; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS017726 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS017726
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationscaffold373:1923159..1924592
RNA-Seq ExpressionMS017726
SyntenyMS017726
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0004842 - ubiquitin-protein transferase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6579518.1 putative E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-10189.76Show/hide
Query:  MGG-CCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN
        MGG CCCCSSK TESNIAP YYYYPRAS+EHVPLSSP+ AP AF  GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEI SNKNDAAAQTTN
Subjt:  MGG-CCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN

Query:  SDAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC
        SD +QE  C N RETSAKCEGI DESDCKKHTDFE DTLKESEIELSKGV+SV L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC
Subjt:  SDAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC

Query:  PVCDQ
        PVCDQ
Subjt:  PVCDQ

XP_022156147.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A isoform X1 [Momordica charantia]3.7e-114100Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CDQ
Subjt:  CDQ

XP_022970099.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A [Cucurbita maxima]2.8e-10189.22Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGGCCCCSSK TESNIAP YYYYPRAS+EHVPLSSP+ AP AF  GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPY+VVL+HPHTPPVAQEI SNKNDAAAQTTNS
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP
        D +QE  C N RETSAKCEGI DESDCKKHTDFE DTLKESEIELSKGV+SV L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP

Query:  VCDQ
        VCDQ
Subjt:  VCDQ

XP_023551494.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-10189.76Show/hide
Query:  MGG-CCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN
        MGG CCCCSSK TESNIAP YYYYPRAS+EHVPLSSP+ AP AF  GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEI SNKNDAAAQTTN
Subjt:  MGG-CCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN

Query:  SDAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC
        SD +QE  C N RETSAKCEGI DESDCKKHTDFE DTLKESEIELSKGV+SV L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC
Subjt:  SDAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC

Query:  PVCDQ
        PVCDQ
Subjt:  PVCDQ

XP_038876112.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A [Benincasa hispida]6.6e-10390.15Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGGCCCCSSK TESNIAPSYYYYPRAS+EHVPLSSP+  P AFS GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLT P TPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN 
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        D +QE AC N RETSAKCEG+DESDCKKHTDFE DTLKESEIELSKGVES+ L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CDQ
Subjt:  CDQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQV6 RING-type domain-containing protein1.3e-10483.48Show/hide
Query:  EGHIATGADGFLVCLVEKYTEMGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHT
        E  IAT  +GFLVCLV+K  EMGGCCCCSSKGTESNIAP YYYYPRAS+EHVPL SP+  P  FS+GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLT P T
Subjt:  EGHIATGADGFLVCLVEKYTEMGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHT

Query:  PPVAQEIGSNKNDAAAQTTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKC
        PPV QEI   KN+AAAQTTNS+ +QE AC N RETSAKCEG+DESDCKKHTDFE D LKESE ELSKGVES  L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKC
Subjt:  PPVAQEIGSNKNDAAAQTTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKC

Query:  EHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ
        EHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ
Subjt:  EHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ

A0A5A7TH60 E3 ubiquitin-protein ligase1.9e-10087.68Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGGCCCCSSKGTESNIAP YYYYPRAS+EHVPLSSP+  P AFS+GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLT P TPPVAQEIGS KN+AAAQT NS
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        + +QE AC N RE SAKCEG+DESDCKKHTDFE +TLKESEIELSKGVES  L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CDQ
Subjt:  CDQ

A0A6J1DR88 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A isoform X11.8e-114100Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CDQ
Subjt:  CDQ

A0A6J1ER94 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A8.7e-10189.27Show/hide
Query:  MGG-CCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN
        MGG CCCCSSK +ESNIAP YYYYPRAS+EHVPLSSP+ AP AF  GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEI SNKNDAAAQTTN
Subjt:  MGG-CCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTN

Query:  SDAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC
        SD +QE  C N RETSAKCEGI DESDCKKHTDFE DTLKESEIELSKGV+SV L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC
Subjt:  SDAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDIC

Query:  PVCDQ
        PVCDQ
Subjt:  PVCDQ

A0A6J1I4I7 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A1.3e-10189.22Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGGCCCCSSK TESNIAP YYYYPRAS+EHVPLSSP+ AP AF  GLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPY+VVL+HPHTPPVAQEI SNKNDAAAQTTNS
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP
        D +QE  C N RETSAKCEGI DESDCKKHTDFE DTLKESEIELSKGV+SV L IEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGI-DESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP

