; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS014942 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS014942
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionFibrous sheath-interacting protein
Genome locationscaffold2:129904..135023
RNA-Seq ExpressionMS014942
SyntenyMS014942
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007454 - Uncharacterised protein family UPF0250
IPR027471 - YbeD-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022151740.1 uncharacterized protein LOC111019651 isoform X1 [Momordica charantia]1.3e-101100Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

XP_022945039.1 uncharacterized protein LOC111449401 [Cucurbita moschata]6.1e-8889.29Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
        MAASR VLRSASIFL EP RP HFSRA SSS  LGT RSFTHRLNCNV ++RARGFHF +RT LNCS DETQ TSSS+QDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE

Query:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        GRVGHTTNMV+GGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGG DFVQSMVVAVESV+QQPIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

XP_022966813.1 uncharacterized protein LOC111466408 [Cucurbita maxima]7.9e-8888.78Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
        MAASR VLRSASIFL EP RP HFSRA SSS  LGT RSF HRLNCNV ++RARGFHF +RTVLNCS D+TQ TSSS+QDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE

Query:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        GRVGHTTNMV+GGTVTDDSTNEWI LDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESV+QQPIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

XP_022998631.1 uncharacterized protein LOC111493214 [Cucurbita maxima]6.3e-8587.18Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSA+IFL EP RPV   RASSS +LGT R+FTHRL C     RARGF F KRTVL CS+DETQSTSSSNQD QGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        RVGHTTNMV+GGTVTDDS+NEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQ+PIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

XP_023542309.1 uncharacterized protein LOC111802242 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-9090.26Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASR VLRSASIFL EP RP HFSRASSS +LGT RSFTHRLNCNV ++R RGFHF +RTVLNCS DETQ TSSS+QDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        RVGHTTNMV+GGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESV+QQPIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DC16 uncharacterized protein LOC111019651 isoform X16.1e-102100Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

A0A6J1FZV2 uncharacterized protein LOC1114494012.9e-8889.29Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
        MAASR VLRSASIFL EP RP HFSRA SSS  LGT RSFTHRLNCNV ++RARGFHF +RT LNCS DETQ TSSS+QDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE

Query:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        GRVGHTTNMV+GGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGG DFVQSMVVAVESV+QQPIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

A0A6J1GWI1 uncharacterized protein LOC1114582188.8e-8586.67Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSA+IFL EP RPV   RASSS +LGT R+FTHRL C     R RGF F KRTVL CS+DETQSTSSSNQD QGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        RVGHTTNMV+GGTVTDDS+NEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQ+PIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

A0A6J1HTC4 uncharacterized protein LOC1114664083.8e-8888.78Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
        MAASR VLRSASIFL EP RP HFSRA SSS  LGT RSF HRLNCNV ++RARGFHF +RTVLNCS D+TQ TSSS+QDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRA-SSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTE

Query:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        GRVGHTTNMV+GGTVTDDSTNEWI LDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESV+QQPIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  GRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

A0A6J1KAN5 uncharacterized protein LOC1114932143.0e-8587.18Show/hide
Query:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG
        MAASRTVLRSA+IFL EP RPV   RASSS +LGT R+FTHRL C     RARGF F KRTVL CS+DETQSTSSSNQD QGPPQEAVLKAISEVSKTEG
Subjt:  MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEG

Query:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        RVGHTTNMV+GGTVTDDS+NEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQ+PIPEGKVRHKLS+KGKYVSVNIGPVQVISSEQV
Subjt:  RVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G27385.1 unknown protein5.0e-4870.07Show/hide
Query:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES
        + T LNCSH++        Q  QGPPQEAVLKAISEVSKT+GRVG TTNM+IGGTV DDS  +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVES
Subjt:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES

Query:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        V+ + IPE  V+  LSSKGKYVSVNIGP+QV+SSEQV
Subjt:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

AT1G27385.2 unknown protein4.7e-4669.34Show/hide
Query:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES
        + T LNCSH++        Q  QGPPQEAVLKAIS VSKT+GRVG TTNM+IGGTV DDS  +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVES
Subjt:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES

Query:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        V+ + IPE  V+  LSSKGKYVSVNIGP+QV+SSEQV
Subjt:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

