; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013239 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013239
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description(S)-2-hydroxy-acid oxidase
Genome locationscaffold459:1472981..1476535
RNA-Seq ExpressionMS013239
SyntenyMS013239
Gene Ontology termsGO:0009854 - oxidative photosynthetic carbon pathway (biological process)
GO:0005777 - peroxisome (cellular component)
GO:0003973 - (S)-2-hydroxy-acid oxidase activity (molecular function)
GO:0010181 - FMN binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000262 - FMN-dependent dehydrogenase
IPR008259 - FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase, active site
IPR012133 - Alpha-hydroxy acid dehydrogenase, FMN-dependent
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR037396 - FMN hydroxy acid dehydrogenase domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581778.1 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-17588.46Show/hide
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XP_022148294.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like [Momordica charantia]4.9e-19699.73Show/hide
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XP_022955687.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X1 [Cucurbita moschata]4.7e-17588.19Show/hide
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XP_022955690.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X4 [Cucurbita moschata]4.7e-17588.19Show/hide
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XP_038880952.1 peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO4-like isoform X2 [Benincasa hispida]6.2e-17587.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEF4 (S)-2-hydroxy-acid oxidase6.7e-17585.71Show/hide
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A0A1S3CCP5 (S)-2-hydroxy-acid oxidase1.5e-17486.26Show/hide
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A0A6J1D4Y8 (S)-2-hydroxy-acid oxidase2.4e-19699.73Show/hide
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A0A6J1GUB4 (S)-2-hydroxy-acid oxidase2.3e-17588.19Show/hide
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A0A6J1GVS5 (S)-2-hydroxy-acid oxidase2.3e-17588.19Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8B8K5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO42.4e-12964.82Show/hide
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        P+NV +++ELA++ALPKM YD+  GGAED+HTLRENI A+ +I +RPRVLVDVSKIDMSTT+LGY + +PI+VAPT  HKLA+ EGE ATARAAA+   I
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        ATLD SL W+DI WL+SITS+PI +KGI+T EDA RAVEAGV G+IVSNHGARQLD+APAT++ LEEVV AV G VPVL DGG+RRGTDVFKALALGA+A
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        V+   PV FGLAA+GE G R V+EML  ELE+ MAL GC S+ +ITRS V T+ D+++S+L
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Q24JJ8 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO37.4e-14772.14Show/hide
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        +NV++F+ELA+QALPKMYYDFY GGAEDQHTL EN+QAF +I  RPRVLVDVSKIDMST ILGY ISAPIM+APT  HKLA+ EGE ATA+AAAA  TIM
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        ++SY ++ + EE+ASSC+AVRF Q+YV+KRRDIT  +VKRAE++G+KAIVLT D PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E+   +GS ++A A+  
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         DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT EDA +AVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PAT++VLEEVV  V+GR+PVL DGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
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Query:  IGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML
        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+ VRT+ ++L SML
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Q8H3I4 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO45.7e-13165.37Show/hide
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        P+NV +++ELA++ALPKM YD+  GGAED+HTLRENI A+ +I +RPRVLVDVSKIDMSTT+LGY + +PI+VAPT  HKLA+ EGE ATARAAA+   I
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Query:  MVLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSV-EINSDQGSKLEAHAN
        MVLS+S++  IE+VASSC+A+RF+QLYV+K R+++  LV+RAE  G+KA++LT DTP LGRREADI+NKM+ P   NLEGL++  + ++  GS+LE  A 
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Query:  ATLDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALGAQA
        ATLD SL W+DI WL+SITS+PI +KGI+T EDA RAVEAGV G+IVSNHGARQLD+APAT++ LEEVV AV G VPVL DGG+RRGTDVFKALALGA+A
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Query:  VLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML
        V++GRPV FGLAA+GE G R V+EML  ELE+ MAL GC S+ +ITRS V T+ D+++S+L
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Q9LJH5 Peroxisomal (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO43.2e-15072.42Show/hide
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        +NV++F+ELA+QALPKMYYDFY GGAEDQHTL EN+QAF +I  RPRVLVDVS IDMST++LGY ISAPIM+APTA HKLA+ +GE+ATA+AAAA  TIM
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Query:  VLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANAT
        ++S+ +T +IEEVASSC+AVRF Q+YV+KRRD+T  +VKRAE++G+KAIVLT D PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGLVS E+  ++GS +EA A++ 
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         DASL W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT EDA +AVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PAT++VLEEVVHAV+GR+PVL DGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
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Query:  IGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML
        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I D+TR+ VRT+ ++++SML
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Q9LRR9 (S)-2-hydroxy-acid oxidase GLO11.2e-12061.45Show/hide
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        E  NV ++  +A+Q LPKM YD+YA GAEDQ TL+EN  AF +I  RPR+L+DVSKIDM+TT+LG++IS PIMVAPTA  K+A+ +GE ATARAA+AA T
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Query:  IMVLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLVSVEINSDQGSKLEA
        IM LS  ATSS+EEVAS+   +RFFQLYV+K R++   LV+RAER+G+KAI LT DTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   +++    S L +
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Query:  HANATLDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALG
        +    +D +L W+D+ WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PAT+S LEEVV A QGR+PV  DGGVRRGTDVFKALALG
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        A  + IGRPV+F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+ + T++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G14130.1 Aldolase-type TIM barrel family protein2.3e-15172.42Show/hide
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        +NV++F+ELA+QALPKMYYDFY GGAEDQHTL EN+QAF +I  RPRVLVDVS IDMST++LGY ISAPIM+APTA HKLA+ +GE+ATA+AAAA  TIM
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Query:  VLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANAT
        ++S+ +T +IEEVASSC+AVRF Q+YV+KRRD+T  +VKRAE++G+KAIVLT D PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGLVS E+  ++GS +EA A++ 
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Query:  LDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
         DASL W+DI WLRSIT LPIL+KG+LT EDA +AVEAGVDGI+VSNHGARQLD++PAT++VLEEVVHAV+GR+PVL DGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
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Query:  IGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML
        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I D+TR+ VRT+ ++++SML
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AT3G14150.1 Aldolase-type TIM barrel family protein5.3e-14872.14Show/hide
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        +NV++F+ELA+QALPKMYYDFY GGAEDQHTL EN+QAF +I  RPRVLVDVSKIDMST ILGY ISAPIM+APT  HKLA+ EGE ATA+AAAA  TIM
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Query:  VLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANAT
        ++SY ++ + EE+ASSC+AVRF Q+YV+KRRDIT  +VKRAE++G+KAIVLT D PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E+   +GS ++A A+  
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         DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT EDA +AVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PAT++VLEEVV  V+GR+PVL DGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
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Query:  IGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML
        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+ VRT+ ++L SML
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AT3G14150.2 Aldolase-type TIM barrel family protein5.3e-14872.14Show/hide
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        +NV++F+ELA+QALPKMYYDFY GGAEDQHTL EN+QAF +I  RPRVLVDVSKIDMST ILGY ISAPIM+APT  HKLA+ EGE ATA+AAAA  TIM
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Query:  VLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANAT
        ++SY ++ + EE+ASSC+AVRF Q+YV+KRRDIT  +VKRAE++G+KAIVLT D PRLGRREADIKNKMI+P +KN EGL S E+   +GS ++A A+  
Subjt:  VLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANAT

Query:  LDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
         DAS  W+DI WLRSIT LPIL+KGILT EDA +AVEAGVDGIIVSNHG RQLD++PAT++VLEEVV  V+GR+PVL DGGVRRGTDVFKALALGAQAVL
Subjt:  LDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALGAQAVL

Query:  IGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML
        IGRP+++GLAAKGE+GV+ V++MLKNE EITMALSGCP+I DITR+ VRT+ ++L SML
Subjt:  IGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML

AT3G14420.1 Aldolase-type TIM barrel family protein8.5e-12261.45Show/hide
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        E  NV ++  +A+Q LPKM YD+YA GAEDQ TL+EN  AF +I  RPR+L+DVSKIDM+TT+LG++IS PIMVAPTA  K+A+ +GE ATARAA+AA T
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Query:  IMVLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLVSVEINSDQGSKLEA
        IM LS  ATSS+EEVAS+   +RFFQLYV+K R++   LV+RAER+G+KAI LT DTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   +++    S L +
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Query:  HANATLDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALG
        +    +D +L W+D+ WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PAT+S LEEVV A QGR+PV  DGGVRRGTDVFKALALG
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Query:  AQAVLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYD
        A  + IGRPV+F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+ + T++D
Subjt:  AQAVLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYD

AT3G14420.2 Aldolase-type TIM barrel family protein8.5e-12261.45Show/hide
Query:  EPMNVNDFKELARQALPKMYYDFYAGGAEDQHTLRENIQAFHKITIRPRVLVDVSKIDMSTTILGYRISAPIMVAPTAAHKLAYHEGELATARAAAAAKT
        E  NV ++  +A+Q LPKM YD+YA GAEDQ TL+EN  AF +I  RPR+L+DVSKIDM+TT+LG++IS PIMVAPTA  K+A+ +GE ATARAA+AA T
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Query:  IMVLSYSATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPP---VKNLEGLVSVEINSDQGSKLEA
        IM LS  ATSS+EEVAS+   +RFFQLYV+K R++   LV+RAER+G+KAI LT DTPRLGRRE+DIKN+   PP   +KN EGL   +++    S L +
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Query:  HANATLDASLRWEDIGWLRSITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALG
        +    +D +L W+D+ WL++IT LPIL+KG+LT EDA  A++AG  GIIVSNHGARQLD+ PAT+S LEEVV A QGR+PV  DGGVRRGTDVFKALALG
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Query:  AQAVLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLKNELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYD
        A  + IGRPV+F LAA+GE GVR VL+ML++E E+TMALSGC S+K+I+R+ + T++D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTGAGCCGATGAATGTGAATGACTTCAAAGAATTGGCTAGGCAGGCACTTCCAAAAATGTATTATGATTTCTATGCAGGGGGTGCTGAGGACCAACACACACT
TAGAGAGAACATACAAGCTTTCCATAAAATCACGATCCGACCTAGAGTTCTTGTGGATGTGAGCAAAATTGATATGTCAACAACCATATTGGGCTATCGCATATCTGCAC
CTATCATGGTTGCTCCAACTGCAGCACATAAGCTAGCATACCATGAAGGAGAACTAGCCACGGCCAGGGCAGCAGCTGCTGCAAAAACCATAATGGTTCTATCCTACTCT
GCGACCTCTTCAATAGAGGAAGTTGCCTCTAGCTGTGATGCTGTCCGTTTTTTTCAATTATATGTATTCAAAAGGCGTGATATCACAACTCTGCTAGTAAAGAGAGCTGA
GAGATCTGGATACAAGGCAATAGTCCTGACTGCTGATACTCCTCGGCTTGGAAGAAGGGAGGCTGACATAAAGAACAAAATGATTGCACCTCCAGTGAAGAATCTTGAAG
GCCTCGTATCGGTTGAAATTAACTCTGATCAAGGTTCAAAATTAGAAGCTCACGCCAATGCGACCTTGGATGCATCTCTGCGCTGGGAAGATATAGGATGGTTAAGATCA
ATCACTAGCCTGCCAATTTTGATCAAGGGAATTCTTACTCATGAAGATGCAACTAGAGCTGTGGAAGCAGGTGTTGATGGAATTATTGTCTCCAATCATGGGGCCCGCCA
ACTCGATTTTGCTCCTGCTACTGTTTCTGTCCTTGAAGAGGTAGTTCATGCTGTCCAGGGTAGAGTTCCTGTCCTCTTCGACGGAGGTGTGCGACGAGGAACAGATGTGT
TTAAGGCGTTAGCCCTTGGTGCCCAAGCAGTCCTTATAGGGAGACCAGTTTTGTTTGGGCTAGCAGCAAAGGGAGAAGAGGGAGTAAGAACAGTGCTGGAAATGCTCAAG
AATGAGTTGGAGATCACTATGGCACTTTCTGGTTGCCCGTCCATCAAGGATATTACTAGAAGCCTTGTGAGGACACAGTATGATAAGCTGCAATCAATGCTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTTCTGAGCCGATGAATGTGAATGACTTCAAAGAATTGGCTAGGCAGGCACTTCCAAAAATGTATTATGATTTCTATGCAGGGGGTGCTGAGGACCAACACACACT
TAGAGAGAACATACAAGCTTTCCATAAAATCACGATCCGACCTAGAGTTCTTGTGGATGTGAGCAAAATTGATATGTCAACAACCATATTGGGCTATCGCATATCTGCAC
CTATCATGGTTGCTCCAACTGCAGCACATAAGCTAGCATACCATGAAGGAGAACTAGCCACGGCCAGGGCAGCAGCTGCTGCAAAAACCATAATGGTTCTATCCTACTCT
GCGACCTCTTCAATAGAGGAAGTTGCCTCTAGCTGTGATGCTGTCCGTTTTTTTCAATTATATGTATTCAAAAGGCGTGATATCACAACTCTGCTAGTAAAGAGAGCTGA
GAGATCTGGATACAAGGCAATAGTCCTGACTGCTGATACTCCTCGGCTTGGAAGAAGGGAGGCTGACATAAAGAACAAAATGATTGCACCTCCAGTGAAGAATCTTGAAG
GCCTCGTATCGGTTGAAATTAACTCTGATCAAGGTTCAAAATTAGAAGCTCACGCCAATGCGACCTTGGATGCATCTCTGCGCTGGGAAGATATAGGATGGTTAAGATCA
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ACTCGATTTTGCTCCTGCTACTGTTTCTGTCCTTGAAGAGGTAGTTCATGCTGTCCAGGGTAGAGTTCCTGTCCTCTTCGACGGAGGTGTGCGACGAGGAACAGATGTGT
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AATGAGTTGGAGATCACTATGGCACTTTCTGGTTGCCCGTCCATCAAGGATATTACTAGAAGCCTTGTGAGGACACAGTATGATAAGCTGCAATCAATGCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSEPMNVNDFKELARQALPKMYYDFYAGGAEDQHTLRENIQAFHKITIRPRVLVDVSKIDMSTTILGYRISAPIMVAPTAAHKLAYHEGELATARAAAAAKTIMVLSYS
ATSSIEEVASSCDAVRFFQLYVFKRRDITTLLVKRAERSGYKAIVLTADTPRLGRREADIKNKMIAPPVKNLEGLVSVEINSDQGSKLEAHANATLDASLRWEDIGWLRS
ITSLPILIKGILTHEDATRAVEAGVDGIIVSNHGARQLDFAPATVSVLEEVVHAVQGRVPVLFDGGVRRGTDVFKALALGAQAVLIGRPVLFGLAAKGEEGVRTVLEMLK
NELEITMALSGCPSIKDITRSLVRTQYDKLQSML