; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS016969 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS016969
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontubulin-folding cofactor B
Genome locationscaffold197:64981..68376
RNA-Seq ExpressionMS016969
SyntenyMS016969
Gene Ontology termsGO:0009793 - embryo development ending in seed dormancy (biological process)
GO:0051301 - cell division (biological process)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000626 - Ubiquitin-like domain
IPR000938 - CAP Gly-rich domain
IPR029071 - Ubiquitin-like domain superfamily
IPR036859 - CAP Gly-rich domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595702.1 Tubulin-folding cofactor B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-12295.2Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEKYQISEEAY+KRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRCE+EPG+ RG VKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        KNDG VKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

KAG7027664.1 Tubulin-folding cofactor B [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-12295.18Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEKYQISEEAY+KRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRCE+EPG+ RG VKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVK
        KNDG VKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVK
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVK

XP_008455690.1 PREDICTED: tubulin-folding cofactor B isoform X1 [Cucumis melo]1.0e-12293.56Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLW+KCGTSVNSMCLELYDDSG+KISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEK+QISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRC++EPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKVCFAA
        KNDG VKGI YFDC PLHGAMVRPDKVKV F+A
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKVCFAA

XP_022153874.1 tubulin-folding cofactor B [Momordica charantia]2.4e-12799.56Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCE+EPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

XP_023517149.1 tubulin-folding cofactor B [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-12295.2Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEKYQISEEAY+KRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKV DRCE+EPG+ RG VKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L346 CAP-Gly domain-containing protein5.5e-12292.7Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLW+KCGTSVNSMCLELYDDSG+KISDLTDN +PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEK+QISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRC++EPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKVCFAA
        KNDG VKGI YFDC P HGAMVRPDKVKV F+A
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKVCFAA

A0A1S3C118 tubulin-folding cofactor B isoform X15.0e-12393.56Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLW+KCGTSVNSMCLELYDDSG+KISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEK+QISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRC++EPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKVCFAA
        KNDG VKGI YFDC PLHGAMVRPDKVKV F+A
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKVCFAA

A0A1S3C1L1 tubulin-folding cofactor B isoform X24.2e-12294.32Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLW+KCGTSVNSMCLELYDDSG+KISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEK+QISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRC++EPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        KNDG VKGI YFDC PLHGAMVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

A0A6J1DKD2 tubulin-folding cofactor B1.1e-12799.56Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCE+EPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

A0A6J1HTU0 tubulin-folding cofactor B1.9e-12295.2Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MASRLQ+IE DESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMS+ESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNS+PLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        SGGWLEDTSLVEKYQISEEAY+KRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISD YMEELCANIKVGDRCE+EPG+ RG VKFVG AESLAPGFWVGVQYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q20728 Tubulin-specific chaperone B1.4e-3742.25Show/hide
Query:  NLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGW-LEDTSLVEKYQISEEA
        N   F  + ++   MS+  +K+KL    GT+V+SM ++L+D       +LTD +  L      DGYR+H +D     VT G    +D S+VEKY++S++ 
Subjt:  NLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGW-LEDTSLVEKYQISEEA

Query:  YDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFE-SKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPG---EKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIRYFDCPP
        Y KR D+ R +K+K+  +  SA      SD   EE   NI VG+RCE+  G    +RG V +VG A     G WVGV+YDEP+GKNDG V G+RYFDC P
Subjt:  YDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFE-SKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPG---EKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIRYFDCPP

Query:  LHGAMVRPDKVKV
         +G  VRP  VKV
Subjt:  LHGAMVRPDKVKV

Q5E951 Tubulin-folding cofactor B7.8e-3340.18Show/hide
Query:  ANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEA
        ++L SF S  R+S  +++   K KL    G+  + M LELY         L  +   LG Y   DG R+H+ID   + +   G  ED S VEKY+IS+EA
Subjt:  ANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEA

Query:  YDKRDDTFRKF--KEKLASQNP---SAFESKISDTYMEE--LCANIKVGDRCEIE-PGE--KRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIR
        Y++R D+ R F  + KL   N    +  E++ S   +EE    + I VG RCE+  PG+  +RG V +VG  +   PG+W+G++YDEPLGKNDG V G R
Subjt:  YDKRDDTFRKF--KEKLASQNP---SAFESKISDTYMEE--LCANIKVGDRCEIE-PGE--KRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIR

Query:  YFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        YF+C   +GA V+P  V V
Subjt:  YFDCPPLHGAMVRPDKVKV

Q67Z52 Tubulin-folding cofactor B2.5e-10074.67Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MA+   ++E D+SV L +THANLKSF++D RFS QMS+E+VKEKLWKKCGTSVNSM LELYDDSG+K++ L+D+S PLGF+SP DG+RLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        +GGWLEDTSLVEKY ISEE Y KR D+FRKFKEK  SQNP A E+K  + YME+LCANIKVGDRC++EPGEKRG+VK+VGRAESL PG+WVG+QYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        K+DGMVKG R+F+CP L G MVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

Q99426 Tubulin-folding cofactor B1.0e-3240.64Show/hide
Query:  ANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEA
        ++L +F S+ R+S  ++I   K KL    G+  + M LELY       S L      LG Y   DG R+H+ID   + +   G  ED S VEKY IS+EA
Subjt:  ANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEA

Query:  YDKRDDTFRKF--KEKLASQNP---SAFESKISDTYMEE--LCANIKVGDRCEIE---PGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIR
        YD+R DT R F  + KL   N    +  E++ +    EE    ++I VG RCE+       +RG V +VG  +   PG+W+GV+YDEPLGKNDG V G R
Subjt:  YDKRDDTFRKF--KEKLASQNP---SAFESKISDTYMEE--LCANIKVGDRCEIE---PGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIR

Query:  YFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        YF+C   +GA V+P  V V
Subjt:  YFDCPPLHGAMVRPDKVKV

Q9D1E6 Tubulin-folding cofactor B6.0e-3340.27Show/hide
Query:  ANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEA
        ++L SF S+ R+S  ++I   K KL    G+  + M LELY       S L      LG Y   DG R+H+I  D S V  G + ED S VEKY+IS EA
Subjt:  ANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSLVEKYQISEEA

Query:  YDKRDDTFRKF---------KEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGE---KRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKG
        Y++R +T R F          E+L +Q  +    ++S+   +   + I VG RCE+   +   +RG V +VG  +   PG+WVGV+YDEPLGKNDG V G
Subjt:  YDKRDDTFRKF---------KEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGE---KRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKG

Query:  IRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
         RYF+C   +GA V+P  V V
Subjt:  IRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G10220.1 tubulin folding cofactor B1.8e-10174.67Show/hide
Query:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT
        MA+   ++E D+SV L +THANLKSF++D RFS QMS+E+VKEKLWKKCGTSVNSM LELYDDSG+K++ L+D+S PLGF+SP DG+RLHIIDLDPSSVT
Subjt:  MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVT

Query:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG
        +GGWLEDTSLVEKY ISEE Y KR D+FRKFKEK  SQNP A E+K  + YME+LCANIKVGDRC++EPGEKRG+VK+VGRAESL PG+WVG+QYDEPLG
Subjt:  SGGWLEDTSLVEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLG

Query:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV
        K+DGMVKG R+F+CP L G MVRPDKVKV
Subjt:  KNDGMVKGIRYFDCPPLHGAMVRPDKVKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCCCGATTGCAGGAGATCGAAGCTGATGAATCTGTACTCTTGCGCGTAACACATGCCAATCTCAAGTCCTTCACTTCTGATGTTCGTTTTTCCCTTCAGATGAG
CATAGAATCTGTCAAGGAAAAGCTGTGGAAAAAATGTGGTACTTCTGTAAACTCCATGTGCCTTGAACTCTATGATGACTCCGGTGCTAAAATTTCTGATTTGACGGATA
ATTCCTTGCCCTTGGGATTTTATTCCCCCCTAGATGGGTACCGGCTACATATTATTGATCTTGACCCCTCATCAGTTACTTCTGGTGGTTGGCTTGAAGATACCTCACTA
GTGGAGAAGTACCAGATTTCTGAAGAAGCTTACGATAAACGTGATGATACATTCCGAAAATTCAAGGAAAAATTGGCATCCCAGAACCCATCAGCTTTTGAAAGTAAAAT
ATCTGATACCTACATGGAAGAACTCTGTGCAAATATCAAGGTAGGTGATAGATGTGAAATTGAACCAGGGGAGAAGAGGGGTGTTGTAAAATTTGTTGGCCGGGCTGAAT
CGCTTGCTCCTGGATTTTGGGTTGGAGTTCAATATGATGAACCATTGGGGAAAAACGATGGCATGGTAAAAGGGATCCGCTATTTTGATTGTCCTCCTCTTCATGGTGCG
ATGGTTAGGCCAGACAAAGTGAAGGTTTGTTTTGCAGCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTCCCGATTGCAGGAGATCGAAGCTGATGAATCTGTACTCTTGCGCGTAACACATGCCAATCTCAAGTCCTTCACTTCTGATGTTCGTTTTTCCCTTCAGATGAG
CATAGAATCTGTCAAGGAAAAGCTGTGGAAAAAATGTGGTACTTCTGTAAACTCCATGTGCCTTGAACTCTATGATGACTCCGGTGCTAAAATTTCTGATTTGACGGATA
ATTCCTTGCCCTTGGGATTTTATTCCCCCCTAGATGGGTACCGGCTACATATTATTGATCTTGACCCCTCATCAGTTACTTCTGGTGGTTGGCTTGAAGATACCTCACTA
GTGGAGAAGTACCAGATTTCTGAAGAAGCTTACGATAAACGTGATGATACATTCCGAAAATTCAAGGAAAAATTGGCATCCCAGAACCCATCAGCTTTTGAAAGTAAAAT
ATCTGATACCTACATGGAAGAACTCTGTGCAAATATCAAGGTAGGTGATAGATGTGAAATTGAACCAGGGGAGAAGAGGGGTGTTGTAAAATTTGTTGGCCGGGCTGAAT
CGCTTGCTCCTGGATTTTGGGTTGGAGTTCAATATGATGAACCATTGGGGAAAAACGATGGCATGGTAAAAGGGATCCGCTATTTTGATTGTCCTCCTCTTCATGGTGCG
ATGGTTAGGCCAGACAAAGTGAAGGTTTGTTTTGCAGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASRLQEIEADESVLLRVTHANLKSFTSDVRFSLQMSIESVKEKLWKKCGTSVNSMCLELYDDSGAKISDLTDNSLPLGFYSPLDGYRLHIIDLDPSSVTSGGWLEDTSL
VEKYQISEEAYDKRDDTFRKFKEKLASQNPSAFESKISDTYMEELCANIKVGDRCEIEPGEKRGVVKFVGRAESLAPGFWVGVQYDEPLGKNDGMVKGIRYFDCPPLHGA
MVRPDKVKVCFAA