AT1G27385.3 unknown protein5.0e-4870.07Show/hide
Query:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES
        + T LNCSH++        Q  QGPPQEAVLKAISEVSKT+GRVG TTNM+IGGTV DDS  +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVES
Subjt:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES

Query:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        V+ + IPE  V+  LSSKGKYVSVNIGP+QV+SSEQV
Subjt:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV

AT1G27385.4 unknown protein4.7e-4669.34Show/hide
Query:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES
        + T LNCSH++        Q  QGPPQEAVLKAIS VSKT+GRVG TTNM+IGGTV DDS  +W+ LDQKVN+YP  RGFTAIGTGG+DFV +MVVAVES
Subjt:  KRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVIGGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVES

Query:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV
        V+ + IPE  V+  LSSKGKYVSVNIGP+QV+SSEQV
Subjt:  VLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGCAAGCAGGACTGTGTTGCGTTCTGCATCAATATTCTTAATGGAGCCATATAGACCCGTTCACTTCAGCCGTGCTTCCTCCTCCATCGCACTCGGAACTAGCCG
ATCCTTCACTCACAGATTGAATTGCAATGTAACAACTGCTAGGGCTCGAGGATTTCACTTCCGCAAACGAACTGTTCTGAATTGCTCCCACGACGAGACCCAATCAACGT
CGTCGTCTAATCAGGATGGCCAGGGCCCTCCGCAGGAAGCTGTTTTGAAGGCAATCTCAGAGGTATCAAAGACAGAAGGGAGGGTTGGGCATACAACAAATATGGTAATT
GGGGGAACAGTGACAGATGATTCTACCAATGAGTGGATTGCTTTGGATCAAAAGGTTAACTCGTACCCGGGTGTTAGAGGCTTTACAGCAATTGGAACTGGGGGAGATGA
TTTTGTGCAATCTATGGTTGTGGCTGTGGAGTCTGTCCTCCAACAGCCAATTCCTGAGGGCAAGGTGAGGCATAAATTATCATCAAAAGGGAAGTACGTGTCAGTAAACA
TCGGACCAGTTCAAGTAATTTCCAGTGAGCAGGTCCCTTTCTCTCCCATTAATTTGTTCATTTATGATGCCTTGCAATTTGTTAGCATACCATGTCCTCCACCCGCCAAC
AAACATATTCAGTTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAGCAAGCAGGACTGTGTTGCGTTCTGCATCAATATTCTTAATGGAGCCATATAGACCCGTTCACTTCAGCCGTGCTTCCTCCTCCATCGCACTCGGAACTAGCCG
ATCCTTCACTCACAGATTGAATTGCAATGTAACAACTGCTAGGGCTCGAGGATTTCACTTCCGCAAACGAACTGTTCTGAATTGCTCCCACGACGAGACCCAATCAACGT
CGTCGTCTAATCAGGATGGCCAGGGCCCTCCGCAGGAAGCTGTTTTGAAGGCAATCTCAGAGGTATCAAAGACAGAAGGGAGGGTTGGGCATACAACAAATATGGTAATT
GGGGGAACAGTGACAGATGATTCTACCAATGAGTGGATTGCTTTGGATCAAAAGGTTAACTCGTACCCGGGTGTTAGAGGCTTTACAGCAATTGGAACTGGGGGAGATGA
TTTTGTGCAATCTATGGTTGTGGCTGTGGAGTCTGTCCTCCAACAGCCAATTCCTGAGGGCAAGGTGAGGCATAAATTATCATCAAAAGGGAAGTACGTGTCAGTAAACA
TCGGACCAGTTCAAGTAATTTCCAGTGAGCAGGTCCCTTTCTCTCCCATTAATTTGTTCATTTATGATGCCTTGCAATTTGTTAGCATACCATGTCCTCCACCCGCCAAC
AAACATATTCAGTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAASRTVLRSASIFLMEPYRPVHFSRASSSIALGTSRSFTHRLNCNVTTARARGFHFRKRTVLNCSHDETQSTSSSNQDGQGPPQEAVLKAISEVSKTEGRVGHTTNMVI
GGTVTDDSTNEWIALDQKVNSYPGVRGFTAIGTGGDDFVQSMVVAVESVLQQPIPEGKVRHKLSSKGKYVSVNIGPVQVISSEQVPFSPINLFIYDALQFVSIPCPPPAN
KHIQL