Query:  VCDQ
        VCDQ
Subjt:  VCDQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2HIJ8 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A2.4e-3944.33Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGG CC SS+ +     P YYY P + +E VP  +  G  SAF++GLLVD  L+TSIPDT+   P P+PYD++L  P                  Q T+S
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        ++++     ++ ET A CE + ESDCK        + ++S+    +G++   L  EEED CPIC E+YD ENP+LTTKCEH FHL+C+LEW+ERSD CP+
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CD+
Subjt:  CDQ

Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A4.4e-0947.83Show/hide
Query:  EDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ
        +D C ICLE +  ++P   T C+H +HL CI+EW +RS  CP+C Q
Subjt:  EDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ

Q8LE94 E3 ubiquitin-protein ligase At3g022904.7e-1933.53Show/hide
Query:  LSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQ--TTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHT
        L S + A ++ +S     ++ D  + + +RS P P+PYD    +  +    +E GS+ +    +   ++SDA  E       + +     + + D K+  
Subjt:  LSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQ--TTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHT

Query:  DFETD--TLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVC
          ++    L+     +    E++ +  E+EDVCP CLEEY  ENPK+ TKC HHFHL+CI EWMERS+ CPVC
Subjt:  DFETD--TLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVC

Q93ZF6 E3 ubiquitin-protein ligase AIRP11.5e-1734.48Show/hide
Query:  GCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLS--SPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        GCCCC     ES+         R  DEH+PLS  +P    +A+SS L               SPP+P+    +      P + +  G             
Subjt:  GCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLS--SPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
                 N+ E S     +       H D  TD       EL K         E  D CPICLEEY+ +NPKL TKC H FHLACIL WMERS+ CPV
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CD+
Subjt:  CDQ

Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A7.6e-0942.42Show/hide
Query:  SEIELSKGVESVALAIEE--EDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ
        SE  L+     V   I++  +D C ICLE +   +P   T C+H +HL CILEW +RS  CP+C Q
Subjt:  SEIELSKGVESVALAIEE--EDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVCDQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G02290.1 RING/U-box superfamily protein3.4e-2033.53Show/hide
Query:  LSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQ--TTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHT
        L S + A ++ +S     ++ D  + + +RS P P+PYD    +  +    +E GS+ +    +   ++SDA  E       + +     + + D K+  
Subjt:  LSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQ--TTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHT

Query:  DFETD--TLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVC
          ++    L+     +    E++ +  E+EDVCP CLEEY  ENPK+ TKC HHFHL+CI EWMERS+ CPVC
Subjt:  DFETD--TLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPVC

AT4G00335.1 RING-H2 finger B1A1.7e-4044.33Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGG CC SS+ +     P YYY P + +E VP  +  G  SAF++GLLVD  L+TSIPDT+   P P+PYD++L  P                  Q T+S
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        ++++     ++ ET A CE + ESDCK        + ++S+    +G++   L  EEED CPIC E+YD ENP+LTTKCEH FHL+C+LEW+ERSD CP+
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CD+
Subjt:  CDQ

AT4G00335.2 RING-H2 finger B1A1.7e-4044.33Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGG CC SS+ +     P YYY P + +E VP  +  G  SAF++GLLVD  L+TSIPDT+   P P+PYD++L  P                  Q T+S
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        ++++     ++ ET A CE + ESDCK        + ++S+    +G++   L  EEED CPIC E+YD ENP+LTTKCEH FHL+C+LEW+ERSD CP+
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CD+
Subjt:  CDQ

AT4G00335.3 RING-H2 finger B1A1.7e-4044.33Show/hide
Query:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS
        MGG CC SS+ +     P YYY P + +E VP  +  G  SAF++GLLVD  L+TSIPDT+   P P+PYD++L  P                  Q T+S
Subjt:  MGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSNKNDAAAQTTNS

Query:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV
        ++++     ++ ET A CE + ESDCK        + ++S+    +G++   L  EEED CPIC E+YD ENP+LTTKCEH FHL+C+LEW+ERSD CP+
Subjt:  DAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICPV

