CuGenDBv2

Gene ID	MS015359
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
Genome location	scaffold2:2823590..2823736
RNA-Seq Expression	MS015359
Synteny	MS015359
Gene Ontology terms	GO:0015979 - photosynthesis (biological process) GO:0018298 - protein-chromophore linkage (biological process) GO:0022900 - electron transport chain (biological process) GO:0009522 - photosystem I (cellular component) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0000287 - magnesium ion binding (molecular function) GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function) GO:0016168 - chlorophyll binding (molecular function) GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001280 - Photosystem I PsaA/PsaB IPR036408 - Photosystem I PsaA/PsaB superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

RYQ83802.1 hypothetical protein Ahy_B10g102659 [Arachis hypogaea]

1.1e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+TYYL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

YP_001468308.1 photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 [Ipomoea purpurea]

3.1e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

YP_009409322.1 PsaA [Aloe vera]

3.1e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

YP_009472021.1 photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 [Cedrela odorata]

3.1e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

YP_009731577.1 photosystem I P700 apoprotein A1 [Allium kingdonii]

3.1e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2P1EFJ5 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

1.5e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

A0A444X2J7 Proton_antipo_M domain-containing protein

5.2e-14

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+TYYL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

A0A6B9VU85 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

1.5e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

A7Y3D4 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

1.5e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

H2FBJ8 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

1.5e-13

81.63

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+GIT+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A4QJB5 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

5.3e-16

79.59

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+T+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

A4QJJ9 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

5.3e-16

79.59

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+T+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

A4QK18 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

5.3e-16

79.59

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+T+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

Q3V534 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

5.3e-16

79.59

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+T+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

Q70Y03 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

5.3e-16

79.59

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSIVQGRA+G+T+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00350.1 Photosystem I, PsaA/PsaB protein

4.9e-17

77.55

Show/hide

Query:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF
        QELIESIVW HN+LKVAPA Q  ALSI+QGRA+G+T+YL+ GIATTWAF
Subjt:  QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

CAAGAACTTATTGAATCTATTGTTTGGGTTCATAATAGATTAAAAGTTGCTCCAGCTGCTCAGTCTGGAGCGTTGAGCATTGTGCAAGGACGTGCTATAGGAATAACCTA
TTATCTTATGAGTGGAATTGCCACAACATGGGCGTTC

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CAAGAACTTATTGAATCTATTGTTTGGGTTCATAATAGATTAAAAGTTGCTCCAGCTGCTCAGTCTGGAGCGTTGAGCATTGTGCAAGGACGTGCTATAGGAATAACCTA
TTATCTTATGAGTGGAATTGCCACAACATGGGCGTTC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

QELIESIVWVHNRLKVAPAAQSGALSIVQGRAIGITYYLMSGIATTWAF

MS015359 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome