; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS014249 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS014249
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationscaffold5:1634708..1635871
RNA-Seq ExpressionMS014249
SyntenyMS014249
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0030001 - metal ion transport (biological process)
GO:0055085 - transmembrane transport (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0016874 - ligase activity (molecular function)
GO:0046873 - metal ion transmembrane transporter activity (molecular function)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000253 - Forkhead-associated (FHA) domain
IPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR010543 - Domain of unknown function DUF1117
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646961.1 hypothetical protein Csa_020907 [Cucumis sativus]2.8e-19791.03Show/hide
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XP_004143127.2 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1, partial [Cucumis sativus]2.4e-20190.98Show/hide
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XP_008464108.1 PREDICTED: E3 ubiquitin-protein ligase RING1 [Cucumis melo]2.8e-19791.29Show/hide
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XP_023532253.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.7e-19590.79Show/hide
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XP_038902866.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1 [Benincasa hispida]6.1e-19791.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE74 RING-type E3 ubiquitin transferase5.8e-20190.46Show/hide
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        LRGSAD GDV  GGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEI ESHVD DSHCAVCKEA
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A0A1S3CKQ2 RING-type E3 ubiquitin transferase1.3e-19791.29Show/hide
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A0A5A7V7N5 RING-type E3 ubiquitin transferase1.3e-19791.29Show/hide
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A0A6J1G610 RING-type E3 ubiquitin transferase3.6e-19590.79Show/hide
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        WASRR+RGRE+RGIGRTFRNIFSFFGRLRS NSSSS ASNE+ESVSRSHS S SSSVF RYLRR NR W +EN +ENGRW
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A0A6J1L6T2 RING-type E3 ubiquitin transferase6.8e-19490.26Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQSAFNPVVVLRGSADGGD
        M+SGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTI+CPYCDGGFVEAIETAS+L  AN HRRFSP+AIHTLDQDPFQSPRL+TRRSRRR GD+S FNPVVVLRGSADGGD
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          G GGE NSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEI ESHVD DSHCAVCKEAF IGTEAR
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        EMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGV+DRV DEETVGLTIWRLPGGGFAVGRF+GGRL GERDPPAVYTEMDGGFNANG PRRVS
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Query:  WASRRNRGRESRGIGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVFGRYLRRQNRAWVVENQSENGRW
        WASRR+RGRE+RGIGRTFRNIFSFFGRLRS NSSSS ASNE+ESVSRSHS S SSSVF RYLRR NR W +EN +ENGRW
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A1.3e-8046.48Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPAN--------PHR---RFSP------TAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQ
        M+SG  SYWCY C+RFV  WV D+I+CP CDGGF+E I+     +P++         HR   RF P      T   ++  D   +P + TR    R    
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Query:  SAFNPVVVLRGSA---DGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISES
         + NPV+VLRGSA       V  G +R++F +YYDDG  SGLRP+P +M+EFL+G+GFDRLL+Q++Q+E+N        E+PPASK+A+E++P IEI  +
Subjt:  SAFNPVVVLRGSA---DGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISES

Query:  HV--DLDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVA----DRVADEE---TVGLTIWRLPGGGFAVGRFS
        H+  D  SHCAVCKE F + + AREMPC HIYH DCI+PWL++RNSCPVCRHELP+E ++   G A       A+EE     GLTIWRLPGGGFAVGR  
Subjt:  HV--DLDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVA----DRVADEE---TVGLTIWRLPGGGFAVGRFS

Query:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRRNRGRESRG--------IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVF
        GG   G+R  P VYTE+DGG       PRRV+W SRR  GR+  G         GR  R +F  F       +++++AS+ S S  R    + S S+F
Subjt:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRRNRGRESRG--------IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVF

P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING13.7e-3534.63Show/hide
Query:  YWCYRCNRFVRAWV---QDTITCPYCDGGFVEAIET-----ASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPF---------QSPRLTTRRS--------------
        ++CY+CNR V   +       TCP C+ GF+E  +       S     NP+         TL  DPF          S   TT  S              
Subjt:  YWCYRCNRFVRAWV---QDTITCPYCDGGFVEAIET-----ASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPF---------QSPRLTTRRS--------------

Query:  RRRFGDQSAFNPVVVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISE
        R   GD  AF+P   ++   +  D+ + G +  F +  ++ +  G R +PA + ++ +G G ++L++QLA+ + N +G    PPASK+A+E++P + I++
Subjt:  RRRFGDQSAFNPVVVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISE

Query:  SHVDLD-SHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSE
        S+++ + + CAVC + FE GTEA++MPCKH+YH DC++PWL + NSCPVCRHELP++
Subjt:  SHVDLD-SHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSE

Q940T5 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF22.5e-8446.84Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAWVQD------TITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRS---RRRFGDQSAFNPVVVLRGS
        TASYWCY C RFV  W         ++ CP+CDGGF+E I  +S  S A      + T + +++ +         RRS   RRR G + +FNPV+VL+G 
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAWVQD------TITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRS---RRRFGDQSAFNPVVVLRGS

Query:  ADGGDVGTGG----ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSHCAVCK
        A   + G  G    +R +F+ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E +  G GRS NPPASK+A+ES+P +EIS+ H+  +++CAVC 
Subjt:  ADGGDVGTGG----ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSHCAVCK

Query:  EAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMDGG-
        E FE  TEAREMPCKH++H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPSE        ++   ++  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+     GER  P V TEMDGG 
Subjt:  EAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMDGG-

Query:  -FNANGAPRRVSWA-SRRNRGRESRGIG----------RTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSN--------SHSSSVFGRYLRR
          N+   PRR+SW  S      +S G G          R  R + S   R+R   SSSSS++  S S      N          S+SV  RY RR
Subjt:  -FNANGAPRRVSWA-SRRNRGRESRGIG----------RTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSN--------SHSSSVFGRYLRR

Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF11.9e-3638.11Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQ--DPFQSPRLTTRRSRRRF-------GDQSAFN--PV
        MSS   ++WC+RC R V    +D + C YC GGFVE I+    + P+  HR         L +    F   RL  R   R         G +S  N  P+
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQ--DPFQSPRLTTRRSRRRF-------GDQSAFN--PV

Query:  VVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHV-DLDSHCAV
        ++  G A       GG+ +S + +  +GA  G+     T   ++  G G + L+EQL+    +G      PPA K++++++PTI+I++ H+   DSHC V
Subjt:  VVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHV-DLDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS
        CK+ FE+ +EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS

Q9SNB6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF11.3e-8546.89Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAWV-QDT---ITCPYCDGGFVEAIE-----TASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQSAFNPVVVLRGS
        T SYWCY C RF+  W  QD    + CPYC+GGF+E IE     T +A+  + P  R       ++         +  RRS RR    ++FNPV+VL G 
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAWV-QDT---ITCPYCDGGFVEAIE-----TASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQSAFNPVVVLRGS

Query:  ADGG-------DVGTGG--ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSH
          GG       + G G   ER +++ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E   NG GRS NPPASK+A+ES+P +EIS+ H   +++
Subjt:  ADGG-------DVGTGG--ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSH

Query:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE
        CAVC E FE G E REMPCKHI+H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPS+ +  +        +E  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+ G   GER  P V TE
Subjt:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE

Query:  MD-GGFNANGAPRRVSWA-------SRRNRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVFGRY
        MD GG  +N  PRR+SW          RN GR   G  + R  R + SF  R+R    SS+S   + +S   +   + S+S+  R+
Subjt:  MD-GGFNANGAPRRVSWA-------SRRNRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVFGRY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39720.1 RING-H2 finger C2A9.1e-8246.48Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPAN--------PHR---RFSP------TAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQ
        M+SG  SYWCY C+RFV  WV D+I+CP CDGGF+E I+     +P++         HR   RF P      T   ++  D   +P + TR    R    
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPAN--------PHR---RFSP------TAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQ

Query:  SAFNPVVVLRGSA---DGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISES
         + NPV+VLRGSA       V  G +R++F +YYDDG  SGLRP+P +M+EFL+G+GFDRLL+Q++Q+E+N        E+PPASK+A+E++P IEI  +
Subjt:  SAFNPVVVLRGSA---DGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN---GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISES

Query:  HV--DLDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVA----DRVADEE---TVGLTIWRLPGGGFAVGRFS
        H+  D  SHCAVCKE F + + AREMPC HIYH DCI+PWL++RNSCPVCRHELP+E ++   G A       A+EE     GLTIWRLPGGGFAVGR  
Subjt:  HV--DLDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVA----DRVADEE---TVGLTIWRLPGGGFAVGRFS

Query:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRRNRGRESRG--------IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVF
        GG   G+R  P VYTE+DGG       PRRV+W SRR  GR+  G         GR  R +F  F       +++++AS+ S S  R    + S S+F
Subjt:  GGRLAGERDPPAVYTEMDGG-FNANGAPRRVSWASRRNRGRESRG--------IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVF

AT3G46620.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein9.4e-8746.89Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAWV-QDT---ITCPYCDGGFVEAIE-----TASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQSAFNPVVVLRGS
        T SYWCY C RF+  W  QD    + CPYC+GGF+E IE     T +A+  + P  R       ++         +  RRS RR    ++FNPV+VL G 
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAWV-QDT---ITCPYCDGGFVEAIE-----TASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQSAFNPVVVLRGS

Query:  ADGG-------DVGTGG--ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSH
          GG       + G G   ER +++ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E   NG GRS NPPASK+A+ES+P +EIS+ H   +++
Subjt:  ADGG-------DVGTGG--ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEI--NGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSH

Query:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE
        CAVC E FE G E REMPCKHI+H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPS+ +  +        +E  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+ G   GER  P V TE
Subjt:  CAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTE

Query:  MD-GGFNANGAPRRVSWA-------SRRNRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVFGRY
        MD GG  +N  PRR+SW          RN GR   G  + R  R + SF  R+R    SS+S   + +S   +   + S+S+  R+
Subjt:  MD-GGFNANGAPRRVSWA-------SRRNRGRESRG--IGRTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVFGRY

AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-3738.11Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQ--DPFQSPRLTTRRSRRRF-------GDQSAFN--PV
        MSS   ++WC+RC R V    +D + C YC GGFVE I+    + P+  HR         L +    F   RL  R   R         G +S  N  P+
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQ--DPFQSPRLTTRRSRRRF-------GDQSAFN--PV

Query:  VVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHV-DLDSHCAV
        ++  G A       GG+ +S + +  +GA  G+     T   ++  G G + L+EQL+    +G      PPA K++++++PTI+I++ H+   DSHC V
Subjt:  VVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHV-DLDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS
        CK+ FE+ +EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS

AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein1.4e-3738.11Show/hide
Query:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQ--DPFQSPRLTTRRSRRRF-------GDQSAFN--PV
        MSS   ++WC+RC R V    +D + C YC GGFVE I+    + P+  HR         L +    F   RL  R   R         G +S  N  P+
Subjt:  MSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQ--DPFQSPRLTTRRSRRRF-------GDQSAFN--PV

Query:  VVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHV-DLDSHCAV
        ++  G A       GG+ +S + +  +GA  G+     T   ++  G G + L+EQL+    +G      PPA K++++++PTI+I++ H+   DSHC V
Subjt:  VVLRGSADGGDVGTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPAT-MSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHV-DLDSHCAV

Query:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS
        CK+ FE+ +EA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVCR ELPS
Subjt:  CKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPS

AT5G59550.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein1.8e-8546.84Show/hide
Query:  TASYWCYRCNRFVRAWVQD------TITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRS---RRRFGDQSAFNPVVVLRGS
        TASYWCY C RFV  W         ++ CP+CDGGF+E I  +S  S A      + T + +++ +         RRS   RRR G + +FNPV+VL+G 
Subjt:  TASYWCYRCNRFVRAWVQD------TITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRS---RRRFGDQSAFNPVVVLRGS

Query:  ADGGDVGTGG----ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSHCAVCK
        A   + G  G    +R +F+ YYDDG+GSGLRP+P ++SE LMG+GF+RLLEQL+Q+E +  G GRS NPPASK+A+ES+P +EIS+ H+  +++CAVC 
Subjt:  ADGGDVGTGG----ERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEIN--GFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSHCAVCK

Query:  EAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMDGG-
        E FE  TEAREMPCKH++H DCI+PWLS+RNSCPVCR ELPSE        ++   ++  VG+TIWRLPGGGFAVGRF+     GER  P V TEMDGG 
Subjt:  EAFEIGTEAREMPCKHIYHSDCIIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMDGG-

Query:  -FNANGAPRRVSWA-SRRNRGRESRGIG----------RTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSN--------SHSSSVFGRYLRR
          N+   PRR+SW  S      +S G G          R  R + S   R+R   SSSSS++  S S      N          S+SV  RY RR
Subjt:  -FNANGAPRRVSWA-SRRNRGRESRGIG----------RTFRNIFSFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSN--------SHSSSVFGRYLRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TTTCTTGTTTCAGTCAGATCTGAGGCGATGTCTTCCGGAACGGCGTCGTATTGGTGTTACCGCTGCAACCGCTTCGTTCGTGCCTGGGTTCAGGACACCATCACTTGCCC
CTACTGTGACGGCGGCTTCGTCGAAGCAATCGAAACTGCCTCTGCCCTCTCGCCGGCGAATCCCCACCGTCGATTCTCGCCGACCGCGATTCACACCTTGGATCAAGATC
CATTTCAGTCGCCTCGCTTGACCACCCGCCGGAGTCGCCGGAGATTTGGGGATCAGTCGGCTTTCAACCCCGTTGTCGTTCTTCGTGGTTCCGCAGACGGTGGCGATGTG
GGCACTGGCGGTGAGAGGAATAGCTTCGATATTTACTACGACGACGGTGCTGGGTCTGGTCTCCGGCCGGTTCCGGCGACCATGTCGGAGTTTCTGATGGGGACCGGATT
CGATCGGCTGTTGGAGCAATTGGCCCAACTGGAAATCAACGGGTTTGGTAGATCTGAAAACCCGCCGGCGTCGAAAGCCGCCGTGGAATCAATGCCGACGATCGAGATTT
CGGAGAGTCACGTGGATTTGGATTCACACTGCGCCGTGTGTAAAGAAGCGTTTGAAATCGGAACAGAGGCCCGAGAAATGCCCTGTAAACACATATACCACTCCGATTGC
