; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS016995 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS016995
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description10 kDa chaperonin, mitochondrial-like
Genome locationscaffold197:489636..490606
RNA-Seq ExpressionMS016995
SyntenyMS016995
Gene Ontology termsGO:0051085 - chaperone cofactor-dependent protein refolding (biological process)
GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
GO:0051087 - chaperone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011032 - GroES-like superfamily
IPR020818 - GroES chaperonin family
IPR037124 - GroES chaperonin superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_007215182.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial [Prunus persica]2.3e-3285.54Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVL+E+IVPP+KT TGILLPEKS+KLNSGKV++VGPGTRD+EG+ IP TVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDK+Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

XP_022154455.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Momordica charantia]4.5e-36100Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQ
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQ
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQ

XP_022931931.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]9.3e-3490.36Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+SVGPGTRDR+GN+IPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLG+KQ+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

XP_022966634.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]1.2e-3390.36Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+SVGPGTRDR+GN+IPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLG+KQ+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

XP_038881343.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Benincasa hispida]9.3e-3490.36Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+S+GPG RDREG +IPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLG+KQ+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DJN1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like2.2e-36100Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQ
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQ
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQ

A0A6J1EUZ7 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like4.5e-3490.36Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+SVGPGTRDR+GN+IPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLG+KQ+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

A0A6J1HUD0 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like5.9e-3490.36Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+SVGPGTRDR+GN+IPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLG+KQ+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

A0A6J5WYZ0 Uncharacterized protein1.1e-3285.54Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVL+E+IVPP+KT TGILLPEKS+KLNSGKV++VGPGTRD+EG+ IP TVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDK+Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

M5WT23 Uncharacterized protein1.1e-3285.54Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        MAKRLVPLLNRVL+E+IVPP+KT TGILLPEKS+KLNSGKV++VGPGTRD+EG+ IP TVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDK+Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59804 10 kDa heat shock protein, mitochondrial5.3e-1650.6Show/hide
Query:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        AK +VPLL+R+L+++I    KT +GI LPEKS  KL+ G+V+SVG G  ++EG L   +V  GD VLLP YGG+ +K+G+++Y
Subjt:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

P34893 10 kDa chaperonin, mitochondrial2.9e-3071.08Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        M KRL+P  NR+L+++++ PAKT +GILLPEKSSKLNSGKV++VGPG+RD++G LIPV+VKEGDTVLLPEYGGT+VKLG+ +Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

P38910 10 kDa heat shock protein, mitochondrial3.5e-1548.81Show/hide
Query:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQYV
        AK +VPL++RVL+++I   AKT +G+ LPEK+  KLN  +V++VGPG  D  GN +   VK GD VL+P++GG+ +KLG+   V
Subjt:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQYV

Q96539 10 kDa chaperonin5.0e-3071.08Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        M KRL+P  NR+L++ ++ PAKT +GILLPEK+SKLNSGKV++VGPG+RD++G LIPV+VKEGDTVLLPEYGGT+VKLG+K+Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

Q9W6X3 10 kDa heat shock protein, mitochondrial3.8e-1446.34Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        ++ +PL +RVL+E+++    T  GI+LPEKS  K+    V++VGPG+ +++G + P++VK G+ VLLP+YGGT+V L DK Y
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14980.1 chaperonin 102.1e-3171.08Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY
        M KRL+P  NR+L+++++ PAKT +GILLPEKSSKLNSGKV++VGPG+RD++G LIPV+VKEGDTVLLPEYGGT+VKLG+ +Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQY

AT1G23100.1 GroES-like family protein2.4e-3275Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQYV
        MAKRL+P LNRVL+EKI+PP+KT +GILLPEKSS+LNSG+V++VGPG RDR GNLIPV+VKEGD VLLPE+GGT+VKLG+K+++
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQYV

AT5G20720.1 chaperonin 205.5e-0842.11Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G V++VGPG+ D EG + P+ V  G TVL  +Y G + K
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK

AT5G20720.2 chaperonin 205.5e-0842.11Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G V++VGPG+ D EG + P+ V  G TVL  +Y G + K
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK

AT5G20720.3 chaperonin 205.5e-0842.11Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G V++VGPG+ D EG + P+ V  G TVL  +Y G + K
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKS-SKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAACGTTTGGTCCCGTTGCTGAATCGCGTTTTGATCGAGAAGATCGTGCCCCCTGCCAAAACCAACACTGGCATTTTGCTCCCTGAGAAGTCCAGTAAGTTGAA
CTCTGGAAAAGTTCTCTCTGTTGGTCCTGGAACTCGTGACAGAGAGGGAAACCTTATTCCAGTTACTGTAAAGGAAGGTGACACCGTCCTCCTGCCAGAATATGGAGGAA
CTGAAGTCAAACTTGGAGATAAGCAGTATGTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAACGTTTGGTCCCGTTGCTGAATCGCGTTTTGATCGAGAAGATCGTGCCCCCTGCCAAAACCAACACTGGCATTTTGCTCCCTGAGAAGTCCAGTAAGTTGAA
CTCTGGAAAAGTTCTCTCTGTTGGTCCTGGAACTCGTGACAGAGAGGGAAACCTTATTCCAGTTACTGTAAAGGAAGGTGACACCGTCCTCCTGCCAGAATATGGAGGAA
CTGAAGTCAAACTTGGAGATAAGCAGTATGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNTGILLPEKSSKLNSGKVLSVGPGTRDREGNLIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGDKQYV