; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013666 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013666
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionexopolygalacturonase clone GBGE184-like
Genome locationscaffold263:3618..4433
RNA-Seq ExpressionMS013666
SyntenyMS013666
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046656.1 exopolygalacturonase clone [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-7570Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDG+H S+++++N+TN+ I TGDDCVSIG G+TNINV N+TC PGHGISVGSLGKY+DEK+V G+ V+NCT+RNTTNG+RIKTWA S P QA++I+FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        I+LD V+NPIIIDQ+YGSK K + PSQVKIS+V +KNIRGTTIS V +SLQCSA +PC+ +KLE+ID++F GS + K  FGNSCLNAKITT+GKQ PPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

XP_008451547.1 PREDICTED: exopolygalacturonase clone GBGE184 [Cucumis melo]1.4e-7570Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDG+H S+++++N+TN+ I TGDDCVSIG G+TNINV N+TC PGHGISVGSLGKY+DEK+V G+ V+NCT+RNTTNG+RIKTWA S P QA++I+FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        I+LD V+NPIIIDQ+YGSK K + PSQVKIS+V +KNIRGTTIS V +SLQCSA +PC+ +KLE+ID++F GS + K  FGNSCLNAKITT+GKQ PPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

XP_022146404.1 exopolygalacturonase-like [Momordica charantia]7.2e-10191.5Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIHTSESNLINITNT+ISTGDDCVSIGQGTTNI+VHNVTCAPGHG+SVGSLGKY+DEKDVMGVT+TNCTLRNTTNGLRIKTWADS PTQASKISFQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKN+RGTTISVVP+SLQCS KVPCEG+KLEEID+SFVGS+KK  AF N+C+NAKITTVGKQIPPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

XP_022153738.1 exopolygalacturonase clone GBGE184-like, partial [Momordica charantia]3.1e-9698.9Show/hide
Query:  ISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPIIIDQSYGSK
        ISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDV+GVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPIIIDQSYGSK
Subjt:  ISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPIIIDQSYGSK

Query:  DKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        DKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVP+SLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
Subjt:  DKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

XP_038899827.1 exopolygalacturonase clone GBGE184 [Benincasa hispida]8.1e-7671.5Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH S+++++NITN+ I TGDDCVSIG G+TNI V NVTC PGHGISVGSLGKY DEK+V G+ V+NCT+RNTTNGLRIKTWA S   QA++I+FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        IILD+V+NPIIIDQ+YGSK K K PSQVKIS+V +KNIRGTT+S V +SLQCSA VPC+G+KLEEID++F G+  K   F NSCLNAKIT +GKQ PPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BRS3 exopolygalacturonase clone GBGE1846.7e-7670Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDG+H S+++++N+TN+ I TGDDCVSIG G+TNINV N+TC PGHGISVGSLGKY+DEK+V G+ V+NCT+RNTTNG+RIKTWA S P QA++I+FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        I+LD V+NPIIIDQ+YGSK K + PSQVKIS+V +KNIRGTTIS V +SLQCSA +PC+ +KLE+ID++F GS + K  FGNSCLNAKITT+GKQ PPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

A0A5A7TXI9 Exopolygalacturonase clone6.7e-7670Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDG+H S+++++N+TN+ I TGDDCVSIG G+TNINV N+TC PGHGISVGSLGKY+DEK+V G+ V+NCT+RNTTNG+RIKTWA S P QA++I+FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        I+LD V+NPIIIDQ+YGSK K + PSQVKIS+V +KNIRGTTIS V +SLQCSA +PC+ +KLE+ID++F GS + K  FGNSCLNAKITT+GKQ PPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

A0A5D3D1R6 Exopolygalacturonase6.7e-7670Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDG+H S+++++N+TN+ I TGDDCVSIG G+TNINV N+TC PGHGISVGSLGKY+DEK+V G+ V+NCT+RNTTNG+RIKTWA S P QA++I+FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        I+LD V+NPIIIDQ+YGSK K + PSQVKIS+V +KNIRGTTIS V +SLQCSA +PC+ +KLE+ID++F GS + K  FGNSCLNAKITT+GKQ PPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

A0A6J1CY21 exopolygalacturonase-like3.5e-10191.5Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIHTSESNLINITNT+ISTGDDCVSIGQGTTNI+VHNVTCAPGHG+SVGSLGKY+DEKDVMGVT+TNCTLRNTTNGLRIKTWADS PTQASKISFQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKN+RGTTISVVP+SLQCS KVPCEG+KLEEID+SFVGS+KK  AF N+C+NAKITTVGKQIPPAC
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

