; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS017390 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS017390
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionMitochondrial glycoprotein family protein
Genome locationscaffold1474:50091..52734
RNA-Seq ExpressionMS017390
SyntenyMS017390
Gene Ontology termsGO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
InterPro domainsIPR003428 - Mitochondrial glycoprotein
IPR036561 - Mitochondrial glycoprotein superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6603196.1 hypothetical protein SDJN03_03805, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-8783.92Show/hide
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XP_022153881.1 mitochondrial acidic protein mam33 [Momordica charantia]7.9e-107100Show/hide
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XP_022928687.1 uncharacterized protein LOC111435528 [Cucurbita moschata]2.4e-8784.42Show/hide
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XP_022967898.1 uncharacterized protein LOC111467274 [Cucurbita maxima]6.3e-8884.92Show/hide
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XP_023544221.1 uncharacterized protein LOC111803860 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.2e-8884.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BK83 uncharacterized protein LOC103490527 isoform X13.5e-7677.84Show/hide
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A0A2H5QH97 Uncharacterized protein9.8e-7169.7Show/hide
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        MP+A+ I RK +KAL DL LLKIL SEITHELSS RFQ ++SG   DF VE+D+P+SQDVVLRRK ESGEEVAVSAL GP  F RE  FPRE+LMK+C++
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A0A6J1DM07 mitochondrial acidic protein mam333.8e-107100Show/hide
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A0A6J1EKM2 uncharacterized protein LOC1114355281.2e-8784.42Show/hide
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A0A6J1HWH3 uncharacterized protein LOC1114672743.0e-8884.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O94675 Mitochondrial acidic protein mam331.0e-0833.08Show/hide
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        E  FP E L +     I +SKPG G+++ F+    +D      F I N Y+ +    L S            Y GP F  LDP LQD    YL  R ++E
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Query:  SLTNFLLLHVHKKEQGQYLNWLQNLESLRK
        SL++F++     KE  +Y+NWL+++    K
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P40513 Mitochondrial acidic protein MAM333.3e-0745.45Show/hide
Query:  VYRGPFFSSLDPRLQDALKDYLISRGVEESLTNFLLLHVHKKEQGQYLNWLQNLE
        VY GP FS+LD  LQ++L+ YL SRGV E L +F+  +   KE  +Y++WL+ ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41600.1 Mitochondrial glycoprotein family protein1.5e-3147.33Show/hide
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        + KPG+ SILQF C V E   G S F I +AY+++S  +  SS Y   FF
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AT2G41600.2 Mitochondrial glycoprotein family protein6.8e-3247.37Show/hide
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        M + N + ++  KA+ + DLLKILQSEI HE+S  RFQ  E+G   DF ++ DSP+SQD+VL+R+ +SGE+V VSAL    P+    +  FPRE   K+C
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        + KPG+ SILQF C V E   G S F I +AY+++S  +  SS Y   FF S
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AT2G41600.3 Mitochondrial glycoprotein family protein1.0e-5151.76Show/hide
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        M + N + ++  KA+ + DLLKILQSEI HE+S  RFQ  E+G   DF ++ DSP+SQD+VL+R+ +SGE+V VSAL    P+    +  FPRE   K+C
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        + KPG+ SILQF C V E   G S F I +AY+++S  +  SS Y   FFS +DP+L  AL+ YLIS+GV E LTNFLL H++KKEQ QY+NWL+ LES
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AT2G41600.4 Mitochondrial glycoprotein family protein1.5e-3147.33Show/hide
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        M + N + ++  KA+ + DLLKILQSEI HE+S  RFQ  E+G   DF ++ DSP+SQD+VL+R+ +SGE+V VSAL    P+    +  FPRE   K+C
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        + KPG+ SILQF C V E   G S F I +AY+++S  +  SS Y   FF
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AT2G41600.5 Mitochondrial glycoprotein family protein1.0e-5151.76Show/hide
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        M + N + ++  KA+ + DLLKILQSEI HE+S  RFQ  E+G   DF ++ DSP+SQD+VL+R+ +SGE+V VSAL    P+    +  FPRE   K+C
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        + KPG+ SILQF C V E   G S F I +AY+++S  +  SS Y   FFS +DP+L  AL+ YLIS+GV E LTNFLL H++KKEQ QY+NWL+ LES
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCAGAGCGACGAAAGTGGCTGTTCCAGAGATTTCGTGGTGGAACATGACTCGCCCAAGTCCCAAGACGTGGTTTTACGGAGGAAATTGGAGTCCGGTGAGGAGGTTGCTG
TCTCTGCCCTGTCGGGTCCTCTCAGATTCGGAAGAGAAGGTGCGTTTCCGAGGGAGATTTTGATGAAGATTTGTGTGAGTAAGCCCGGAGTTGGCTCCATTTTGCAGTTT
GATTGTGGGGTTTCAGAGGATCATCATGGTGGGTCTCCGTTCAAAATCTACAATGCATATTATCTCCAGTCGTCGGCTAATTTGGGTTCTTCTGTTTATAGAGGCCCTTT
TTTCAGCTCATTAGATCCTCGGTTACAAGACGCGCTCAAGGACTACCTAATCAGTAGAGGCGTTGAAGAAAGTCTCACCAACTTCCTTCTACTTCACGTGCATAAAAAAG
AGCAAGGTCAGTACTTGAACTGGTTGCAAAACCTCGAGTCATTGCGAAAGGGCAACCGAACGAACTTTAACGACTTCACATTGTACCCCGGGGGCCGTTATCTCTTTACT
AGCAATCACCCTTACCTCATTTTCATATGGGAAGATAAATGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPRANQIFRKARKALHDLDLLKILQSEITHELSSTRFQSDESGCSRDFVVEHDSPKSQDVVLRRKLESGEEVAVSALSGPLRFGREGAFPREILMKICVSKPGVGSILQF
DCGVSEDHHGGSPFKIYNAYYLQSSANLGSSVYRGPFFSSLDPRLQDALKDYLISRGVEESLTNFLLLHVHKKEQGQYLNWLQNLESLRKGNRTNFNDFTLYPGGRYLFT
SNHPYLIFIWEDKC