; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS017470 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS017470
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold435:795151..795612
RNA-Seq ExpressionMS017470
SyntenyMS017470
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022136035.1 uncharacterized protein LOC111007824 [Momordica charantia]3.3e-77100Show/hide
Query:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE
        AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE
Subjt:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE

Query:  PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_022938336.1 uncharacterized protein LOC111444467 [Cucurbita moschata]2.1e-5272.89Show/hide
Query:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH-
        A  SS KRLR+DS DS+SD+PEVKR++DDLL LLED+DPDP  QDLDSVI+SFA+EISPVSSPP  PAA  ESLPELGYLL+ASDDELGLPPS+ STSH 
Subjt:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH-

Query:  ----------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
                  A   SS +GEIWGFED IP Y+SFELGEG RFY N+TEYVA DGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  ----------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_022993320.1 uncharacterized protein LOC111489362 [Cucurbita maxima]8.7e-5475.46Show/hide
Query:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS-----
        SS KRLRVDS DS+SDSPEVKR++DDLLDLL+D+DPDP  QDLDSVI+SFA+EISPVSSPP  PAA  ESLPELGYLLLASDDELGLPPSD STS     
Subjt:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS-----

Query:  ------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
               A   SS +GEIWGFED IP Y+SFELGEGERFY +++EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  ------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_023538923.1 uncharacterized protein LOC111799678 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.7e-5272.29Show/hide
Query:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH-
        A  SS KRLR+DS DS+SD+PEVKR++DDLL LL+D+DPDP  QDLDSVI+SFA+EISPVSSPP  PAA  ESLPELGYLL+ASDDELGLPPS+ STSH 
Subjt:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH-

Query:  ----------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
                  A   SS +GEIWGFED IP Y+SFELGEG RFY N+TEYVA DGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  ----------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

XP_038885926.1 uncharacterized protein LOC120076234 [Benincasa hispida]2.1e-5573.33Show/hide
Query:  ASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPP---AAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH--
        +SS KRLRVDS DS+SDSPEVKR+RDDLL LL+D+DPDP  QDLDS+I+SFA+EISPVSSPP PP     +SLPELGYLLLASDDELGLPPSD STSH  
Subjt:  ASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPP---AAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH--

Query:  ---------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
                 A   SS IGEIWGFED +P Y++FELGEGERFY + TEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  ---------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K873 Uncharacterized protein4.8e-5072.22Show/hide
Query:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE---
        S  KRLRVDS DS+SDSPEVKR+RDDLL LL+DSDPDP  QDLDS+I+SFA+EISPVSSPP PPAA S  ELGYLLLASDDELGLPPS  STSH  +   
Subjt:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE---

Query:  --------PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFEL-GEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
                 SS IG+IWGFED +P Y++ EL G+GERFY NE EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  --------PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFEL-GEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A1S3BDY1 uncharacterized protein LOC1034886145.7e-5174.07Show/hide
Query:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE---
        S  KR RVDS DS+SDSPEVKR+RDDLL LL+DSDPDP  QDLDSVI+SFA+EISPVSSPP PPAA S  ELGYLLLASDDELGLPPSD STSH  E   
Subjt:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE---

Query:  --------PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFEL-GEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
                 SS IGEIWGFED +P Y++ EL G GERFY NE EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  --------PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFEL-GEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A6J1C2R0 uncharacterized protein LOC1110078241.6e-77100Show/hide
Query:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE
        AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE
Subjt:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPE

Query:  PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
        PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  PSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A6J1H3R7 uncharacterized protein LOC1114444671.0e-5272.89Show/hide
Query:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH-
        A  SS KRLR+DS DS+SD+PEVKR++DDLL LLED+DPDP  QDLDSVI+SFA+EISPVSSPP  PAA  ESLPELGYLL+ASDDELGLPPS+ STSH 
Subjt:  AAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSH-

Query:  ----------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
                  A   SS +GEIWGFED IP Y+SFELGEG RFY N+TEYVA DGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  ----------APEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

A0A6J1JY78 uncharacterized protein LOC1114893624.2e-5475.46Show/hide
Query:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS-----
        SS KRLRVDS DS+SDSPEVKR++DDLLDLL+D+DPDP  QDLDSVI+SFA+EISPVSSPP  PAA  ESLPELGYLLLASDDELGLPPSD STS     
Subjt:  SSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAA--ESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS-----

Query:  ------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS
               A   SS +GEIWGFED IP Y+SFELGEGERFY +++EYVAFDGLFEHSDVYSVFS
Subjt:  ------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13360.1 unknown protein5.1e-2846.99Show/hide
Query:  ASSKKRLRVDSHD-SDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPL---PPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS--
        ++ KKR+R +S D +  DSPEVKR+RDDL D+L+DSDP+P +QDLDSV+KSF +E+S V++        A E+ P+LGYLL ASDDELGLPP    +   
Subjt:  ASSKKRLRVDSHD-SDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPL---PPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS--

