| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607292.1 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.6e-121 | 71.08 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS R+TRRELEKHFSAEGTVLDVHLV DPWTRESRGFGFITMSSN+EAERCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTVR VRRRS SYS R SPSYSPY RS S SS YSS+RSRS
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RSHSP R RRS SPYH+RSYSPYS RRYDSPYYR HRSYSR S SP R PTRRHDRSYS YDY S D YYRRHR RSVSRSVSPKAR+S R YSR
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SYSPR RR S+ RSYSRS RSYSRS+SPERS+R S+ ERRSSRSRSRSHT R H + YSGG S SV
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SRSVSPA
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| XP_008457405.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like [Cucumis melo] | 4.1e-119 | 70.55 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPS++RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ADP TRESRGFGFITMSSN+EAE CI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRS
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RS S RHRRSYGSPYH RSY SPY RRRYDSP YYR HRSYSRS SPY R DRSYS YDYYS D YYRRHRYRSVSRS+SPK+
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R +GR YSRSYSP P RRTLR+YS SPS RSYSRS+SPERS+RSGS + ER RS RSRS SHT RRH E++ KR YS
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SRSRSRS+SV SRSVSPA
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| XP_022150940.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 [Momordica charantia] | 7.3e-185 | 90.91 | Show/hide |
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MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR VRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRS
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RSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSR
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SYSPRPRRTLRSYSRSPSSVR YSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLE RS SRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSVV
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SRSVSPA
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| XP_022150941.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 [Momordica charantia] | 1.4e-148 | 89.12 | Show/hide |
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YSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVR YSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLE RS SRSRSRSHT
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FRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSVVSRSVSPA
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| XP_038894517.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a isoform X1 [Benincasa hispida] | 2.0e-121 | 71.84 | Show/hide |
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MS SR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTVLDVHLV DP TRESRGFGFITMSSN+EA+ CI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS RSRS
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RSHS RHRRSYGS Y++RSYS YSRRRYDSP R H+SYSR SRSPY R R DRSYS Y DY D YYRRHRYRSVSRS+SPKARIS R YSR
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SYSP P RRTLR RSYSRS S E RSYSRS+SPERS+RS S RSSRSRSRS+T RRHS+K+YE SR RSRSR
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SRSV SRSVSPA
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|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C508 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like | 2.0e-119 | 70.55 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPS++RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPR+TRRELEKHFSAEGTVLDVHL+ADP TRESRGFGFITMSSN+EAE CI
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTV VRRRS SYS R SPSYSPYRRSSSRS+ YSS+RSRS
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RS S RHRRSYGSPYH RSY SPY RRRYDSP YYR HRSYSRS SPY R DRSYS YDYYS D YYRRHRYRSVSRS+SPK+
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R +GR YSRSYSP P RRTLR+YS SPS RSYSRS+SPERS+RSGS + ER RS RSRS SHT RRH E++ KR YS
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SRSRSRS+SV SRSVSPA
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|
|
| A0A6J1D9V3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X1 | 3.5e-185 | 90.91 | Show/hide |
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KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR VRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRS
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RSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDYYSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSR
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SYSPRPRRTLRSYSRSPSSVR YSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLE RS SRSRSRSHTFRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSVV
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SRSVSPA
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|
| A0A6J1DD22 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X2 | 7.0e-149 | 89.12 | Show/hide |
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VLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR VRR
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RSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYYDY
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YSRDDCYYRRHRYRSVSRSVSPKARISGRGYSRSYSPRPRRTLRSYSRSPSSVR YSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLE RS SRSRSRSHT
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FRRHSHKVYENSGKREYSG SRSRSRSVVSRSVSPA
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|
|
| A0A6J1GAS3 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X4 | 5.7e-119 | 70.1 | Show/hide |
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MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS R+TRRELEKHFSAEGTVLDVHLV DPWTRESRGFGFITMSSN+EAERCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTV VRRR SYS R SPSYSPY RS S SS YSS+RSRS
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RSHSP R RRS SPY +RSYSPYSRRRYDSPYYR HRSYSR S SP R PTRRHDRSYS YDY S D YYRRHR RSVSRSVSPKAR+S R YS
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SYSPR RR S+ RS+SRS RSYSRS+SPERS+R S+ ERRSSRSRSRSHT R H + YSGG S SV
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SRSVSPA
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|
|
| A0A6J1GBJ2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a-like isoform X5 | 9.8e-119 | 70.1 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
MSYSR+SRYSRSPSY+RS+SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLS R+TRRELEKHFSAEGTVLDVHLV DPWTRESRGFGFITMSSN+EAERCI
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KYLNRSVLEGR+ITVEKARRRRGRTPTPGRY GLRTV VRRR SYS R SPSYSPY RS S SS YSS+RSRS
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RSHSP R RRS SPY +RSYSPYSRRRYDSPYYR HRSYSR S SP RSPTRR DRSYS YDY S D YYRRHR RSVSRSVSPKAR+S R YS
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SYSPR RR S+ RS+SRS RSYSRS+SPERS+R S+ ERRSSRSRSRSHT R H + YSGG S SV
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SRSVSPA
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P62995 Transformer-2 protein homolog beta | 6.1e-09 | 33.61 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
S SR R SRS SY R R S S S + V N N L V GLS T R+L + FS G + DV +V D +R SRGF F+ + ++A
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
Query: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSS-----RSS
+ + N L+GR I V+ + +R TPTPG Y+G T D++ R Y R S S YR R++
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Query: RYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
+ + R RS SPY R Y S RSYSP RRY
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|
|
| P62996 Transformer-2 protein homolog beta | 6.1e-09 | 33.61 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
S SR R SRS SY R R S S S + V N N L V GLS T R+L + FS G + DV +V D +R SRGF F+ + ++A
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
Query: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSS-----RSS
+ + N L+GR I V+ + +R TPTPG Y+G T D++ R Y R S S YR R++
Subjt: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSS-----RSS
Query: RYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
+ + R RS SPY R Y S RSYSP RRY
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|
|
| Q10422 Uncharacterized RNA-binding protein C25G10.01 | 1.7e-14 | 32.87 | Show/hide |
Query: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKAR
+ S + + +S EN GN+L+V+G++ RM EL++ FS GTV V ++ +P T+ SRGFGF++ S+ EEA I LN GR++ V+KA+
Subjt: SRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIKYLNRSVLEGRIITVEKAR
Query: RRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSH--SYSPRHSPSYSPYRRSSSRS-SRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPY
R R +PTPG+Y+G R G Y RR ++ S R+ SY P R S Y ER S P R R +G +
Subjt: RRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSH--SYSPRHSPSYSPYRRSSSRS-SRYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPY
Query: HHRSYSPYSRRRYDSP
H + R D+P
Subjt: HHRSYSPYSRRRYDSP
|
|
| Q3ZBT6 Transformer-2 protein homolog beta | 6.1e-09 | 33.61 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
S SR R SRS SY R R S S S + V N N L V GLS T R+L + FS G + DV +V D +R SRGF F+ + ++A
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNN-----LYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEA
Query: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSS-----RSS
+ + N L+GR I V+ + +R TPTPG Y+G T D++ R Y R S S YR R++
Subjt: ERCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSS-----RSS
Query: RYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
+ + R RS SPY R Y S RSYSP RRY
Subjt: RYSSERSRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRY
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| Q84TH4 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 4.2e-58 | 48.36 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAE
MSYSR+SRYS S S Y++ RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHLV DPWTRESRGFGFI+M S +A
Subjt: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAE
Query: RCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSER
RCI+ L+ SVL+GR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT RG R +S SYSPR S S S SRS YSS+
Subjt: RCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSER
Query: SRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRS
R RS+SP SYG SYSP+ RRR R YS S S SP R RR DRSYS YY + +RD Y RYRS SRS
Subjt: SRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRS
Query: VSPKARISG-------RGYSRSYSPRPRRTLRSY---SRSPSSVRSYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLERRSSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSG
SP+ R RG RSYSP + RSY SR RS S S S RS SRS+SP + R+ SRS+SR H +
Subjt: VSPKARISG-------RGYSRSYSPRPRRTLRSY---SRSPSSVRSYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLERRSSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSG
Query: KREYSGGSRSRSRSRSRSVVSRSVSP
S SRS +RS SRSVSP
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| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.0e-59 | 48.36 | Show/hide |
Query: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAE
MSYSR+SRYS S S Y++ RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHLV DPWTRESRGFGFI+M S +A
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Query: RCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSER
RCI+ L+ SVL+GR+ITVEKARRRRGRTPTPG+YLGLRT RG R +S SYSPR S S S SRS YSS+
Subjt: RCIKYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVRGELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRSHSYSPRHSPSYSPYRRSSSRSSRYSSER
Query: SRSRSHSPYRHRRSYGSPYHHRSYSPYSRRRYDSPYYRCHRSYSRSGSRSPYCRSPTRRHDRSYSSYY-----------DYYSRDDCYYRRHRYRSVSRS
R RS+SP SYG SYSP+ RRR R YS S S SP R RR DRSYS YY + +RD Y RYRS SRS
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Query: VSPKARISG-------RGYSRSYSPRPRRTLRSY---SRSPSSVRSYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLERRSSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSG
SP+ R RG RSYSP + RSY SR RS S S S RS SRS+SP + R+ SRS+SR H +
Subjt: VSPKARISG-------RGYSRSYSPRPRRTLRSY---SRSPSSVRSYSRSPSLELRSYSRSVSPERSKRSGSYLERRSSRSRSRSHTFRRHSHKVYENSG
Query: KREYSGGSRSRSRSRSRSVVSRSVSP
S SRS +RS SRSVSP
Subjt: KREYSGGSRSRSRSRSRSVVSRSVSP
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| AT1G07350.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.8e-35 | 68.33 | Show/hide |
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MSYSR+SRYS S S Y++ RS+SRS SRS RS SSD ENPGN+LYVTGLS R+T R+LE HF+ EG V DVHLV DPWTRESRGFGFI+M S +A
Subjt: MSYSRKSRYSRSPS-YERSLSRSLSRSRSRS--RSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAE
Query: RCIKYLNRSVLEGRIITVEK
RCI+ L+ SVL+GR+ITVEK
Subjt: RCIKYLNRSVLEGRIITVEK
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| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.7e-38 | 51.64 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIK
S SR SRS S R +S S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TMSS ++AERCIK
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPSSDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCIK
Query: YLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-----GELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRS--HSYSP------RHSPSYSPYRRSSS
YLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ R G S + Y + RRS YSP R SYSP+ RS
Subjt: YLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-----GELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRS--HSYSP------RHSPSYSPYRRSSS
Query: RSSRYSSERSRSR
R S SERS R
Subjt: RSSRYSSERSRSR
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| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.2e-37 | 51.4 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
S SR SRS S R +S S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TMSS ++AERCI
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
Query: KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-----GELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRS--HSYSP------RHSPSYSPYRRSS
KYLN+SVLEGR ITVE++RR+R RTPTPG YLGL++ R G S + Y + RRS YSP R SYSP+ RS
Subjt: KYLNRSVLEGRIITVEKARRRRGRTPTPGRYLGLRTVR-----GELSIDFWFIAGKYLEISLILFFFLIVRRRS--HSYSP------RHSPSYSPYRRSS
Query: SRSSRYSSERSRSR
R S SERS R
Subjt: SRSSRYSSERSRSR
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| AT4G35785.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.7e-28 | 62.39 | Show/hide |
Query: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
S SR SRS S R +S S SR RSRSRS S+VENPG LYVTGLS R+T ++LE HF+ EG V LV +P TR SRGF F+TMSS ++AERCI
Subjt: SYSRKSRYSRSPSYERSLSRSLSRSRSRSRSPS-SDVENPGNNLYVTGLSPRMTRRELEKHFSAEGTVLDVHLVADPWTRESRGFGFITMSSNEEAERCI
Query: KYLNRSVLEGRIITVEK
KYLN+SVLEGR ITVE+
Subjt: KYLNRSVLEGRIITVEK
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