; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS016529 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS016529
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationscaffold657:564199..564690
RNA-Seq ExpressionMS016529
SyntenyMS016529
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141196.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X1 [Cucumis sativus]3.1e-8195.73Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]3.1e-8195.73Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]2.4e-86100Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.5e-8095.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein1.5e-8195.73Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like3.3e-8195.12Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like3.3e-8195.12Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like1.2e-86100Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like1.4e-7993.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1YKY7 Protein IAL14.3e-3855.8Show/hide
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           L +Y      + S +P+     A    S    G++
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 21.6e-4056.33Show/hide
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         +L    + L +Y    I A +      +  A  +  T      +T+   HY+   +F
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Q32SG3 LOB domain-containing protein 66.7e-3955.17Show/hide
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           L +Y      + S +P+     A    +    G+ +  + GH
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 254.5e-5183.78Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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        + TNA+L+RYA
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES6.5e-5078.23Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 253.2e-5283.78Show/hide
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        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.6e-5178.23Show/hide
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.6e-5178.23Show/hide
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.6e-5178.23Show/hide
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        QKELDA NA+L  Y  +   A +P
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein4.6e-5178.23Show/hide
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        QKELDA NA+L  Y  +   A +P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGCGCAGCCTGCAAGTTCCTCCGGCGAAAATGCCTACCGGACTGCGTTTTTGCCCCGTACTTCCCGCCCGAGGAGCCGCA
GAAGTTCGCCAACGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTCAGCAAGCTGCTGAACGAAGTCCAGCCACACCAACGCGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTACGAGG
CCGAGGCGAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTAGGCGCCATCTCCATCCTCCAGAGGCAAGTCATCAAGCTCCAGAAAGAACTCGACGCCACCAATGCGAATCTC
ATCCGCTATGCCTGCAATGAAATCCCTGCTCCGTCCCCGTCCCCGTCGTCGTCCTCACAATACGCTCGGAGGTCGTCGTCTACGAACCATGAGGGAAGCTCCTCCACCTC
TAGCTATGGCCACTACTATTCTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGCGCAGCCTGCAAGTTCCTCCGGCGAAAATGCCTACCGGACTGCGTTTTTGCCCCGTACTTCCCGCCCGAGGAGCCGCA
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CCGAGGCGAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTAGGCGCCATCTCCATCCTCCAGAGGCAAGTCATCAAGCTCCAGAAAGAACTCGACGCCACCAATGCGAATCTC
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TAGCTATGGCCACTACTATTCTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IRYACNEIPAPSPSPSSSSQYARRSSSTNHEGSSSTSSYGHYYSGLYFSPWSNN