; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS013713 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS013713
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationscaffold263:379913..380320
RNA-Seq ExpressionMS013713
SyntenyMS013713
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-4578.81Show/hide
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XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]3.6e-4377.12Show/hide
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XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]2.7e-59100Show/hide
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XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]1.0e-4579.66Show/hide
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XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]6.7e-5085.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein1.7e-4377.12Show/hide
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A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like6.6e-4377.12Show/hide
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A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like6.6e-4377.12Show/hide
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A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 331.3e-59100Show/hide
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A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like4.9e-4679.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 333.4e-2860.91Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor4.9e-2755.86Show/hide
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        L  C++     +S  A  A  + +  WV+   +   C GS+ EC+ +E E+E++SE NRRILAT  YISY AL+ N+VPCSRRGASYYNC+PGA+ANPY 
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 234.3e-2351.64Show/hide
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        I  IL V + +V A S++S  +  D       C G++AEC +                   E+EM+SEINRRILAT  YISY AL+ NT+PCSRRGASYY
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.0e-2455.24Show/hide
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        L   I  V ST  F  S +          + C GS+AEC+ +E E E +S+I+RRILA   YISY A++ N+VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RGCS 
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        ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.4e-2659.63Show/hide
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        I  +  +SS  V   FA      +W   G   + CHGS+AEC+  E E EM+SEINRRILAT+ YISY++LK N+VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.0e-2759.63Show/hide
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        CS I RCRS
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AT2G33775.1 ralf-like 193.0e-1648.08Show/hide
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        I  IL + + AV A S  + +W L  +     G + E    E++Y M+SE NRR LA   +YISY AL+ N VPCSRRG SYY+C+    ANPY RGCS 
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        IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 222.1e-2555.24Show/hide
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        L   I  V ST  F  S +          + C GS+AEC+ +E E E +S+I+RRILA   YISY A++ N+VPCSRRGASYYNCQ GA+ANPY RGCS 
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        ITRCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.0e-2451.64Show/hide
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        I  IL V + +V A S++S  +  D       C G++AEC +                   E+EM+SEINRRILAT  YISY AL+ NT+PCSRRGASYY
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        NC+ GA+ANPY RGCSAITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 332.4e-2960.91Show/hide
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        P  +I AILTV    +FA  T   S       ++C+G++AEC +   E E+EM+SEINRRILAT+ YISY AL+ NTVPCSRRGASYYNC+ GA+ANPY 
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        RGCSAITRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAGATTAAAGAAGTGGATTGTATAGACATACCAGGGAGAGCAGAGAGAGCAACAATGGCGGCCAAGGTTTCCTTTCTCCTTCCATTTTGCTTAATCACTGCAATCCTGAC
TGTCTCCTCCACTGCAGTATTCGCACCCAGCACCGAGAGCCCGAGCTGGGTCCTGGATGGAGCTCGAGCTCGTTGTCACGGCTCCATGGCAGAATGCATGATGGATGAAA
TTGAATACGAAATGAACTCTGAGATCAATAGACGTATATTGGCAACTTCAAACTACATAAGCTACGAAGCGCTCAAGGCCAACACGGTGCCATGCTCGCGCAGGGGAGCT
TCTTACTACAATTGCCAGCCAGGTGCCGAGGCGAACCCCTACGACCGTGGCTGCAGTGCTATTACTCGTTGCCGAAGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGATTAAAGAAGTGGATTGTATAGACATACCAGGGAGAGCAGAGAGAGCAACAATGGCGGCCAAGGTTTCCTTTCTCCTTCCATTTTGCTTAATCACTGCAATCCTGAC
TGTCTCCTCCACTGCAGTATTCGCACCCAGCACCGAGAGCCCGAGCTGGGTCCTGGATGGAGCTCGAGCTCGTTGTCACGGCTCCATGGCAGAATGCATGATGGATGAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
KIKEVDCIDIPGRAERATMAAKVSFLLPFCLITAILTVSSTAVFAPSTESPSWVLDGARARCHGSMAECMMDEIEYEMNSEINRRILATSNYISYEALKANTVPCSRRGA
SYYNCQPGAEANPYDRGCSAITRCRS