Query:  CDQ
        CD+
Subjt:  CDQ

AT5G41350.1 RING/U-box superfamily protein4.7e-4648.31Show/hide
Query:  MGGCCCC-SSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIG-APSAFSSG-LLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGS-NKNDAAAQ
        MGGCCCC SS+  + +  P+YYYYPRA++E VPLSS      SA S+G ++VDTNL+TS PD Y  PPLP P+DV +  P TP   +E    +  + +  
Subjt:  MGGCCCC-SSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIG-APSAFSSG-LLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGS-NKNDAAAQ

Query:  TTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSD
        + N+++ QE            C    E+D K  T+ + ++ +E + +LSK   +V + IEEE+ CPICLEEYD ENPKL  KC+HHFHLACILEWMERS+
Subjt:  TTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSD

Query:  ICPVCDQ
         CPVC++
Subjt:  ICPVCDQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GAGGGACATATTGCTACTGGTGCCGATGGTTTTTTGGTGTGTCTTGTAGAAAAGTATACTGAAATGGGAGGTTGCTGCTGTTGTTCTTCAAAAGGAACAGAATCAAATAT
TGCACCATCCTACTATTATTACCCAAGAGCATCAGATGAGCATGTTCCCCTGTCATCTCCAATTGGTGCTCCCTCAGCATTTTCTAGCGGGCTTTTGGTCGATACAAATC
TAGATACATCAATACCTGACACTTATAGATCACCTCCCTTGCCTATGCCATATGATGTTGTTTTAACACATCCACATACTCCACCTGTGGCTCAAGAAATTGGCAGCAAT
AAGAATGATGCTGCAGCCCAGACAACAAATTCTGATGCAGTTCAAGAAATCGCATGCACTAATGCTCGAGAAACTTCAGCCAAGTGTGAAGGCATCGATGAATCAGACTG
CAAGAAGCATACAGACTTTGAAACAGACACATTAAAGGAATCTGAAATCGAACTTTCGAAGGGTGTAGAATCTGTGGCCTTAGCAATTGAAGAGGAGGATGTTTGTCCCA
TCTGTTTGGAAGAATATGATGGGGAGAATCCAAAACTTACCACAAAATGCGAGCATCATTTTCATCTTGCATGCATTCTGGAATGGATGGAAAGAAGTGATATCTGTCCT
GTGTGCGATCAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGGGACATATTGCTACTGGTGCCGATGGTTTTTTGGTGTGTCTTGTAGAAAAGTATACTGAAATGGGAGGTTGCTGCTGTTGTTCTTCAAAAGGAACAGAATCAAATAT
TGCACCATCCTACTATTATTACCCAAGAGCATCAGATGAGCATGTTCCCCTGTCATCTCCAATTGGTGCTCCCTCAGCATTTTCTAGCGGGCTTTTGGTCGATACAAATC
TAGATACATCAATACCTGACACTTATAGATCACCTCCCTTGCCTATGCCATATGATGTTGTTTTAACACATCCACATACTCCACCTGTGGCTCAAGAAATTGGCAGCAAT
AAGAATGATGCTGCAGCCCAGACAACAAATTCTGATGCAGTTCAAGAAATCGCATGCACTAATGCTCGAGAAACTTCAGCCAAGTGTGAAGGCATCGATGAATCAGACTG
CAAGAAGCATACAGACTTTGAAACAGACACATTAAAGGAATCTGAAATCGAACTTTCGAAGGGTGTAGAATCTGTGGCCTTAGCAATTGAAGAGGAGGATGTTTGTCCCA
TCTGTTTGGAAGAATATGATGGGGAGAATCCAAAACTTACCACAAAATGCGAGCATCATTTTCATCTTGCATGCATTCTGGAATGGATGGAAAGAAGTGATATCTGTCCT
GTGTGCGATCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
EGHIATGADGFLVCLVEKYTEMGGCCCCSSKGTESNIAPSYYYYPRASDEHVPLSSPIGAPSAFSSGLLVDTNLDTSIPDTYRSPPLPMPYDVVLTHPHTPPVAQEIGSN
KNDAAAQTTNSDAVQEIACTNARETSAKCEGIDESDCKKHTDFETDTLKESEIELSKGVESVALAIEEEDVCPICLEEYDGENPKLTTKCEHHFHLACILEWMERSDICP
VCDQ