; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS015330 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS015330
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionHeavy metal-associated domain containing protein
Genome locationscaffold2:2636746..2637391
RNA-Seq ExpressionMS015330
SyntenyMS015330
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036163 - Heavy metal-associated domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7013033.1 hypothetical protein SDJN02_25789 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-2978Show/hide
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XP_022150612.1 uncharacterized protein LOC111018707 [Momordica charantia]4.1e-44100Show/hide
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XP_022968296.1 uncharacterized protein LOC111467567 isoform X3 [Cucurbita maxima]8.9e-3180Show/hide
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XP_023542320.1 uncharacterized protein LOC111802252 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-2978Show/hide
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XP_038892707.1 uncharacterized protein LOC120081691 [Benincasa hispida]9.8e-3079Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KT62 Uncharacterized protein1.7e-2776.29Show/hide
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A0A6J1DB71 uncharacterized protein LOC1110187072.0e-44100Show/hide
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A0A6J1G176 uncharacterized protein LOC111449743 isoform X16.6e-2459.52Show/hide
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A0A6J1G188 uncharacterized protein LOC111449743 isoform X32.6e-2875.76Show/hide
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A0A6J1HUG9 uncharacterized protein LOC111467567 isoform X34.3e-3180Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G68585.1 unknown protein3.6e-1449.41Show/hide
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AT2G35730.1 Heavy metal transport/detoxification superfamily protein2.0e-0440.35Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAGGCGGCGGTGATCGGAGTTCGGAAGCCAAGGATTTTCCCCCATGCTTCTAGCCTTGCCTCCATCGAATCCTTATCTCTGCCTCTTGTCCAGGAAATTGTCTTGACAGC
CGATATTCGATGCCCTGAATGCCAAAACAAATTGGCGAATATACTCTCCAAAATTAACGATACAGAGTCTGTGGTGGTGAATTTGTTGGAGAAGAAAGTGATATTAACTC
GAAGATTGCAAGTTCCATCCACGTGCAGCAATTCTTCGAGTAAAGTTGCAACAATCAAGAGATTGCTTGGTTCATCCTTCAGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
KAAVIGVRKPRIFPHASSLASIESLSLPLVQEIVLTADIRCPECQNKLANILSKINDTESVVVNLLEKKVILTRRLQVPSTCSNSSSKVATIKRLLGSSFR