ATCATCCCCTGGCTCTCGATGAGAAATTCCTGCCCGGTCTGCCGCCACGAGCTGCCGTCGGAGCGCGTGTCTCCGGCCGGCGGGGTTGCAGATCGGGTTGCGGACGAAGA
AACCGTGGGGTTGACCATCTGGAGGCTGCCCGGCGGTGGGTTCGCCGTCGGACGATTCTCCGGCGGCAGATTGGCCGGCGAGAGAGACCCGCCAGCGGTTTACACCGAAA
TGGACGGCGGATTCAACGCAAACGGAGCTCCGAGGAGAGTGTCGTGGGCGTCAAGAAGAAACAGGGGAAGAGAGAGCCGTGGGATTGGGCGGACATTTCGCAACATTTTT
TCGTTTTTTGGGAGATTGAGATCGGGGAATTCGTCTTCTTCCTCGGCTTCAAATGAATCCGAGTCCGTGAGTAGAAGCCATAGCAATAGCCATTCGAGTTCAGTGTTTGG
CAGATACCTGAGAAGGCAAAACAGAGCTTGGGTAGTGGAGAATCAGAGTGAAAATGGCCGCTGG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTTGTTTCAGTCAGATCTGAGGCGATGTCTTCCGGAACGGCGTCGTATTGGTGTTACCGCTGCAACCGCTTCGTTCGTGCCTGGGTTCAGGACACCATCACTTGCCC
CTACTGTGACGGCGGCTTCGTCGAAGCAATCGAAACTGCCTCTGCCCTCTCGCCGGCGAATCCCCACCGTCGATTCTCGCCGACCGCGATTCACACCTTGGATCAAGATC
CATTTCAGTCGCCTCGCTTGACCACCCGCCGGAGTCGCCGGAGATTTGGGGATCAGTCGGCTTTCAACCCCGTTGTCGTTCTTCGTGGTTCCGCAGACGGTGGCGATGTG
GGCACTGGCGGTGAGAGGAATAGCTTCGATATTTACTACGACGACGGTGCTGGGTCTGGTCTCCGGCCGGTTCCGGCGACCATGTCGGAGTTTCTGATGGGGACCGGATT
CGATCGGCTGTTGGAGCAATTGGCCCAACTGGAAATCAACGGGTTTGGTAGATCTGAAAACCCGCCGGCGTCGAAAGCCGCCGTGGAATCAATGCCGACGATCGAGATTT
CGGAGAGTCACGTGGATTTGGATTCACACTGCGCCGTGTGTAAAGAAGCGTTTGAAATCGGAACAGAGGCCCGAGAAATGCCCTGTAAACACATATACCACTCCGATTGC
ATCATCCCCTGGCTCTCGATGAGAAATTCCTGCCCGGTCTGCCGCCACGAGCTGCCGTCGGAGCGCGTGTCTCCGGCCGGCGGGGTTGCAGATCGGGTTGCGGACGAAGA
AACCGTGGGGTTGACCATCTGGAGGCTGCCCGGCGGTGGGTTCGCCGTCGGACGATTCTCCGGCGGCAGATTGGCCGGCGAGAGAGACCCGCCAGCGGTTTACACCGAAA
TGGACGGCGGATTCAACGCAAACGGAGCTCCGAGGAGAGTGTCGTGGGCGTCAAGAAGAAACAGGGGAAGAGAGAGCCGTGGGATTGGGCGGACATTTCGCAACATTTTT
TCGTTTTTTGGGAGATTGAGATCGGGGAATTCGTCTTCTTCCTCGGCTTCAAATGAATCCGAGTCCGTGAGTAGAAGCCATAGCAATAGCCATTCGAGTTCAGTGTTTGG
CAGATACCTGAGAAGGCAAAACAGAGCTTGGGTAGTGGAGAATCAGAGTGAAAATGGCCGCTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
FLVSVRSEAMSSGTASYWCYRCNRFVRAWVQDTITCPYCDGGFVEAIETASALSPANPHRRFSPTAIHTLDQDPFQSPRLTTRRSRRRFGDQSAFNPVVVLRGSADGGDV
GTGGERNSFDIYYDDGAGSGLRPVPATMSEFLMGTGFDRLLEQLAQLEINGFGRSENPPASKAAVESMPTIEISESHVDLDSHCAVCKEAFEIGTEAREMPCKHIYHSDC
IIPWLSMRNSCPVCRHELPSERVSPAGGVADRVADEETVGLTIWRLPGGGFAVGRFSGGRLAGERDPPAVYTEMDGGFNANGAPRRVSWASRRNRGRESRGIGRTFRNIF
SFFGRLRSGNSSSSSASNESESVSRSHSNSHSSSVFGRYLRRQNRAWVVENQSENGRW