; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013644 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013644
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold1457:86783..86959
RNA-Seq ExpressionMS013644
SyntenyMS013644
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA8518721.1 hypothetical protein F0562_016505 [Nyssa sinensis]3.3e-0967.8Show/hide
Query:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPSTATTAKCPSFTSFGT-ALVSTSSSKP
        NPYSS+ACSN++KN G V+  N  TN FGS P TA TAKCPSFTS GT A  S+SSSKP
Subjt:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPSTATTAKCPSFTSFGT-ALVSTSSSKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0V0GH00 Putative ovule protein (Fragment)1.2e-0461.22Show/hide
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        NPYSS+AC N+ KN G V+Q + T N FGSS   T   AKCPS TSFGT
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A0A0V0GK16 Putative ovule protein (Fragment)2.4e-0563.27Show/hide
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        NPYSS+AC N+ KN G V+Q + T N FGSS   T  TAKCPS TSFGT
Subjt:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPS-TATTAKCPSFTSFGT

A0A3Q7ILX6 Uncharacterized protein2.0e-0461.22Show/hide
Query:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPS-TATTAKCPSFTSFGT
        NPYSS+AC ++ KN G   Q N T N FGSS   T  TAKCPS TSFGT
Subjt:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPS-TATTAKCPSFTSFGT

A0A5J4ZNS7 Uncharacterized protein1.6e-0967.8Show/hide
Query:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPSTATTAKCPSFTSFGT-ALVSTSSSKP
        NPYSS+ACSN++KN G V+  N  TN FGS P TA TAKCPSFTS GT A  S+SSSKP
Subjt:  NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPSTATTAKCPSFTSFGT-ALVSTSSSKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AACCCATACTCCTCAGCTGCTTGCTCCAACAGCCTCAAAAACATAGGGTGTGTCAAACAACTCAACGGAACCACGAATCGCTTCGGCTCCTCCCCGTCCACCGCCACCAC
CGCGAAATGCCCTTCCTTCACATCCTTCGGCACCGCACTCGTGTCGACATCCTCGTCAAAACCGTTG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACCCATACTCCTCAGCTGCTTGCTCCAACAGCCTCAAAAACATAGGGTGTGTCAAACAACTCAACGGAACCACGAATCGCTTCGGCTCCTCCCCGTCCACCGCCACCAC
CGCGAAATGCCCTTCCTTCACATCCTTCGGCACCGCACTCGTGTCGACATCCTCGTCAAAACCGTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NPYSSAACSNSLKNIGCVKQLNGTTNRFGSSPSTATTAKCPSFTSFGTALVSTSSSKPL