; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013370 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013370
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationscaffold402:706924..711748
RNA-Seq ExpressionMS013370
SyntenyMS013370
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-14092.36Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL+KNYLLADR+IPYTS+LGG+ ACKLVYDLTQLVS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRG+STIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGL+TFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR
        YLING VIFFAWLVARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MHVIGY+LVFGVPT+LG+MNLMWFGKI+KGLMKTI  +R
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR

XP_008459089.1 PREDICTED: transmembrane protein 56-like [Cucumis melo]2.2e-14092.99Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL+KNYLLAD ++P+TS+LGG+ ACKL+YDLTQLVS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        YLINGIVIFFAWL+ARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKI+KGLMKTI
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

XP_022142484.1 transmembrane protein 56-like [Momordica charantia]1.7e-14899.64Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR
        YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI TKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR

XP_023543000.1 transmembrane protein 56 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.8e-14192.73Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL+KNYLLADR+IPYTS+LGG+ ACKLVYDLTQLVS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRG+STIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGL+TFQSS LSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR
        YLING VIFFAWLVARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MHVIGY+LVFGVPTVLGMMNLMWFGKI+KGLMKTI  +R
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR

XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]1.2e-14194.46Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL+KNYLLADR++P+TS+LGG+ ACKLVYDLTQLVS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKI+KGLMKTI
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like1.1e-14092.99Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL+KNYLLAD ++P+TS+LGG+ ACKL+YDLTQLVS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        YLINGIVIFFAWL+ARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKI+KGLMKTI
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like1.1e-14092.99Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL+KNYLLAD ++P+TS+LGG+ ACKL+YDLTQLVS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMST HAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        YLINGIVIFFAWL+ARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKI+KGLMKTI
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

A0A6J1CL26 transmembrane protein 56-like8.1e-14999.64Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR
        YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI TKR
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR

A0A6J1EH94 transmembrane protein 56-like4.0e-14093.73Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL++NYLLADR IPYTS+LGGI ACKLVYDLTQ+VS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTF+LGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        YLING+VIFFAWLVARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MH IGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKI KGLMKTI
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

A0A6J1KGK7 transmembrane protein 56-like4.0e-14093.73Show/hide
Query:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
        M MSLKTVMAIKSYQSQADAL++NYLLADR IPYTS+LGGI ACKLVYDLTQ+VS+FYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF
Subjt:  MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLF

Query:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA
        SDQRHAGLVTFQSSTLSTF+LGISVGYFLADLGLI+WLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMK+SCA
Subjt:  SDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCA

Query:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        YLING+VIFFAWLVARILLFGYTF+HV+LHYDQVI+MH IGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKI KGLMKTI
Subjt:  YLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B1.8e-1225.76Show/hide
Query:  LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVV
        L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST++AI  S +S+Y +++++   +   +      +S +S FI      YF+ D  +  +    L     ++
Subjt:  LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVV

Query:  HHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFL---HYDQVIQMHVIGYLLVF
        HH+++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L    +K    Y+ING++IF  +++ R+     T F V     HY  +    +I + + F
Subjt:  HHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFL---HYDQVIQMHVIGYLLVF

Query:  GVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR
          P +  ++NL W   I K + K   T +
Subjt:  GVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR

Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B3.4e-1124.56Show/hide
Query:  LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVV
        ++ ++SS + + Y  L   +  +WN+R +ST+HA+ + +  LY +++ D  ++    G        L    + I+ GY   DL L+   + ++G + +V 
Subjt:  LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVV

Query:  HHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLI-NGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVF-LHYDQVIQMHVIGYLLVFG
        HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     ++   ++ NGI +   + + RI +    +  VF + Y    +   +   + + 
Subjt:  HHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLI-NGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVF-LHYDQVIQMHVIGYLLVFG

Query:  VPTV-LGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK
        +  V L ++N++W  KI +G  K I  K
Subjt:  VPTV-LGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK

Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A6.4e-1023.6Show/hide
Query:  DRYIPYTSILGGIFACKLVYD-LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGY
        D  I Y  + G     +L++  ++  + + Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ GY
Subjt:  DRYIPYTSILGGIFACKLVYD-LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGY

Query:  FLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFH
         + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  + S   L+NG+ +   + + RI +    +  
Subjt:  FLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFH

Query:  VFLHY--DQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK
        VF  +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K +  K
Subjt:  VFLHY--DQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK

Q6P4N1 TLC domain-containing protein 43.2e-0922.98Show/hide
Query:  YIPYTSILGGIFACKLVYD-LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFL
        +I Y  + G     +L++  ++    + Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + +  +     G   +    ++     I+ GY +
Subjt:  YIPYTSILGGIFACKLVYD-LTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFL

Query:  ADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVF
         DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  G  + S   L+NG+ +   + + RI +    +  VF
Subjt:  ADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGM-KKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVF

Query:  LHY--DQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK
          +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K +  K
Subjt:  LHY--DQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK

Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B3.3e-1428.77Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LII+ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
Subjt:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFS

Query:  GEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKK-SCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHY-DQVIQMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMW
        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ + RI +    +  VF  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
Subjt:  GEGQL--YTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKK-SCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHY-DQVIQMHVIGYLLVFGVPTV-LGMMNLMW

Query:  FGKIIKGLMKTI
          KI KG  K +
Subjt:  FGKIIKGLMKTI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.2e-11271.43Show/hide
Query:  TMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS
        T SL+T+ AIKSY  QA  L+KNYLLAD +IPYTS+L GIF CK+VYDL   +S+ + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFS
Subjt:  TMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS

Query:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAY
        D+ H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMKKS AY
Subjt:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAY

Query:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK
        ++NG+ IF AWLVARILLF Y F+HV+LHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKI++G+ KT+  +
Subjt:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK

AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.2e-11271.43Show/hide
Query:  TMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS
        T SL+T+ AIKSY  QA  L+KNYLLAD +IPYTS+L GIF CK+VYDL   +S+ + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFS
Subjt:  TMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFS

Query:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAY
        D+ H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAGMKKS AY
Subjt:  DQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAY

Query:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK
        ++NG+ IF AWLVARILLF Y F+HV+LHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKI++G+ KT+  +
Subjt:  LINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTK

AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-6350Show/hide
Query:  SILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        SI  G   CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G K S AY +NGI +F  WLVAR+LLF + F H++LH+ QV 
Subjt:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVI

Query:  QMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        Q+  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+
Subjt:  QMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.4e-10570.45Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  +++YLLAD ++PYTS+L GI  CKLVYDLT+L SS + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+K+S AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        IFFAWL ARILLF Y F+HV+ HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKI+KGL KT+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI

AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein5.4e-10570.45Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  +++YLLAD ++PYTS+L GI  CKLVYDLT+L SS + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG+K+S AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI
        IFFAWL ARILLF Y F+HV+ HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKI+KGL KT+
Subjt:  IFFAWLVARILLFGYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCTTTGATAAAGAATTACTTGTTAGCAGATCGATATATTCCATACACCTCTAT
CCTCGGAGGCATCTTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAGTTTTTACTTCAAGAGTTATTTGGGTCTCACAAAAATCCAACGAGTTGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCACGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATATTGGGGATCTCAGTTGGATACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTCTCTGGATTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATACATGGTTCTCATTTCAGAGATTACAACTCCAGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAAGTCCTGTGCATATCTGATTAATGGGATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATATTGCTCTTT
GGTTACACATTCTTTCATGTTTTCCTGCACTATGATCAGGTAATTCAGATGCATGTAATTGGCTATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACGGTGCTAGGCATGATGAACTT
GATGTGGTTCGGGAAGATCATTAAGGGATTGATGAAGACGATAGTGACGAAGCGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAATGTCTTTGAAGACTGTAATGGCTATTAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCTTTGATAAAGAATTACTTGTTAGCAGATCGATATATTCCATACACCTCTAT
CCTCGGAGGCATCTTTGCTTGTAAATTGGTCTATGATCTTACTCAATTAGTTAGCAGTTTTTACTTCAAGAGTTATTTGGGTCTCACAAAAATCCAACGAGTTGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCATTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCACGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACGTTGTCTACTTTCATATTGGGGATCTCAGTTGGATACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCTTTAGGTGGGATGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTCTCTGGATTAGCAGTAGCATATTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACATACATGGTTCTCATTTCAGAGATTACAACTCCAGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACAGCTGGTATGAAGAAGTCCTGTGCATATCTGATTAATGGGATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGGTTGCTCGCATATTGCTCTTT
GGTTACACATTCTTTCATGTTTTCCTGCACTATGATCAGGTAATTCAGATGCATGTAATTGGCTATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACGGTGCTAGGCATGATGAACTT
GATGTGGTTCGGGAAGATCATTAAGGGATTGATGAAGACGATAGTGACGAAGCGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTMSLKTVMAIKSYQSQADALIKNYLLADRYIPYTSILGGIFACKLVYDLTQLVSSFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGMKKSCAYLINGIVIFFAWLVARILLF
GYTFFHVFLHYDQVIQMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIIKGLMKTIVTKR