; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS017232 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS017232
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionProline transporter 1
Genome locationscaffold33:873375..873863
RNA-Seq ExpressionMS017232
SyntenyMS017232
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BAS70261.1 Os01g0136050, partial [Oryza sativa Japonica Group]9.0e-3364.33Show/hide
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        +SM   SGF +S LGTVTV TPFSMLAFT STLAFSGSLN  MN PLLRS  CHLSF SS S L  PLI  TLPSSTSTFTSSFL PGRSALKT  SGVS
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        FQS R LAKA VS +E   +A   E     PS GS  S+ KGS  LLR    ++G++
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CAG1834096.1 unnamed protein product [Musa acuminata subsp. malaccensis]1.5e-3261.39Show/hide
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        MDL SGF +  LGTVTV TPFSM AFT STLAFSG  NL  N PLLRS  C +S FSSCS L SPLI RT PSSTST TSSFL PG+SAL T ASGVSFQ
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        S R  A A+ S     A     E+  G P  GS  S EKGSKM  RR P   G++D+L
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KVI11914.1 hypothetical protein Ccrd_009654, partial [Cynara cardunculus var. scolymus]4.9e-3966.67Show/hide
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        +GFF+S  GTV V TPFS+ AFT S  AFSG+LNLL+NFPLLRS LCH+SF SS S  LSPLIC+ L SSTSTFTSSFLIPGRSALKT ASGVSFQS RV
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          KAEVS  E    ++  E+G G   NGS  S   GSKML RRPPK LG+ D+
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RWR97332.1 hypothetical protein CKAN_02676000 [Cinnamomum micranthum f. kanehirae]6.9e-3376.99Show/hide
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        MSM L+SGF +  LGTVTV TPFS+ AFTSSTLAFSG+LN L N PLL S  CHLSFFSS S LLSPLI RTLPSS+STFTSSF  PGRSALKTWASGVS
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        FQSI+ L KA+VS
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VFQ82571.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]2.7e-3765.22Show/hide
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        MDL SGFF+S LGTVTV TPFSM AFT S  AFSGS N   N PLLRS  CHLS FSS S LLSPLIC+ LPSSTSTFTSSF  PGRSAL TW SGVSFQ
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        SIR  A A+VS      L       NGNP  GS  S E GS   LR RPPK LGI ++L Q
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KSC0 Uncharacterized protein1.6e-5982.72Show/hide
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        MSMDLISGFFSSILGT+TVRTPFSMLAFTSSTLAFSGSLNLLMNFP LRSILCHLSFFSSCS LLSPLIC+TLPSSTST TSSFLIPGRSALK WA GVS
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        FQS+RVLAKAEVS AEE ALA   E   G PS GS  S+EKGSK LLRRPPKMLG   M+++
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A0A0A8YU32 Uncharacterized protein1.5e-3364.05Show/hide
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        MDL SGF +S LGTVTV TPFS  A   S LAFSGS N   N PLLRS  CHLSFFSSCS L SPLI RTLPSS STFTSSF  PG SALKT ASGVSFQ
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        S+R  AKA VSE EE    N + L  G P  GS  S +KGS  L RR   ++G
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A0A103YMN4 Uncharacterized protein (Fragment)2.4e-3966.67Show/hide
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        +GFF+S  GTV V TPFS+ AFT S  AFSG+LNLL+NFPLLRS LCH+SF SS S  LSPLIC+ L SSTSTFTSSFLIPGRSALKT ASGVSFQS RV
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          KAEVS  E    ++  E+G G   NGS  S   GSKML RRPPK LG+ D+
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A0A484M1B1 Uncharacterized protein1.3e-3765.22Show/hide
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        MDL SGFF+S LGTVTV TPFSM AFT S  AFSGS N   N PLLRS  CHLS FSS S LLSPLIC+ LPSSTSTFTSSF  PGRSAL TW SGVSFQ
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        SIR  A A+VS      L       NGNP  GS  S E GS   LR RPPK LGI ++L Q
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A0A7C9D9Y3 Uncharacterized protein9.0e-3965.19Show/hide
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        M   SGFFSS LGTVTV TPFS+ AFTSS LAFSG  N   N PL RS  CHLSFFSSCS +LSPLI R LPSSTSTFTSSFL PGRS L TWASGVSFQ
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Query:  SIRVLAKAEVSEAEEWALANAVELGNGNPSNGSHTSSEKGSKMLLRRPPKMLGINDML
        S  VL   +VS A E          + NPSNGS TS E GS  L+ R PK LGI+DM+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAATGGACTTGATTTCAGGCTTCTTCTCTTCCATTTTGGGCACTGTCACAGTCAGAACTCCATTCTCCATGCTGGCCTTCACCTCCTCAACTTTGGCATTCTCCGG
CAGCCTGAATCTCCTCATGAACTTTCCACTGCTCCGCTCGATTCTGTGCCACTTGTCGTTCTTCTCCTCCTGCTCTTTCCTTCTCTCCCCACTGATCTGCAGAACTCTTC
CTTCTTCAACCTCCACTTTCACTTCCTCCTTTTTGATCCCTGGAAGATCGGCCTTGAAGACGTGGGCTTCTGGGGTCTCCTTCCAGTCGATTCGAGTGTTGGCAAAAGCA
GAGGTTTCAGAAGCAGAGGAATGGGCGTTGGCCAATGCGGTGGAATTGGGAAATGGGAACCCATCGAACGGATCCCATACATCCAGCGAGAAGGGGTCGAAGATGTTGCT
GCGGCGGCCACCGAAAATGCTTGGAATCAACGACATGCTTCTTCAAATT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAATGGACTTGATTTCAGGCTTCTTCTCTTCCATTTTGGGCACTGTCACAGTCAGAACTCCATTCTCCATGCTGGCCTTCACCTCCTCAACTTTGGCATTCTCCGG
CAGCCTGAATCTCCTCATGAACTTTCCACTGCTCCGCTCGATTCTGTGCCACTTGTCGTTCTTCTCCTCCTGCTCTTTCCTTCTCTCCCCACTGATCTGCAGAACTCTTC
CTTCTTCAACCTCCACTTTCACTTCCTCCTTTTTGATCCCTGGAAGATCGGCCTTGAAGACGTGGGCTTCTGGGGTCTCCTTCCAGTCGATTCGAGTGTTGGCAAAAGCA
GAGGTTTCAGAAGCAGAGGAATGGGCGTTGGCCAATGCGGTGGAATTGGGAAATGGGAACCCATCGAACGGATCCCATACATCCAGCGAGAAGGGGTCGAAGATGTTGCT
GCGGCGGCCACCGAAAATGCTTGGAATCAACGACATGCTTCTTCAAATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSMDLISGFFSSILGTVTVRTPFSMLAFTSSTLAFSGSLNLLMNFPLLRSILCHLSFFSSCSFLLSPLICRTLPSSTSTFTSSFLIPGRSALKTWASGVSFQSIRVLAKA
EVSEAEEWALANAVELGNGNPSNGSHTSSEKGSKMLLRRPPKMLGINDMLLQI