A0A6J1DI97 exopolygalacturonase clone GBGE184-like1.5e-9698.9Show/hide
Query:  ISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPIIIDQSYGSK
        ISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDV+GVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPIIIDQSYGSK
Subjt:  ISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPIIIDQSYGSK

Query:  DKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
        DKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVP+SLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC
Subjt:  DKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P24548 Exopolygalacturonase (Fragment)3.2e-5149.01Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH   S+ +NI NT I TGDDC+S+G G+ NIN+ N+TC PGHGISVGSLG+Y++E+ V+G+ V NCT+  + NG+RIKTW  S P +AS++ FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDK--SKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP
        I +++V  PI+IDQ Y   ++  ++ PS VK+S++++KNI+GT+ +   + L CS   PC GV+L +ID+++ G   K     + C N K T  GKQIP 
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDK--SKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP

Query:  AC
         C
Subjt:  AC

P49062 Exopolygalacturonase clone GBGE1842.5e-5150Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH S ++ ++I ++ I+TGDDCVS+G+G+ N+ V  V C PGHG+SVGSLGKY++E+DV G+ V NCT+  T NGLRIKTW  S P++A  I F++
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFV---GSEKKKAA---FGNSCLNAKITTVGK
        II+ +VKNPIIIDQ+YGS+      SQV IS++ +KNIRGTTI+   + + CS  VPC+GV + ++++ +V   G EKK ++    G  C NA +   GK
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFV---GSEKKKAA---FGNSCLNAKITTVGK

Query:  QIPPAC
           P C
Subjt:  QIPPAC

P49063 Exopolygalacturonase clone GBGA4831.1e-4649.01Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH   SN +N+    I TGDDCVSIG GT N+ V NV C PGHGIS+GSLG+Y +E+ V GVTV  C ++NT NG+RIKTW  S P  AS I F+D
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP
        I +D V  P++IDQ Y      K+  PSQVK+S+V  K I+GT+ + V + L CS  VPC  + L +I++   G E       ++C N K    GK +P 
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP

Query:  AC
        AC
Subjt:  AC

Q05967 Polygalacturonase1.9e-4850Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH S S+ +NIT++  STGDDC+S+G  T  + +  VTC PGHGISVGSLG   DEK V+GV V NCT  NT NG+RIKTW  S P   + + F+D
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKP--PSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP
        II+  V NP++IDQ Y   +K     PSQVKIS+V+++NI+GT+ +   +SL  S  VPCEG+++ +ID+++ G   K+    +SC N K +  GKQ PP
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKP--PSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP

Query:  AC
         C
Subjt:  AC

Q6H9K0 Exopolygalacturonase (Fragment)9.6e-4845.73Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH   S  + ITNT I+TGDDC+SIG G+ N+ +  V C PGHGIS+GSLG+Y +EK+V G+TV  CT   T NG+R+KTW +S P  A+ ++FQD
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIP
        + ++ V+NP+I+DQ Y    +   + PS++K+S +N+ NIRGT+   V + + CS  +PC  +K+ EI++S+ G+        ++C N K T  GKQ+P
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02790.1 polygalacturonase 41.7e-5250Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH S ++ ++I ++ I+TGDDCVS+G+G+ N+ V  V C PGHG+SVGSLGKY++E+DV G+ V NCT+  T NGLRIKTW  S P++A  I F++
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFV---GSEKKKAA---FGNSCLNAKITTVGK
        II+ +VKNPIIIDQ+YGS+      SQV IS++ +KNIRGTTI+   + + CS  VPC+GV + ++++ +V   G EKK ++    G  C NA +   GK
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFV---GSEKKKAA---FGNSCLNAKITTVGK

Query:  QIPPAC
           P C
Subjt:  QIPPAC

AT3G07820.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.9e-4647.78Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSR-PTQASKISFQ
        NTDGIH   S+ + I N++ISTGDDC+S+G G  N++V  VTC PGHGISVGSLG+Y  E+DV G+ V NCTL+ T NGLRIKTW  +   T AS I F+
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSR-PTQASKISFQ

Query:  DIILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIP
        DIIL  V NPI+IDQ Y   ++   +  S +K+  +++KNIRGT+ +   + L CS   PC+ V++ +ID+ + G++   A F   C N     +G Q P
Subjt:  DIILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIP

Query:  PAC
         AC
Subjt:  PAC

AT3G07850.1 Pectin lyase-like superfamily protein7.6e-4849.01Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH   SN +N+    I TGDDCVSIG GT N+ V NV C PGHGIS+GSLG+Y +E+ V GVTV  C ++NT NG+RIKTW  S P  AS I F+D
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP
        I +D V  P++IDQ Y      K+  PSQVK+S+V  K I+GT+ + V + L CS  VPC  + L +I++   G E       ++C N K    GK +P 
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP

Query:  AC
        AC
Subjt:  AC

AT3G14040.1 Pectin lyase-like superfamily protein4.4e-4849.01Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD
        NTDGIH   SN +N+    I TGDDCVSIG GT N+ V NV C PGHGIS+GSLG+Y +E+ V GVTV  C ++NT NG+RIKTW  S P  AS I F+D
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQD

Query:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP
        I +D V  P++IDQ Y      K+  PS+VK+S+V  KNI+GT+ + V + L CS  VPC  + L +I++   G E       ++C N K    GK +P 
Subjt:  IILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPP

Query:  AC
        AC
Subjt:  AC

AT4G18180.1 Pectin lyase-like superfamily protein5.2e-4948.34Show/hide
Query:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRP-TQASKISFQ
        NTDGIH   S+ +  + ++I+TGDDCVSIGQG + I + ++ C PGHGISVGSLG+Y +EKDV G+ V +C +  TTNG+RIKTWA+S   + A+ ++F+
Subjt:  NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRP-TQASKISFQ

Query:  DIILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDM---SFVGSEKKKAAFGN-----SCLNAKI
        +II++ V NPIIIDQSY   S   S  PS+V++SE+ +KNIRGT+ S+V + L CS  +PC+ V LE + +   S  G  K+ +  GN     SC N + 
Subjt:  DIILDAVKNPIIIDQSY--GSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDM---SFVGSEKKKAAFGN-----SCLNAKI

Query:  TTVGKQIPPAC
          +G QIPP C
Subjt:  TTVGKQIPPAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AACACAGATGGAATTCACACGAGCGAATCTAATCTTATCAATATAACAAACACCTACATTAGCACTGGAGATGACTGTGTTTCCATTGGCCAAGGCACCACCAATATCAA
CGTTCACAATGTCACCTGTGCCCCAGGACATGGAATCAGTGTGGGAAGTTTAGGAAAATACCAAGATGAGAAGGACGTCATGGGAGTTACTGTCACAAATTGCACATTGA
GAAACACCACAAATGGATTAAGAATCAAGACATGGGCTGATTCACGTCCAACCCAAGCTTCCAAAATCAGTTTCCAAGACATTATCTTAGATGCAGTAAAAAACCCCATT
ATCATAGATCAAAGTTATGGTTCCAAAGATAAGAGCAAACCCCCATCTCAAGTGAAGATAAGCGAGGTCAATTACAAGAACATTCGAGGCACGACGATTTCGGTTGTCCC
CATTTCGTTACAGTGTAGTGCTAAAGTTCCATGCGAGGGCGTCAAATTGGAAGAGATTGATATGTCCTTTGTTGGCTCAGAGAAGAAGAAGGCAGCTTTTGGAAATTCAT
GTTTGAATGCCAAGATTACAACCGTAGGAAAACAAATCCCACCAGCTTGT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACACAGATGGAATTCACACGAGCGAATCTAATCTTATCAATATAACAAACACCTACATTAGCACTGGAGATGACTGTGTTTCCATTGGCCAAGGCACCACCAATATCAA
CGTTCACAATGTCACCTGTGCCCCAGGACATGGAATCAGTGTGGGAAGTTTAGGAAAATACCAAGATGAGAAGGACGTCATGGGAGTTACTGTCACAAATTGCACATTGA
GAAACACCACAAATGGATTAAGAATCAAGACATGGGCTGATTCACGTCCAACCCAAGCTTCCAAAATCAGTTTCCAAGACATTATCTTAGATGCAGTAAAAAACCCCATT
ATCATAGATCAAAGTTATGGTTCCAAAGATAAGAGCAAACCCCCATCTCAAGTGAAGATAAGCGAGGTCAATTACAAGAACATTCGAGGCACGACGATTTCGGTTGTCCC
CATTTCGTTACAGTGTAGTGCTAAAGTTCCATGCGAGGGCGTCAAATTGGAAGAGATTGATATGTCCTTTGTTGGCTCAGAGAAGAAGAAGGCAGCTTTTGGAAATTCAT
GTTTGAATGCCAAGATTACAACCGTAGGAAAACAAATCCCACCAGCTTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NTDGIHTSESNLINITNTYISTGDDCVSIGQGTTNINVHNVTCAPGHGISVGSLGKYQDEKDVMGVTVTNCTLRNTTNGLRIKTWADSRPTQASKISFQDIILDAVKNPI
IIDQSYGSKDKSKPPSQVKISEVNYKNIRGTTISVVPISLQCSAKVPCEGVKLEEIDMSFVGSEKKKAAFGNSCLNAKITTVGKQIPPAC