; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS016717 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS016717
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionORF107c
Genome locationscaffold563:270773..271054
RNA-Seq ExpressionMS016717
SyntenyMS016717
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GFQ08762.1 hypothetical protein PHJA_003020200 [Phtheirospermum japonicum]2.9e-3678.72Show/hide
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KAB1210637.1 hypothetical protein CJ030_MR6G010321 [Morella rubra]2.9e-3678.72Show/hide
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KAF3952863.1 hypothetical protein CMV_021630 [Castanea mollissima]2.9e-3678.72Show/hide
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PLY71578.1 hypothetical protein LSAT_1X88180 [Lactuca sativa]2.9e-3678.72Show/hide
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PLY94224.1 hypothetical protein LSAT_8X139840 [Lactuca sativa]1.0e-3679.79Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2J6KAH1 Uncharacterized protein1.4e-3678.72Show/hide
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A0A2J6M3Y5 Uncharacterized protein4.9e-3779.79Show/hide
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A0A2N9HQ72 Uncharacterized protein1.4e-3678.72Show/hide
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A0A6A1VFM0 Uncharacterized protein1.4e-3678.72Show/hide
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A0A7N2N6W3 Uncharacterized protein1.4e-3678.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GTGACACCTATCATGATGAAGAACGGCTCGTCTTGCCATCAACTTCTCTTTAATTCTCAAAACTTATGTCGCTTCATTTCTGCAGGGATAGAGAATCCATCGCTGTCTCG
GCTGTGCTATCGAAAGCTTTGGAGAAGTCGGAATAGGAGAGCACTCATTATAGGGTGGGCTTACTACTTGGATGCTTTGAGCAGTTATCCGCTCCGCACTTGGCTACCCA
ACGTTTATCATGGGCACGATAGCTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCTGGTCATCTCATAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGACACCTATCATGATGAAGAACGGCTCGTCTTGCCATCAACTTCTCTTTAATTCTCAAAACTTATGTCGCTTCATTTCTGCAGGGATAGAGAATCCATCGCTGTCTCG
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ACGTTTATCATGGGCACGATAGCTGGTACACCAGAGGTGCGTCCTTCCTGGTCATCTCATAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
VTPIMMKNGSSCHQLLFNSQNLCRFISAGIENPSLSRLCYRKLWRSRNRRALIIGWAYYLDALSSYPLRTWLPNVYHGHDSWYTRGASFLVISY