; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS015453 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS015453
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description30S ribosomal protein S3, chloroplastic
Genome locationscaffold424:192243..192446
RNA-Seq ExpressionMS015453
SyntenyMS015453
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001351 - Ribosomal protein S3, C-terminal
IPR036419 - Ribosomal protein S3, C-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AHM88764.1 ribosomal protein S3 [Lagenaria siceraria]4.6e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

YP_009447489.1 ribosomal protein S3 [Cucurbita maxima]4.6e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

YP_009752281.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes baviensis]4.6e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

YP_009752619.1 ribosomal protein S3 [Trichosanthes homophylla]4.6e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

YP_009752958.1 ribosomal protein S3 [Momordica sessilifolia]3.5e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI+ +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4EU44 30S ribosomal protein S3, chloroplastic2.2e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

A0A249RZG7 30S ribosomal protein S3, chloroplastic2.2e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

A0A6H0ERM9 30S ribosomal protein S3, chloroplastic2.2e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

A0A6H0ESU0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic2.2e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

A0A6H0EVJ9 30S ribosomal protein S3, chloroplastic1.7e-2380.88Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI+ +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A4GG84 30S ribosomal protein S3, chloroplastic3.3e-2473.53Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKG+QVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKI+YCCY VR IYG+LGIK+W
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

Q2PMP7 30S ribosomal protein S3, chloroplastic8.7e-2576.47Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKG+QVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCY VR IYGVLGIK+W
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

Q332T8 30S ribosomal protein S3, chloroplastic5.1e-2579.41Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCY VR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

Q4VZN0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic7.9e-2679.41Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKIDYCCYPVR IYG+LGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

Q8MCA5 30S ribosomal protein S3, chloroplastic2.5e-2475Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ  TKG+QVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ IRAKI+YCCY VR IYGVLGIK+W
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00800.1 structural constituent of ribosome1.5e-2476.47Show/hide
Query:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW
        MKKA ELTEQ +TKGIQVQI   +DGKEI  +EWIRE RVPLQ I AKIDYC Y VR IYGVLGIKIW
Subjt:  MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAAAAGCTAGTGAATTAACTGAACAGGTGAGTACAAAGGGAATTCAAGTACAAATTACAGAGCATGTAGATGGAAAAGAAATTACACATATCGAATGGATCAGAGA
ATGGAGGGTTCCTCTACAAAACATTCGAGCTAAAATTGATTATTGTTGCTATCCAGTTCGAGCGATCTATGGGGTATTAGGCATAAAAATTTGG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAAAAGCTAGTGAATTAACTGAACAGGTGAGTACAAAGGGAATTCAAGTACAAATTACAGAGCATGTAGATGGAAAAGAAATTACACATATCGAATGGATCAGAGA
ATGGAGGGTTCCTCTACAAAACATTCGAGCTAAAATTGATTATTGTTGCTATCCAGTTCGAGCGATCTATGGGGTATTAGGCATAAAAATTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKKASELTEQVSTKGIQVQITEHVDGKEITHIEWIREWRVPLQNIRAKIDYCCYPVRAIYGVLGIKIW