; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS017491 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS017491
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontranscriptional regulator SUPERMAN-like
Genome locationscaffold373:8593..9325
RNA-Seq ExpressionMS017491
SyntenyMS017491
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148508.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucumis sativus]1.9e-7966.67Show/hide
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           +ST  +++   NG+Q+  LDLELRLGHGP ++T   +EKGE KI + EA  L+ + SD
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XP_008465962.1 PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucumis melo]5.9e-8166.67Show/hide
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        MAAE  LG QY  SL H ++    G+N  G+NPMQTP+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL H
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Query:  QAP---ANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGG-LCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAA
        QAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +   P+TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST   + FP ND++HR  
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             T+  + SMEN N     + LDLELRLGHGP ++T   +EKGE K+ N EA  L+++ SD
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XP_022159587.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Momordica charantia]6.7e-125100Show/hide
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        PSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAIS
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        MENGNQELDLELRLGHGPSATTL
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XP_022967174.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucurbita maxima]2.7e-7369.43Show/hide
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        ELG Q+  SL     +G NL GLNPMQTP+VV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAP +NP
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Query:  IKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFS-
         KPSSSS S S+SFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNS           +N  I+ P SLFSMS+HSFN  +PST    GFP NDH      G   +NFS 
Subjt:  IKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFS-

Query:  -----AISMENGNQELDLELRLGHGPSAT
             + SMENGNQELDLELRLGHGP +T
Subjt:  -----AISMENGNQELDLELRLGHGPSAT

XP_038888762.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Benincasa hispida]1.4e-8269.5Show/hide
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        ELG QY  SL H  +    G+N   LNPMQ P+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARLHQAP   
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        +NP+KPSS   S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G  IN P+TLNAYIHSPSSLFSMSHHSFN   PS+   S  FP ND DHR  T    
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Query:  -SSSTNFSAISM--ENGNQELDLELRLGHGPSATT---LEKGEKICNVEAEYLRRKRSD
         S   +FS+ S    NG+QELDLELRLGHGP ++T   +EKG+KI N+EA  LR++ SD
Subjt:  -SSSTNFSAISM--ENGNQELDLELRLGHGPSATT---LEKGEKICNVEAEYLRRKRSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein9.2e-8066.67Show/hide
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        MAAE  LG QY  SL H ++    G+N  G+NPMQTP+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL H
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        QAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +    +TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST     FP ND +HR  
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Query:  TGSSSTNFSAISMENGNQE--LDLELRLGHGPSATT---LEKGE-KICNVEAEYLRRKRSD
           +ST  +++   NG+Q+  LDLELRLGHGP ++T   +EKGE KI + EA  L+ + SD
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like2.9e-8166.67Show/hide
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Query:  TGSSSTNFSAISMENGN-----QELDLELRLGHGPSATT---LEKGE-KICNVEAEYLRRKRSD
             T+  + SMEN N     + LDLELRLGHGP ++T   +EKGE K+ N EA  L+++ SD
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like2.9e-8166.67Show/hide
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        MAAE  LG QY  SL H ++    G+N  G+NPMQTP+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL H
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Query:  QAP---ANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGG-LCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAA
        QAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +   P+TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST   + FP ND++HR  
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Query:  TGSSSTNFSAISMENGN-----QELDLELRLGHGPSATT---LEKGE-KICNVEAEYLRRKRSD
             T+  + SMEN N     + LDLELRLGHGP ++T   +EKGE K+ N EA  L+++ SD
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A0A6J1E087 transcriptional regulator SUPERMAN-like3.2e-125100Show/hide
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        MAAELGLQYSLVHRNDKGRNLEGLNPMQTPEVVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIK
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Query:  PSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAIS
        PSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAIS
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Query:  MENGNQELDLELRLGHGPSATTL
        MENGNQELDLELRLGHGPSATTL
Subjt:  MENGNQELDLELRLGHGPSATTL

A0A6J1HW10 transcriptional regulator SUPERMAN1.3e-7369.43Show/hide
Query:  ELGLQY--SLVHRNDKGRNLEGLNPMQTPEVV--VDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAP-ANP
        ELG Q+  SL     +G NL GLNPMQTP+VV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAP +NP
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Query:  IKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFS-
         KPSSSS S S+SFIIP PDFNGGGLCLLYQFPNPNS           +N  I+ P SLFSMS+HSFN  +PST    GFP NDH      G   +NFS 
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Query:  -----AISMENGNQELDLELRLGHGPSAT
             + SMENGNQELDLELRLGHGP +T
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 101.0e-1971.01Show/hide
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        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSS
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN1.8e-1637.88Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTT
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL             SPSSSS+   P+P            +PNPN S   M N P  
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTT

Query:  LNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDH--DHRAATGSSS--------TNFSA------------ISME-------NGNQELDLELRLG
             HSP +LF       +    + L  S  P + H  ++   T  SS        T F++            IS+E          Q+LDLELRLG
Subjt:  LNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDH--DHRAATGSSS--------TNFSA------------ISME-------NGNQELDLELRLG

Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS5.9e-1560.29Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSP
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REFKSAQALGGHMNVHRRDRARL Q   +P     ++P
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSP

Q9SLB8 Zinc finger protein 112.5e-1336.26Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPA--------------NPIKPSSSSPSSSSSFIIP--------TPDFNGGGLCLLYQFPNPN
        WPP++YTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRA+L Q P+              NP   SSSS S++++ + P        T  F      LL    +  
Subjt:  WPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPA--------------NPIKPSSSSPSSSSSFIIP--------TPDFNGGGLCLLYQFPNPN

Query:  SSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGH
        S GG+M++R    +   +  S     S     H +   +   G   N  D +            +S+ N NQ LDLELRLG+
Subjt:  SSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGH

Q9SR34 Transcriptional regulator TAC17.7e-0750Show/hide
Query:  RSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSPSSSSSFI
        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q      K    + S +S  +
Subjt:  RSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSPSSSSSFI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 107.3e-2171.01Show/hide
Query:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSS
        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSS
Subjt:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSS

AT2G42410.1 zinc finger protein 111.8e-1436.26Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPA--------------NPIKPSSSSPSSSSSFIIP--------TPDFNGGGLCLLYQFPNPN
        WPP++YTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRA+L Q P+              NP   SSSS S++++ + P        T  F      LL    +  
Subjt:  WPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPA--------------NPIKPSSSSPSSSSSFIIP--------TPDFNGGGLCLLYQFPNPN

Query:  SSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGH
        S GG+M++R    +   +  S     S     H +   +   G   N  D +            +S+ N NQ LDLELRLG+
Subjt:  SSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGH

AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.3e-1737.88Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTT
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL             SPSSSS+   P+P            +PNPN S   M N P  
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTT

Query:  LNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDH--DHRAATGSSS--------TNFSA------------ISME-------NGNQELDLELRLG
             HSP +LF       +    + L  S  P + H  ++   T  SS        T F++            IS+E          Q+LDLELRLG
Subjt:  LNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDH--DHRAATGSSS--------TNFSA------------ISME-------NGNQELDLELRLG

AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.4e-2741.09Show/hide
Query:  EVVVDDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAP----------ANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTP
        E + DDD+SWEV+AF +DT  N+ GTTWPPRSYTC +CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ               +  S + P  +++ II + 
Subjt:  EVVVDDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAP----------ANPIKPSSSSPSSSSSFIIPTP

Query:  DFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHL-MPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGH
          N  GL   YQ  NP+   G+  N    +N Y    ++ F  S+  F+ L  P  +PP     +  D  +         +++       ELDLELRLGH
Subjt:  DFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHL-MPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGH

Query:  GP
         P
Subjt:  GP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein4.2e-1660.29Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSP
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REFKSAQALGGHMNVHRRDRARL Q   +P     ++P
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFKSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPANPIKPSSSSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTGAACTAGGCCTTCAATACTCTTTGGTTCATCGGAACGACAAGGGACGGAATCTGGAGGGTTTAAACCCTATGCAAACGCCTGAGGTGGTTGTCGATGACGA
CGACTCGTGGGAAGTCAGAGCTTTTGCTGAGGACACGGCTAATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATTGTAGGAGAGAGTTCAAGTCTG
CCCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGCCGCGATCGAGCTCGGCTCCACCAAGCCCCGGCCAACCCTATCAAACCCTCTTCCTCTTCTCCATCCTCCAGTAGT
TCTTTTATCATCCCAACTCCTGATTTTAATGGTGGGGGGCTATGCCTTCTCTACCAATTCCCAAACCCTAATAGTAGCGGTGGGATGATGATCAATAGGCCTACGACTTT
AAATGCTTATATTCACTCACCCTCTTCTCTTTTCTCCATGTCCCATCATTCCTTCAACCACTTGATGCCCTCAACCTTGCCACCCTCGGGTTTCCCAGCGAACGACCACG
ACCACCGTGCCGCTACTGGATCAAGTAGTACTAATTTCTCAGCAATATCTATGGAAAATGGGAACCAAGAGCTTGATCTAGAGCTGAGGCTTGGACATGGCCCTTCAGCT
ACAACTCTAGAAAAGGGAGAGAAGATCTGTAATGTGGAAGCTGAATATTTGAGGAGGAAGAGATCAGAT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCTGAACTAGGCCTTCAATACTCTTTGGTTCATCGGAACGACAAGGGACGGAATCTGGAGGGTTTAAACCCTATGCAAACGCCTGAGGTGGTTGTCGATGACGA
CGACTCGTGGGAAGTCAGAGCTTTTGCTGAGGACACGGCTAATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCTTACACTTGCACTTATTGTAGGAGAGAGTTCAAGTCTG
CCCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGCCGCGATCGAGCTCGGCTCCACCAAGCCCCGGCCAACCCTATCAAACCCTCTTCCTCTTCTCCATCCTCCAGTAGT
TCTTTTATCATCCCAACTCCTGATTTTAATGGTGGGGGGCTATGCCTTCTCTACCAATTCCCAAACCCTAATAGTAGCGGTGGGATGATGATCAATAGGCCTACGACTTT
AAATGCTTATATTCACTCACCCTCTTCTCTTTTCTCCATGTCCCATCATTCCTTCAACCACTTGATGCCCTCAACCTTGCCACCCTCGGGTTTCCCAGCGAACGACCACG
ACCACCGTGCCGCTACTGGATCAAGTAGTACTAATTTCTCAGCAATATCTATGGAAAATGGGAACCAAGAGCTTGATCTAGAGCTGAGGCTTGGACATGGCCCTTCAGCT
ACAACTCTAGAAAAGGGAGAGAAGATCTGTAATGTGGAAGCTGAATATTTGAGGAGGAAGAGATCAGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SFIIPTPDFNGGGLCLLYQFPNPNSSGGMMINRPTTLNAYIHSPSSLFSMSHHSFNHLMPSTLPPSGFPANDHDHRAATGSSSTNFSAISMENGNQELDLELRLGHGPSA
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