Query:  ---------------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSD
                        A   SS I EIWGFED +  Y   + G G    G+  +YVA +GLFE SD
Subjt:  ---------------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSD

AT1G13360.2 unknown protein4.8e-2644.85Show/hide
Query:  ASSKKRLRVDSHD-SDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPL---PPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS--
        ++ KKR+R +S D +  DSPEVKR+RDDL D+L+DSDP+P +QDLDSV+KSF +E+S V++        A E+ P+LGYLL ASDDELGLPP    +   
Subjt:  ASSKKRLRVDSHD-SDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPL---PPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS--

Query:  ---------------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHS
                        A   SS I EIWGFED +  Y   + G G    G+  +YVA +G F ++
Subjt:  ---------------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHS

AT1G13360.3 unknown protein4.8e-2646.39Show/hide
Query:  ASSKKRLRVDSHD-SDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPL---PPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS--
        ++ KKR+R +S D +  DSPEVKR+RDDL D+L+DSDP+P +QDLDSV+KSF +E+S V++        A E+ P+LGYLL ASDDELGLPP    +   
Subjt:  ASSKKRLRVDSHD-SDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPL---PPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTS--

Query:  ---------------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGL-FEHS
                        A   SS I EIWGFED +  Y   + G G    G+  +YVA +GL F HS
Subjt:  ---------------HAPEPSSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGL-FEHS

AT3G25870.1 unknown protein6.3e-1842.28Show/hide
Query:  DSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPP---------------SDGSTSHAPEP
        D DSP+VKR+RDDL D   DS  DP +QDLDSV+KSF  E+S  ++     + E+ P+LGYL  ASDDELGLPP               +      A   
Subjt:  DSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPP---------------SDGSTSHAPEP

Query:  SSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYS
        SSE+GE+ GFED +  +   +LG+   F     EY  FDG  +  D++S
Subjt:  SSEIGEIWGFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GCCGCCGCCGCCTCCTCCAAGAAACGCCTCCGAGTCGACTCACACGACTCGGACTCCGACTCGCCGGAGGTCAAGCGAATCAGAGACGACCTCCTCGACCTCCTCGAGGA
TTCCGACCCCGATCCCGCCGCCCAGGATCTGGATTCCGTCATCAAGAGTTTCGCCGAGGAGATCTCCCCGGTCTCCTCGCCGCCACTGCCGCCCGCCGCCGAGTCTTTGC
CGGAGCTCGGCTACCTTCTGCTGGCGTCCGACGACGAGCTCGGCCTGCCGCCGTCGGACGGCTCCACCAGCCACGCGCCGGAACCCTCGTCGGAGATCGGAGAGATTTGG
GGATTTGAGGATCCGATTCCGGGTTACGACTCGTTCGAGTTGGGGGAGGGAGAGAGATTTTACGGCAACGAGACGGAATATGTGGCGTTCGATGGACTGTTTGAACATTC
CGATGTGTACTCCGTTTTCTCG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCGCCGCCGCCTCCTCCAAGAAACGCCTCCGAGTCGACTCACACGACTCGGACTCCGACTCGCCGGAGGTCAAGCGAATCAGAGACGACCTCCTCGACCTCCTCGAGGA
TTCCGACCCCGATCCCGCCGCCCAGGATCTGGATTCCGTCATCAAGAGTTTCGCCGAGGAGATCTCCCCGGTCTCCTCGCCGCCACTGCCGCCCGCCGCCGAGTCTTTGC
CGGAGCTCGGCTACCTTCTGCTGGCGTCCGACGACGAGCTCGGCCTGCCGCCGTCGGACGGCTCCACCAGCCACGCGCCGGAACCCTCGTCGGAGATCGGAGAGATTTGG
GGATTTGAGGATCCGATTCCGGGTTACGACTCGTTCGAGTTGGGGGAGGGAGAGAGATTTTACGGCAACGAGACGGAATATGTGGCGTTCGATGGACTGTTTGAACATTC
CGATGTGTACTCCGTTTTCTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
AAAASSKKRLRVDSHDSDSDSPEVKRIRDDLLDLLEDSDPDPAAQDLDSVIKSFAEEISPVSSPPLPPAAESLPELGYLLLASDDELGLPPSDGSTSHAPEPSSEIGEIW
GFEDPIPGYDSFELGEGERFYGNETEYVAFDGLFEHSDVYSVFS