; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS015223 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS015223
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiont-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein
Genome locationscaffold2:1892589..1894186
RNA-Seq ExpressionMS015223
SyntenyMS015223
Gene Ontology termsGO:0015031 - protein transport (biological process)
GO:0061025 - membrane fusion (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR044766 - NPSN/SNAP25-like, N-terminal SNARE domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135151.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucumis sativus]7.4e-12984.71Show/hide
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XP_008446422.1 PREDICTED: putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucumis melo]1.2e-12684.08Show/hide
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XP_022148994.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Momordica charantia]1.0e-16299.35Show/hide
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XP_022984084.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita maxima]1.5e-12682.59Show/hide
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XP_023528612.1 putative SNAP25 homologous protein SNAP30 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.5e-12682.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQT5 t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein3.6e-12984.71Show/hide
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A0A1S3BF13 putative SNAP25 homologous protein SNAP305.7e-12784.08Show/hide
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A0A6J1D5P9 putative SNAP25 homologous protein SNAP305.0e-16399.35Show/hide
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A0A6J1G0W1 putative SNAP25 homologous protein SNAP306.3e-12682.76Show/hide
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A0A6J1J9F6 putative SNAP25 homologous protein SNAP307.5e-12782.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P36977 Synaptosomal-associated protein 25-A3.7e-1427.18Show/hide
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        + +++  A   A+E+ +S    L++ E+ ++   RTL ML +QGEQ+ER       ++KD+   EK LN+LG        P    +  G     ++  G 
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          +      ++RE++ +S                 +++V  D  + + D+ L  +  I+G+L+ MA+DMG+E+D QN+ +D + +  D   +R+  ANQR
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        A  ++G
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Q17QQ3 Synaptosomal-associated protein 254.8e-1429Show/hide
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        ++E++  A   A+E+ +S    L++ E+ ++   RTL ML +QGEQ+ER       ++KD+ + EK L +LG        P         L ++D     
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         GNN++       +       Q   S         D  + + D+ L  +S I+G+L+ MA+DMG+E+D QN+ +D + +  D   +R+  ANQRA  ++G
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Q9LMG8 Putative SNAP25 homologous protein SNAP301.3e-9161.61Show/hide
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        MF F KSP  NK+P ++S +  G                 T    RRTSSEP+L+TPD  FDDD                            D+YKN F+
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        DSGG ++Q+ +ELE YAVYKAEETTK VNNCLKIAEDIR D  RTL+MLHQQGEQI RTH MA DMDKDLS+GEKLLNNLGGMFSK WKPKKTK ITGP+
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Query:  ITADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA
        IT D  S KS N+KE+REKLGL    +S++Q    + T ALQKV+ EK KQDD LSDLS+ILGDLKSMAVDMGSE+D+QNKALDHL DDVDELNSRV+GA
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        NQRARHL+ K
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Q9S7P9 SNAP25 homologous protein SNAP332.1e-8961.41Show/hide
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        MF   KSPAN +PK NSVD   S   NPFDSD ESDNK T NP++RT+SEP L    NPF      G   ++G ++SS +    +  + SK +YKN+F D
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        SGG ENQSVQELE YAVYKAEETTKSV  CLK+AEDIR DATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSKTWKPKKT+ I GP++
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Query:  TADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKK--SATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKG
        T D S  +  N+ EKREKLGL++  +  S T++P  E+  A Q+V++EK KQDD LSDLS+ILG+LK+MAVDMGSE+++QNK LDHL DDVDELN RV+ 
Subjt:  TADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKK--SATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKG

Query:  ANQRARHLIGK
        +NQR R L+GK
Subjt:  ANQRARHLIGK

Q9SD96 SNAP25 homologous protein SNAP297.1e-5851.98Show/hide
Query:  NPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFSDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIER
        NPFDDDDD+  V KR T++                        SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETTK+V  CLK+AE+IR DA++TL ML++QG+QI R
Subjt:  NPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFSDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIER

Query:  THRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPLITADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDL
        TH+   D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+TWKPKK++ ITGP+IT   S  +   + + REKLGL+   K  + K   EA  A QK  +   KQD+AL+DL
Subjt:  THRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPLITADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDL

Query:  SNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARHLIGK
        S +LG+LK+MAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR+L+ K
Subjt:  SNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARHLIGK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13890.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 309.1e-9361.61Show/hide
Query:  MFSFMKSPA-NKVPKQNSVDPAGSGTDNPFDSDTESDNKQTPNPARRTSSEPVLVTPDNPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFS
        MF F KSP  NK+P ++S +  G                 T    RRTSSEP+L+TPD  FDDD                            D+YKN F+
Subjt:  MFSFMKSPA-NKVPKQNSVDPAGSGTDNPFDSDTESDNKQTPNPARRTSSEPVLVTPDNPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFS

Query:  DSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPL
        DSGG ++Q+ +ELE YAVYKAEETTK VNNCLKIAEDIR D  RTL+MLHQQGEQI RTH MA DMDKDLS+GEKLLNNLGGMFSK WKPKKTK ITGP+
Subjt:  DSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPL

Query:  ITADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA
        IT D  S KS N+KE+REKLGL    +S++Q    + T ALQKV+ EK KQDD LSDLS+ILGDLKSMAVDMGSE+D+QNKALDHL DDVDELNSRV+GA
Subjt:  ITADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGA

Query:  NQRARHLIGK
        NQRARHL+ K
Subjt:  NQRARHLIGK

AT5G07880.1 synaptosomal-associated protein SNAP25-like 295.1e-5951.98Show/hide
Query:  NPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFSDSGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIER
        NPFDDDDD+  V KR T++                        SGG ENQ+VQELE+YAVY +EETTK+V  CLK+AE+IR DA++TL ML++QG+QI R
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Query:  THRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPLITADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDL
        TH+   D+D  LS+GEK+L  LGG+FS+TWKPKK++ ITGP+IT   S  +   + + REKLGL+   K  + K   EA  A QK  +   KQD+AL+DL
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Query:  SNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARHLIGK
        S +LG+LK+MAVDMG+ ++RQ   LDHL D+ DELN RVK +NQRAR+L+ K
Subjt:  SNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARHLIGK

AT5G61210.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 331.5e-9061.41Show/hide
Query:  MFSFMKSPANKVPKQNSVDPAGSGTDNPFDSDTESDNKQTPNPARRTSSEPVLVTPDNPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFSD
        MF   KSPAN +PK NSVD   S   NPFDSD ESDNK T NP++RT+SEP L    NPF      G   ++G ++SS +    +  + SK +YKN+F D
Subjt:  MFSFMKSPANKVPKQNSVDPAGSGTDNPFDSDTESDNKQTPNPARRTSSEPVLVTPDNPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFSD

Query:  SGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPLI
        SGG ENQSVQELE YAVYKAEETTKSV  CLK+AEDIR DATRTL MLH QGEQI RTH  A ++D DLS+GEKLL +LGGMFSKTWKPKKT+ I GP++
Subjt:  SGGFENQSVQELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPLI

Query:  TADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKK--SATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKG
        T D S  +  N+ EKREKLGL++  +  S T++P  E+  A Q+V++EK KQDD LSDLS+ILG+LK+MAVDMGSE+++QNK LDHL DDVDELN RV+ 
Subjt:  TADHSSGKSGNNKEKREKLGLSTDKK--SATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKG

Query:  ANQRARHLIGK
        +NQR R L+GK
Subjt:  ANQRARHLIGK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTAGTTTCATGAAATCACCCGCGAACAAAGTTCCTAAGCAGAATTCTGTGGATCCTGCCGGATCTGGCACTGATAATCCTTTTGATTCAGACACTGAATCTGATAA
CAAACAAACTCCTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCTGAGCCTGTGCTTGTTACACCGGACAACCCTTTTGATGATGATGATGATGAGGGTTTTGTTGGAAAAAGAGGGA
CTGCAACTTCTTCAGCTAAAAGAGGGACTGCAACTTCGTCAGCTGCTTCTAAAGACAGGTACAAAAATGATTTTAGCGACTCGGGAGGATTTGAGAATCAGAGTGTGCAG
GAATTGGAGAACTACGCTGTGTATAAGGCCGAGGAGACCACGAAATCTGTTAACAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGGAAGATGCTACCAGGACTCTTGACAT
GTTGCATCAACAGGGTGAGCAAATAGAGAGAACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGATCTAAGTAAGGGTGAGAAACTTCTGAATAATCTTGGAGGCATGTTCT
CTAAGACATGGAAGCCAAAGAAGACCAAAGAAATTACAGGCCCTCTTATAACAGCAGACCATTCCTCTGGGAAGTCTGGAAACAACAAGGAAAAAAGGGAAAAACTGGGT
TTATCGACAGACAAAAAGTCGGCTACTCAAAAACCAGCCTCTGAAGCAACAACTGCCTTGCAAAAAGTTGATGTTGAGAAGGAAAAGCAAGATGATGCACTTTCAGATTT
AAGCAACATCTTGGGAGATCTGAAGAGCATGGCTGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGATAGGCAAAACAAAGCTCTGGATCATCTTAGCGACGATGTCGACGAGCTGAATT
CTAGAGTGAAAGGTGCCAATCAACGAGCCCGCCATTTGATTGGGAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTAGTTTCATGAAATCACCCGCGAACAAAGTTCCTAAGCAGAATTCTGTGGATCCTGCCGGATCTGGCACTGATAATCCTTTTGATTCAGACACTGAATCTGATAA
CAAACAAACTCCTAATCCTGCAAGAAGAACTTCTTCTGAGCCTGTGCTTGTTACACCGGACAACCCTTTTGATGATGATGATGATGAGGGTTTTGTTGGAAAAAGAGGGA
CTGCAACTTCTTCAGCTAAAAGAGGGACTGCAACTTCGTCAGCTGCTTCTAAAGACAGGTACAAAAATGATTTTAGCGACTCGGGAGGATTTGAGAATCAGAGTGTGCAG
GAATTGGAGAACTACGCTGTGTATAAGGCCGAGGAGACCACGAAATCTGTTAACAACTGCCTGAAGATCGCTGAGGACATAAGGGAAGATGCTACCAGGACTCTTGACAT
GTTGCATCAACAGGGTGAGCAAATAGAGAGAACCCACAGGATGGCTGCTGATATGGATAAAGATCTAAGTAAGGGTGAGAAACTTCTGAATAATCTTGGAGGCATGTTCT
CTAAGACATGGAAGCCAAAGAAGACCAAAGAAATTACAGGCCCTCTTATAACAGCAGACCATTCCTCTGGGAAGTCTGGAAACAACAAGGAAAAAAGGGAAAAACTGGGT
TTATCGACAGACAAAAAGTCGGCTACTCAAAAACCAGCCTCTGAAGCAACAACTGCCTTGCAAAAAGTTGATGTTGAGAAGGAAAAGCAAGATGATGCACTTTCAGATTT
AAGCAACATCTTGGGAGATCTGAAGAGCATGGCTGTGGACATGGGAAGCGAGCTTGATAGGCAAAACAAAGCTCTGGATCATCTTAGCGACGATGTCGACGAGCTGAATT
CTAGAGTGAAAGGTGCCAATCAACGAGCCCGCCATTTGATTGGGAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFSFMKSPANKVPKQNSVDPAGSGTDNPFDSDTESDNKQTPNPARRTSSEPVLVTPDNPFDDDDDEGFVGKRGTATSSAKRGTATSSAASKDRYKNDFSDSGGFENQSVQ
ELENYAVYKAEETTKSVNNCLKIAEDIREDATRTLDMLHQQGEQIERTHRMAADMDKDLSKGEKLLNNLGGMFSKTWKPKKTKEITGPLITADHSSGKSGNNKEKREKLG
LSTDKKSATQKPASEATTALQKVDVEKEKQDDALSDLSNILGDLKSMAVDMGSELDRQNKALDHLSDDVDELNSRVKGANQRARHLIGK