; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013502 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013502
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationscaffold402:2021902..2022903
RNA-Seq ExpressionMS013502
SyntenyMS013502
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7012516.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-7499.32Show/hide
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KAG7017469.1 40S ribosomal protein S14-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-7499.32Show/hide
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XP_004149195.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]1.1e-7499.32Show/hide
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XP_022140243.1 40S ribosomal protein S14 [Momordica charantia]3.5e-76100Show/hide
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XP_038893713.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Benincasa hispida]5.1e-75100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein5.5e-7599.32Show/hide
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A0A1S3B682 40S ribosomal protein S14-25.5e-7599.32Show/hide
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A0A6J1CHJ7 40S ribosomal protein S141.7e-76100Show/hide
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A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-25.5e-7599.32Show/hide
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A0A6J1KQN4 40S ribosomal protein S14-2-like5.5e-7599.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S143.8e-7395.27Show/hide
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P19951 40S ribosomal protein S141.2e-7494.67Show/hide
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P42036 40S ribosomal protein S14-36.5e-7391.89Show/hide
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Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-25.9e-7493.92Show/hide
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Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-15.0e-7392.57Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein3.5e-7492.57Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein4.2e-7593.92Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein4.6e-7491.89Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S114.7e-1031.25Show/hide
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        R+ TR    + V   P         GV H+ ASFN+T + VTD+ GR       G    +  R   +P+AA  AA +  +   + G+    +++      
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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