; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS017517 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS017517
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionprotein SAMBA isoform X2
Genome locationscaffold373:233708..235003
RNA-Seq ExpressionMS017517
SyntenyMS017517
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022131247.1 protein SAMBA isoform X1 [Momordica charantia]1.0e-37100Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]4.7e-3897.78Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
XP_022149249.1 protein SAMBA-like isoform X1 [Momordica charantia]3.3e-3696.55Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQG
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]1.8e-3795.56Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQG PF
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]5.7e-3691.11Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMS+QG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TB46 Uncharacterized protein6.1e-3686.96Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPFNF
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM+ALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGQ F +
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPFNF
A0A6J1BQF8 protein SAMBA isoform X15.0e-38100Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X22.3e-3897.78Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG  F
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
A0A6J1D582 protein SAMBA-like isoform X11.6e-3696.55Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQG
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X28.6e-3895.56Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE MSALKSNIMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRS INLMSRQG PF
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPF
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA8.3e-2262.5Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++DSWMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein5.9e-2362.5Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+++M  L+KEVKSL++DSWMFEGPRSRI+L+SR+G
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQG

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCAAATTT
AATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAGCTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAATCTTATGTCACGACAAGGTCAACCATTTAACTTTCCACTTGCTCACTCTGAATTCTCATTCTACACATGTACGCATCAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATAGCTCCTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCAGCAATGTCAGTTGATGATTTTCGCTTCCCCGCAAATTT
AATTTCGATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGAGCGCTCTTAAATCTAATATAATGGCTGCGCTGAACAAGGAGGTCAAATCCCTGGATGATGATAGCTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCCCGTATCAATCTTATGTCACGACAAGGTCAACCATTTAACTTTCCACTTGCTCACTCTGAATTCTCATTCTACACATGTACGCATCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMSALKSNIMAALNKEVKSLDDDSWMFEGPRSRINLMSRQGQPFNFPLAHSEFSFYTCTHQ