; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013598 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013598
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionVQ motif containing protein
Genome locationscaffold402:2742859..2743641
RNA-Seq ExpressionMS013598
SyntenyMS013598
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-10884.73Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.1e-10884.35Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]3.2e-10987.16Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X25.2e-10582.06Show/hide
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A0A6J1CGC6 VQ motif-containing protein 4-like isoform X13.1e-13498.84Show/hide
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A0A6J1CHL5 VQ motif-containing protein 4-like isoform X22.7e-13398.45Show/hide
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like6.6e-10883.97Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like3.3e-10783.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 133.1e-3046.7Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+           T   +        IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP        +S
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        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  S
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Q5M750 VQ motif-containing protein 43.6e-6357.62Show/hide
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        ME S  ++E      ++L+PSP    +N S   SS+S   +     PPT P   +        TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K 
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         S+ KP  T  Q     + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  L+INPL PVF   NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPD
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        PFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 334.8e-3145.2Show/hide
Query:  SCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPP-QLHLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKSLP
        S SS +S   Q+  PPP    P  Q  + SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           A +   N+   S   IPPIK   
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Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLRI-NPLIPVFGSCNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N LR+ N    +F   NS       FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLRI-NPLIPVFGSCNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 313.2e-1134.38Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLRINPLIPVFGSCNSGFSPRKPEILSP
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG P     A+A P AT               IK+  +++ +  KL+ERR  +                      K EI+ P
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Query:  SILDFPALALSPV-----TPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPG
          L F     +P      T L+  P     S  +N S ++    +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 191.1e-3547.54Show/hide
Query:  TNTSSCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPPQLHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKS
        +++SS SSS  NG               LH H    ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P  T S     V    IPPIK+
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Query:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLRINPLIPVFGSCNS-GFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA
           ++ SG KLYERR       N  N L IN L+   G   S  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+              
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Query:  KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
              EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein2.6e-6457.62Show/hide
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        ME S  ++E      ++L+PSP    +N S   SS+S   +     PPT P   +        TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K 
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         S+ KP  T  Q     + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  L+INPL PVF   NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPD
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein4.1e-6257.25Show/hide
Query:  METSSNHQENSSPSPSSLLPSPSSRITNTSSCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPPQLHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ
        ME S  ++E      ++L+PSP    +N S   SS+S   +     PPT P   +        TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K 
Subjt:  METSSNHQENSSPSPSSLLPSPSSRITNTSSCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPPQLHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ

Query:  ASA-KPAATASQNS--ESVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLRINPLIPVFGSCNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPD
         S+ KP  T  Q     + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  L+INPL PVF   NS FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPD
Subjt:  ASA-KPAATASQNS--ESVSKSHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLRINPLIPVFGSCNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPD

Query:  PFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        PFDRSG +N        +  +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  PFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein2.2e-3146.7Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLRINPLIPVFGSCNS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+           T   +        IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP        +S
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLRINPLIPVFGSCNS

Query:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSS
        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P  S
Subjt:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein7.8e-3747.54Show/hide
Query:  TNTSSCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPPQLHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKS
        +++SS SSS  NG               LH H    ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P  T S     V    IPPIK+
Subjt:  TNTSSCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPPQLHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKS

Query:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLRINPLIPVFGSCNS-GFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA
           ++ SG KLYERR       N  N L IN L+   G   S  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+              
Subjt:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLRINPLIPVFGSCNS-GFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA

Query:  KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
              EE+ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein3.4e-3245.2Show/hide
Query:  SCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPP-QLHLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKSLP
        S SS +S   Q+  PPP    P  Q  + SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           A +   N+   S   IPPIK   
Subjt:  SCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPP-QLHLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATASQNSESVSKSHIPPIKSLP

Query:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLRI-NPLIPVFGSCNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC
          + + FKLYERR +           +N LR+ N    +F   NS       FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S     
Subjt:  RRQQSGFKLYERRNS-----------LNKLRI-NPLIPVFGSCNSG------FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLANC

Query:  SYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  SYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCGAATCACCAAGAAAACTCAAGCCCCAGCCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCTCCCAGTAGCCGCATCACCAACACCAGTAGCTGCAGTAGCAGCACCAG
CAATGGAGTCCAGCTCATGCCTCCACCGCCCCCAACGCCGCCGCCGCCTCAATTGCACTTGCACTCTCCAAAACCCATCACTCGATCCGAGTCCGTAAATCCCTATCCCA
CTACCTTCGTCCAAGCTGATACCTCCTCCTTCAAACAGGTAGTGCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCCGCCAAGCCCGCCGCCACCGCCTCT
CAAAACTCTGAATCCGTCTCCAAATCCCACATTCCCCCCATTAAATCTCTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGGTTCAAGCTTTACGAGCGCAGGAACTCTTTGAATAAACT
TAGGATTAACCCCTTGATTCCTGTTTTTGGTTCCTGTAATTCCGGCTTCTCTCCGAGAAAACCTGAAATTCTTTCCCCGAGTATTCTAGATTTCCCGGCGCTCGCTCTCA
GTCCGGTCACGCCGCTCATCCCCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCGAAGTTGGACGCCGAGGCGGAAGAGAAAGCA
ATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACTACCACCCCCCGGGACTCTGAGCCCCGGCTCTTGCCTCTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTGCCAGGTTC
TTCTTCCACTTCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACCTCTTCGAATCACCAAGAAAACTCAAGCCCCAGCCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCTCCCAGTAGCCGCATCACCAACACCAGTAGCTGCAGTAGCAGCACCAG
CAATGGAGTCCAGCTCATGCCTCCACCGCCCCCAACGCCGCCGCCGCCTCAATTGCACTTGCACTCTCCAAAACCCATCACTCGATCCGAGTCCGTAAATCCCTATCCCA
CTACCTTCGTCCAAGCTGATACCTCCTCCTTCAAACAGGTAGTGCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCCGCCAAGCCCGCCGCCACCGCCTCT
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TAGGATTAACCCCTTGATTCCTGTTTTTGGTTCCTGTAATTCCGGCTTCTCTCCGAGAAAACCTGAAATTCTTTCCCCGAGTATTCTAGATTTCCCGGCGCTCGCTCTCA
GTCCGGTCACGCCGCTCATCCCCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCGAAGTTGGACGCCGAGGCGGAAGAGAAAGCA
ATTAAAGAAAAGGGGTTTTACTTGCATCCATCGCCGACTACCACCCCCCGGGACTCTGAGCCCCGGCTCTTGCCTCTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTGCCAGGTTC
TTCTTCCACTTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSNHQENSSPSPSSLLPSPSSRITNTSSCSSSTSNGVQLMPPPPPTPPPPQLHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPAATAS
QNSESVSKSHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLRINPLIPVFGSCNSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKA
IKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSTS