; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS014556 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS014556
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionProtein Ycf2
Genome locationscaffold553:841601..841752
RNA-Seq ExpressionMS014556
SyntenyMS014556
Gene Ontology termsGO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008543 - Uncharacterised protein family Ycf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AXU40388.1 hypothetical chloroplast RF2 [Gomphogyne cissiformis var. villosa]9.2e-1380.77Show/hide
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YP_009468904.1 hypothetical chloroplast RF2 [Gynostemma compressum]9.2e-1380.77Show/hide
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YP_009752726.1 Ycf2 protein [Ampelosycios humblotii]9.2e-1380.77Show/hide
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YP_009753047.1 Ycf2 protein [Gerrardanthus macrorhizus]9.2e-1380.77Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A191T4A7 Protein Ycf24.5e-1380.77Show/hide
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A0A286QM47 Protein Ycf24.5e-1380.77Show/hide
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A0A291IAJ3 Protein Ycf24.5e-1380.77Show/hide
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A0A346TLZ9 Protein Ycf24.5e-1380.77Show/hide
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A0A6H0EWH7 Protein Ycf24.5e-1380.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6MM80 Protein Ycf21.7e-1480.77Show/hide
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Q09FY5 Protein Ycf21.7e-1480.77Show/hide
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Q0G9F7 Protein Ycf21.7e-1480.77Show/hide
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Q14F97 Protein Ycf23.9e-1478.85Show/hide
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Q2L949 Protein Ycf23.9e-1478.85Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00860.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core1.4e-1476.92Show/hide
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ATCG01280.1 Chloroplast Ycf2;ATPase, AAA type, core1.4e-1476.92Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAATCATCCGCTTCTGGAAGAAATCGAAGAATTTCTCGAGAATCCTACAAGATTCTCTTTCTTTTCTAACAGATGGTCAGAACTTCATCTCGATTCGAATCCTCT
TGAGAGGTCCACTAGAGATCAGAAATTGTTGAAATCACAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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