| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| PPD86023.1 hypothetical protein GOBAR_DD17039 [Gossypium barbadense] | 3.5e-52 | 95.37 | Show/hide |
Query: KAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKEL
KAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAA+FTIERE+HTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKI++RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKEL
Subjt: KAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKEL
Query: DHLKNAFE
DHLKNAFE
Subjt: DHLKNAFE
|
|
| RYR22162.1 hypothetical protein Ahy_B03g067442 isoform A [Arachis hypogaea] | 1.2e-52 | 93.75 | Show/hide |
Query: RSKPKAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDL
R K AMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNI+RMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDL
Subjt: RSKPKAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDL
Query: DKELDHLKNAFE
D+ELDHLKNAFE
Subjt: DKELDHLKNAFE
|
|
| XP_008461807.1 PREDICTED: DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 [Cucumis melo] | 3.5e-52 | 98.11 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| XP_011651771.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 isoform X1 [Cucumis sativus] | 3.5e-52 | 98.11 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| XP_022152550.1 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 [Momordica charantia] | 9.2e-53 | 100 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LCD5 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 1.7e-52 | 98.11 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| A0A1S3CG10 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 | 1.7e-52 | 98.11 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| A0A445A743 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 5.8e-53 | 93.75 | Show/hide |
Query: RSKPKAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDL
R K AMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNI+RMQLHRDENVLFAGYKLPHPL+YKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDL
Subjt: RSKPKAMNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDL
Query: DKELDHLKNAFE
D+ELDHLKNAFE
Subjt: DKELDHLKNAFE
|
|
| A0A6J1DE90 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 | 4.4e-53 | 100 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| A9PCB4 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 3.8e-52 | 96.23 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFT+ERE+HTIGNILRMQLHRD+NVLFAGYKLPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKNAFE
Subjt: LKNAFE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P52435 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a | 1.5e-26 | 53.33 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP +E F++ EG KK++ +DTK+ NA FTI +E+HT+GNI++ QL +D VLFAGYK+PHPL++KIIIR+ TT SP +A+ AI DL EL
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAF
L+ F
Subjt: LKNAF
|
|
| Q32P79 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 | 1.5e-26 | 53.33 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP +E F++ EG KK++ +DTK+ NA FTI +E+HT+GNI++ QL +D VLFAGYK+PHPL++KIIIR+ TT SP +A+ AI DL EL
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAF
L+ F
Subjt: LKNAF
|
|
| Q38859 DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 11 | 3.6e-52 | 91.51 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP+RYERFVVPEGTKKVSY+RDTKIINAASFT+ERE+HTIGNI+RMQLHRDENVLFAGY+LPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELD+
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKN FE
Subjt: LKNAFE
|
|
| Q86JJ5 DNA-directed RNA polymerase II subunit rpb11 | 3.1e-27 | 50.48 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAPDR+E FV+P+G KKV+ RDTKI NA+ FTI +E+HTIGN++RMQL D++++FAGY++PHPL++ + IRI T + ++P++ +++ L +E
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAF
L+N+F
Subjt: LKNAF
|
|
| Q9VJE4 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 | 1.5e-26 | 53.77 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP +E F++ EG KK+ E DTK+ NAA FTI +E+HT+GN++R QL +D NVLFAGYK+PHPL++K +IRI TT+ SP +A+ AI DL EL
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
+ F+
Subjt: LKNAFE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G29540.1 RNApolymerase 14 kDa subunit | 5.6e-08 | 31.65 | Show/hide |
Query: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFE
++ ASFT+ E+HT+ N +R L++D V A Y +PHP ++ IR+ TT + + + A +L + H+++ F+
Subjt: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFE
|
|
| AT2G29540.2 RNApolymerase 14 kDa subunit | 5.6e-08 | 31.65 | Show/hide |
Query: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFE
++ ASFT+ E+HT+ N +R L++D V A Y +PHP ++ IR+ TT + + + A +L + H+++ F+
Subjt: INAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFE
|
|
| AT3G52090.1 DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like | 2.6e-53 | 91.51 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
MNAP+RYERFVVPEGTKKVSY+RDTKIINAASFT+ERE+HTIGNI+RMQLHRDENVLFAGY+LPHPLKYKII+RIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELD+
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIRIHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDH
Query: LKNAFE
LKN FE
Subjt: LKNAFE
|
|
| AT3G52090.2 DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like | 1.5e-48 | 71.32 | Show/hide |
Query: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIR--------------------------
MNAP+RYERFVVPEGTKKVSY+RDTKIINAASFT+ERE+HTIGNI+RMQLHRDENVLFAGY+LPHPLKYKII+R
Subjt: MNAPDRYERFVVPEGTKKVSYERDTKIINAASFTIEREEHTIGNILRMQLHRDENVLFAGYKLPHPLKYKIIIR--------------------------
Query: ----IHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFE
IHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELD+LKN FE
Subjt: ----IHTTSQSSPMQAYNQAINDLDKELDHLKNAFE
|
|
