; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS014236 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS014236
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A2B
Genome locationscaffold5:1574816..1576640
RNA-Seq ExpressionMS014236
SyntenyMS014236
Gene Ontology termsGO:0006468 - protein phosphorylation (biological process)
GO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0004672 - protein kinase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR025662 - Sigma-54 interaction domain, ATP-binding site 1
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605436.1 Ras-related protein Rab11C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-11194.95Show/hide
Query:  AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPT
        AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVK+QIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR T
Subjt:  AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPT

Query:  FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTT
        FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTT
Subjt:  FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTT

Query:  INVSDASGDSNKRGCCST
        INV++ SGDSN+RGCCS+
Subjt:  INVSDASGDSNKRGCCST

KAG7035384.1 Ras-related protein Rab11C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.8e-11194.95Show/hide
Query:  AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPT
        AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVK+QIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR T
Subjt:  AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPT

Query:  FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTT
        FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTT
Subjt:  FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTT

Query:  INVSDASGDSNKRGCCST
        INV++ SGDSN+RGCCS+
Subjt:  INVSDASGDSNKRGCCST

XP_022148474.1 ras-related protein Rab11C [Momordica charantia]1.1e-115100Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NVSDASGDSNKRGCCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

XP_022946941.1 ras-related protein Rab11C [Cucurbita moschata]1.4e-11094.93Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQE+AASV HPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NV++ SGDSN+RGCCS+
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

XP_023532299.1 ras-related protein Rab11C [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.4e-11195.39Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NV++ SGDSN+RGCCS+
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V7L9 Ras-related protein Rab2BV4.5e-11094.01Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        +NVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDL+HLRSVSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+ HPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NVSD SGDSN+RGCCS+
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

A0A5D3CU43 Ras-related protein Rab2BV1.2e-11094.04Show/hide
Query:  AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPT
        AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFST+TL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR T
Subjt:  AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPT

Query:  FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTT
        F+NVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDL+HLRSVSEDDGQ MAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAAS+ HPGQGTT
Subjt:  FDNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTT

Query:  INVSDASGDSNKRGCCST
        INVSD SGDSN+RGCCS+
Subjt:  INVSDASGDSNKRGCCST

A0A6J1D439 ras-related protein Rab11C5.5e-116100Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NVSDASGDSNKRGCCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

A0A6J1G4Z7 ras-related protein Rab11C6.9e-11194.93Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAFQTILTEIYHIISKKALAAQE+AASV HPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NV++ SGDSN+RGCCS+
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

A0A6J1L4I1 ras-related protein Rab11C1.2e-11094.93Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVIVM+GNKSDLNHLR+VSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNI+KAF TILTEIYHIISKKALAAQEAAASV HPGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NV++ SGDSN+RGCCS+
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q39434 Ras-related protein Rab2BV5.7e-10287.1Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MA++VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDL HLR+VSE+DGQA+AEKEGLSF+ETSAL+A NIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEA++++  PGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NV+DAS  + +R CCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

Q40193 Ras-related protein Rab11C1.9e-10588.48Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAH+VDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLR+VSEDDG A++EKEGLSF+ETSAL+ATNIEKAFQTILTEIYHI+SKKALAAQEA A    PGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NV+D SG++ K+GCCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

Q40523 Ras-related protein Rab11A5.3e-10084.79Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MA++VDHEYDYLFK+VLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALL YD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        DNVQRWLRELRDH DSNIVI++ GNKSDL HLR+VSE D QA+ +KEGLSF+ETSAL+A N++KAFQTILT+IYHIISKKALAAQEAAAS   PGQGTTI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        NVSD S +  KRGCCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

Q9FIF9 Ras-related protein RABA2d4.1e-10084.86Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAH+V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTT
        DNV RWLRELRDHADSNIVI+M GNK+DLNHLRSV+E+DGQ +AE EGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQT+L EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTT
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTT

Query:  INVSDASGDSNKRGCCST
        INV D SG + KRGCCST
Subjt:  INVSDASGDSNKRGCCST

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b8.2e-10184.79Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MA+++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        +NV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+++DG+++AEKEGLSF+ETSAL+ATNIEKAFQTIL+EIYHIISKKALAAQEAA ++  PGQGT I
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        N+SD+S  +N++GCCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B5.8e-10284.79Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MA+++DHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        +NV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+++DG+++AEKEGLSF+ETSAL+ATNIEKAFQTIL+EIYHIISKKALAAQEAA ++  PGQGT I
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        N+SD+S  +N++GCCST
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C2.0e-8671.89Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MA + D EYDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI
        +NV RWL+ELRDHADSNIVI+++GNK+DL HLR+V+ +D Q+ AEKEGLSFIETSAL+A N+EKAFQTIL+E+Y IISKK++++ +  A+  +  +G TI
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTI

Query:  NVSDASGDSNKRGCCST
        +V+  S  + K+ CCS+
Subjt:  NVSDASGDSNKRGCCST

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C4.9e-10185.32Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        M H+VD EYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRT +VEGKT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTT
        DNV RWLRELRDHADSNIVI+M GNKSDLNHLRSV+E+DGQ++AEKEGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQTIL EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTT
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTT

Query:  INVSDASGDSNKRGCCST
        INV D SG + KR CCS+
Subjt:  INVSDASGDSNKRGCCST

AT4G18800.1 RAB GTPase homolog A1D1.7e-7765.42Show/hide
Query:  HKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDN
        ++ D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEF LESKSTIGVEF+TR+L V  K +KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+T+  TF+N
Subjt:  HKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDN

Query:  VQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINV
        V+RWLRELRDH D NIV+++VGNKSDL HL +V  +D ++ AE E L F+ETSAL++TN+E AF  +LT+IYH++SKKA+ A E + +V   G+   ++V
Subjt:  VQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINV

Query:  SDASGDSNKRGCCS
        S       K GCCS
Subjt:  SDASGDSNKRGCCS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D2.9e-10184.86Show/hide
Query:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF
        MAH+V+ +YDYLFKIVLIGDSGVGK+NILSRFTRNEFCLESKSTIGVEF+TRTL+VEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TKR TF
Subjt:  MAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTF

Query:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTT
        DNV RWLRELRDHADSNIVI+M GNK+DLNHLRSV+E+DGQ +AE EGLSF+ETSAL+ATN+EKAFQT+L EIYHIISKKALAAQE AAA+   PGQGTT
Subjt:  DNVQRWLRELRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQE-AAASVGHPGQGTT

Query:  INVSDASGDSNKRGCCST
        INV D SG + KRGCCST
Subjt:  INVSDASGDSNKRGCCST


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GCCATGGCTCACAAGGTGGACCACGAGTACGACTATTTGTTCAAGATTGTCCTGATCGGGGATTCCGGCGTCGGCAAGTCCAACATTCTTTCTAGATTTACCAGAAATGA
GTTCTGCTTGGAGTCCAAATCCACCATTGGCGTTGAGTTCTCTACCAGGACTCTCGAGGTAGAAGGAAAGACAGTAAAGGCACAGATCTGGGACACAGCAGGTCAGGAGC
GATACCGTGCGATTACTAGTGCTTATTATAGGGGAGCTGTTGGTGCTCTTCTTGTTTATGATCTCACGAAGAGACCGACTTTCGACAACGTGCAAAGGTGGCTCCGGGAA
CTGAGAGATCATGCAGATTCCAACATTGTGATTGTGATGGTTGGAAACAAGTCTGACCTAAATCATCTTAGATCGGTCTCGGAGGATGATGGGCAGGCCATGGCTGAGAA
GGAAGGCCTATCATTTATCGAGACGTCAGCCCTGGATGCTACTAATATCGAGAAGGCGTTCCAAACCATCTTGACAGAGATCTACCACATCATCAGCAAAAAGGCATTGG
CTGCCCAGGAGGCAGCTGCGAGCGTGGGCCATCCCGGTCAGGGAACCACCATCAACGTTTCGGATGCTTCTGGGGACTCGAACAAAAGAGGTTGCTGTTCTACT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCATGGCTCACAAGGTGGACCACGAGTACGACTATTTGTTCAAGATTGTCCTGATCGGGGATTCCGGCGTCGGCAAGTCCAACATTCTTTCTAGATTTACCAGAAATGA
GTTCTGCTTGGAGTCCAAATCCACCATTGGCGTTGAGTTCTCTACCAGGACTCTCGAGGTAGAAGGAAAGACAGTAAAGGCACAGATCTGGGACACAGCAGGTCAGGAGC
GATACCGTGCGATTACTAGTGCTTATTATAGGGGAGCTGTTGGTGCTCTTCTTGTTTATGATCTCACGAAGAGACCGACTTTCGACAACGTGCAAAGGTGGCTCCGGGAA
CTGAGAGATCATGCAGATTCCAACATTGTGATTGTGATGGTTGGAAACAAGTCTGACCTAAATCATCTTAGATCGGTCTCGGAGGATGATGGGCAGGCCATGGCTGAGAA
GGAAGGCCTATCATTTATCGAGACGTCAGCCCTGGATGCTACTAATATCGAGAAGGCGTTCCAAACCATCTTGACAGAGATCTACCACATCATCAGCAAAAAGGCATTGG
CTGCCCAGGAGGCAGCTGCGAGCGTGGGCCATCCCGGTCAGGGAACCACCATCAACGTTTCGGATGCTTCTGGGGACTCGAACAAAAGAGGTTGCTGTTCTACT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
AMAHKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFSTRTLEVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDLTKRPTFDNVQRWLRE
LRDHADSNIVIVMVGNKSDLNHLRSVSEDDGQAMAEKEGLSFIETSALDATNIEKAFQTILTEIYHIISKKALAAQEAAASVGHPGQGTTINVSDASGDSNKRGCCST