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MS014689 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS014689
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionmediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a
Genome locationscaffold659:95635..96671
RNA-Seq ExpressionMS014689
SyntenyMS014689
Gene Ontology termsGO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003713 - transcription coactivator activity (molecular function)
GO:0031490 - chromatin DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036529 - Coactivator CBP, KIX domain superfamily
IPR036546 - Mediator complex subunit 15, KIX domain
IPR044661 - Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a/b/c-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6571702.1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-4076.47Show/hide
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KAG7011427.1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-4076.47Show/hide
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A0A6J1DNN0 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a2.8e-4480.67Show/hide
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A0A6J1HI15 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like isoform X11.9e-4076.47Show/hide
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A0A6J1HR60 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like isoform X19.3e-4075.63Show/hide
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A0A6J1JM75 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like isoform X26.0e-3975.42Show/hide
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A0A6J1JMY4 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a-like isoform X16.0e-3975.42Show/hide
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F4I171 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15a5.5e-2957.89Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15780.1 unknown protein3.9e-3057.89Show/hide
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AT1G15790.1 unknown protein6.4e-1756.76Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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