; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013514 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013514
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionAWPM-19-like family protein
Genome locationscaffold402:2126942..2128602
RNA-Seq ExpressionMS013514
SyntenyMS013514
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147399.3 membrane protein PM19L [Cucumis sativus]2.1e-6686.16Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA+TQMKS ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWSV+SL AA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        SSAAVFAWTLTILAMGFA KEI LDFR+ RL+TMEAFFIILS TQL+YIMAIHG  S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

XP_008443837.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487332 [Cucumis melo]1.2e-6988.68Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWSV+SLGAA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+ RL+TMEAFFIILS TQL+YIMAIHG  S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

XP_022140126.1 uncharacterized protein LOC111010860 [Momordica charantia]1.8e-7899.37Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILS TQLLYIMAIHGAPSIR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

XP_023001482.1 uncharacterized protein LOC111495604 [Cucurbita maxima]1.6e-6688.96Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWS +SLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        FAW+LTILAMGFACKEI LD+R+TRLITMEAFFIILS TQL+YI AIHGA S R
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

XP_038895378.1 membrane protein PM19L-like [Benincasa hispida]5.8e-6987.42Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA+TQMKS+ATLLLLLNFCMYA+ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLAAVFGAASAISGLNHIRSWS +SLGAA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        S+AAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+ RL+TMEAFFIILS TQL+YI+AIHGA S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV01 AWPM19-like protein1.3e-6686.16Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA+TQMKS ATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA VFGAASAISGLNHIRSWSV+SL AA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        SSAAVFAWTLTILAMGFA KEI LDFR+ RL+TMEAFFIILS TQL+YIMAIHG  S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

A0A6J1CEV9 uncharacterized protein LOC1110108608.7e-7999.37Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILS TQLLYIMAIHGAPSIR
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

A0A6J1EI31 uncharacterized protein LOC1114342866.5e-6690.67Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAV
        MK +ATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIR WS +SLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGA
        FAW+LTILAMGFACKEI LD+R+TRLITMEAFFIILS TQLLYI AIHGA
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGA

A0A6J1KGN7 uncharacterized protein LOC1114956047.7e-6788.96Show/hide
Query:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAV
        MK +A+LLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAV GAASAISGLNHIRSWS +SLGAASSAAV
Subjt:  MKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAV

Query:  FAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        FAW+LTILAMGFACKEI LD+R+TRLITMEAFFIILS TQL+YI AIHGA S R
Subjt:  FAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

A5Y734 AWPM19-like protein5.7e-7088.68Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA+TQMKSIATLLLLLNFCMY +ILGIGGWAMN AIDHGF+IGP  RLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLA VFGAASAISGLNHIRSWSV+SLGAA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR
        SSAAVFAWTLTILAMGFACKEI LDFR+ RL+TMEAFFIILS TQL+YIMAIHG  S R
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L1.1e-2244.06Show/hide
Query:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAVFAWTLTI
        LL+LN  MY +++G   W +N  I +G    P               GN AT +F+ FA+LA V GAAS ++G++H+RSW   SL A +++A+ AW +T 
Subjt:  LLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAVFAWTLTI

Query:  LAMGFACKEIEL-DFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHG
        LA G ACKEI +  +R  RL  +EAF IIL+FTQLLY+  +HG
Subjt:  LAMGFACKEIEL-DFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein6.9e-2848.05Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA T  ++IA  LL LN  MY ++LG   W +N  I +G    P F             GN AT FF+TF++LAAV G AS ++G NHIR W  DSL AA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIEL-DFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIH
         ++++ AW +T LAMG ACK+I +  +R  RL  +EAF IIL+FTQLLY+M IH
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIEL-DFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIH

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein3.2e-5772.73Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA  Q+K +A+ LL+LNFCMY ++LGIGGWAMN AIDHGF +GP+  LPAHFSPIYFPMGNAATGFFV FALLA V GAAS ISGL+HIRSW+V SL AA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHG
        ++AA  AWTLT+LAMGFA KEIEL  R+ +L TMEAF IILS TQL+YI A+HG
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHG

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein2.6e-2744.44Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        MA+   KS A +LL+LN  +Y VI  I  WA+N  I+          LPA   PIYFP+GN ATGFFV F L+A V G A++++G+ ++  W   +L +A
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIH
        +++++ +W+LT+LAMG ACKEI + +    L T+E   II+S TQLL   AIH
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIH

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein1.1e-5468.83Show/hide
Query:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA
        M   QMK +A+ LL+LNFCMYA++LGIG W+MN AI+HGF+IG D+ LPAHFSPI+FPMGNAATGFF+ FAL+A V GAAS ISG++H++SW+  SL AA
Subjt:  MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAA

Query:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHG
         SAA  AW+LT+LAMGF CKEIEL  R+ RL TMEAF IILS TQLLYI AI+G
Subjt:  SSAAVFAWTLTILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAACACACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTCAACTTCTGTATGTACGCCGTTATTTTGGGCATTGGTGGGTGGGCCATGAATACAGCCATTGA
TCATGGCTTCGTCATTGGTCCCGATTTTCGACTACCGGCACATTTTTCGCCCATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGGTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTTTTTGGAGCTGCCTCAGCAATTTCAGGACTGAACCATATTCGTTCATGGAGTGTTGACAGCTTAGGTGCTGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTATTCTTGCTATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGAACTGGATTTCAGAAGCACAAGACTGATAACAATGGAGGCCTTCTTCATCATTCTCTCTTTTACACAGCTACT
TTACATTATGGCCATTCATGGCGCTCCATCCATAAGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCAACACACAGATGAAATCCATTGCCACTTTGCTTCTGTTGCTCAACTTCTGTATGTACGCCGTTATTTTGGGCATTGGTGGGTGGGCCATGAATACAGCCATTGA
TCATGGCTTCGTCATTGGTCCCGATTTTCGACTACCGGCACATTTTTCGCCCATTTACTTCCCCATGGGGAATGCAGCCACTGGGTTCTTTGTGACATTTGCTTTGTTGG
CTGCTGTTTTTGGAGCTGCCTCAGCAATTTCAGGACTGAACCATATTCGTTCATGGAGTGTTGACAGCTTAGGTGCTGCATCCTCTGCTGCTGTTTTTGCTTGGACTCTC
ACTATTCTTGCTATGGGCTTTGCTTGCAAAGAGATTGAACTGGATTTCAGAAGCACAAGACTGATAACAATGGAGGCCTTCTTCATCATTCTCTCTTTTACACAGCTACT
TTACATTATGGCCATTCATGGCGCTCCATCCATAAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANTQMKSIATLLLLLNFCMYAVILGIGGWAMNTAIDHGFVIGPDFRLPAHFSPIYFPMGNAATGFFVTFALLAAVFGAASAISGLNHIRSWSVDSLGAASSAAVFAWTL
TILAMGFACKEIELDFRSTRLITMEAFFIILSFTQLLYIMAIHGAPSIR