGATGGGAAGACTATTAAGCTCCAAATATGGGATACTGCTGGCCAAGAACGTTTTAGAACAA
TAACCAGCAGCTACTACCGTGGTGCTCATGGCATTATTGTTGTTTATGATGTTACAGATCAAGACAGTTTCAATAATGTTAAGCAATGGTTAAATGAAATTGATCGTTAT
GCAAGTGAAAACGTGAATAAGCTTCTTGTGGGTAATAAGTCCGACCTGACGGCAAACAAAGTCGTCTCCCACGAGACAGCAAAGGCATTTGCGGATGAAATTGGAATCCC
CTTTATGGAAACAAGTGCTAAAAGTGCCACGAACGTTGAACAGGCTTTCATGGCCATGGCTGCTGAAATCAAGAATAGGATGGCGACTCAACCAATGAACAATGCGCGGC
CGCCAACCGTGCAAATTCGAGGACAGCCAGTGAACCAAAAGTCTGGTTGCTGCTCGTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
ILLLCSDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVELDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQDSFNNVKQWLNEIDRY
ASENVNKLLVGNKSDLTANKVVSHETAKAFADEIGIPFMETSAKSATNVEQAFMAMAAEIKNRMATQPMNNARPPTVQIRGQPVNQKSGCCSS