; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS014033 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS014033
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionmultiprotein-bridging factor 1b-like
Genome locationscaffold5:117726..119388
RNA-Seq ExpressionMS014033
SyntenyMS014033
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149278.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucumis sativus]5.6e-6396.48Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_008448251.1 PREDICTED: multiprotein-bridging factor 1b [Cucumis melo]2.5e-6397.18Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022149711.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Momordica charantia]5.9e-65100Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_022943574.1 multiprotein-bridging factor 1b [Cucurbita moschata]1.2e-6295.07Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

XP_023533868.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.5e-6397.18Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGI PLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGV6 HTH cro/C1-type domain-containing protein2.7e-6396.48Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST+LNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A1S3BIN6 multiprotein-bridging factor 1b1.2e-6397.18Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A5A7V8Z5 Multiprotein-bridging factor 1b1.2e-6397.18Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIM ARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1D976 multiprotein-bridging factor 1b-like2.9e-65100Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

A0A6J1JEZ7 multiprotein-bridging factor 1b6.0e-6395.07Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGPL+QDWEPVV+RKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET+KKS AGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENL+HDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3T0V7 Endothelial differentiation-related factor 11.9e-2958.65Show/hide
Query:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V VLRKK P AA  K ++A+ AA+R G ++ET KK AAG NK    S + NT KLD ETE L HDRV  E+ K I Q R  K LTQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI DYE+G+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.4e-2958.65Show/hide
Query:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V VLRKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK AAG NK      + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI DYE+G+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.4e-2957.89Show/hide
Query:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V VLRKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK    + + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        PQVI DYE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b1.5e-5883.8Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVV+RK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AGSNK+ASS TSLNT+KLD++TENLSHDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a2.3e-5680.28Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVV+RKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AG+NK+ASS TSLNT+ LD++TENL+H+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A1.7e-5780.28Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVV+RKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AG+NK+ASS TSLNT+ LD++TENL+H+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C1.3e-3051.8Show/hide
Query:  GPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVVL K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE  + DRV  E++  I +AR EKK++Q+ LA
Subjt:  GPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK
        + INE+ QV+Q+YE GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C3.1e-1146.07Show/hide
Query:  GPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQAR
        G ++QDWEPVVL K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK  AGSNK   S+    +NT+KL+EETE  + DRV  E++  + + R
Subjt:  GPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSST--SLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B1.0e-5983.8Show/hide
Query:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ
        MAGIGP++QDWEPVV+RK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K  AGSNK+ASS TSLNT+KLD++TENLSHDRVPTELKKAIMQAR EKKLTQSQ
Subjt:  MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK
        LA LINEKPQVIQ+YE+GKAIPNQQI++KLERALGAKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGAATCGGACCACTTTCACAGGATTGGGAACCGGTGGTCCTCAGGAAGAAGGCACCCAACGCGGCTGCCAAGAAGGATGAGAAAGCCGTCAATGCAGCGCGGCG
AGCCGGGGCGGAGATTGAGACTATAAAGAAATCTGCTGCTGGGTCAAACAAATCTGCCTCTAGCAGTACTAGTTTGAACACTAGGAAGCTTGACGAAGAGACTGAGAACC
TTTCTCATGATCGTGTACCAACTGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCAAGCTCGAACAGAGAAGAAGCTCACCCAGTCTCAGCTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAA
GTAATCCAAGACTACGAGGCTGGAAAAGCTATTCCAAATCAACAGATAATAACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGGGCAAAACTGCGTGGGAAGAAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGAATCGGACCACTTTCACAGGATTGGGAACCGGTGGTCCTCAGGAAGAAGGCACCCAACGCGGCTGCCAAGAAGGATGAGAAAGCCGTCAATGCAGCGCGGCG
AGCCGGGGCGGAGATTGAGACTATAAAGAAATCTGCTGCTGGGTCAAACAAATCTGCCTCTAGCAGTACTAGTTTGAACACTAGGAAGCTTGACGAAGAGACTGAGAACC
TTTCTCATGATCGTGTACCAACTGAGCTGAAGAAAGCAATTATGCAAGCTCGAACAGAGAAGAAGCTCACCCAGTCTCAGCTTGCTCAACTTATTAATGAGAAGCCTCAA
GTAATCCAAGACTACGAGGCTGGAAAAGCTATTCCAAATCAACAGATAATAACCAAACTTGAGAGAGCTCTTGGGGCAAAACTGCGTGGGAAGAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGIGPLSQDWEPVVLRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETIKKSAAGSNKSASSSTSLNTRKLDEETENLSHDRVPTELKKAIMQARTEKKLTQSQLAQLINEKPQ
VIQDYEAGKAIPNQQIITKLERALGAKLRGKK