; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS018046 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS018046
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiondormancy-associated protein 2-like isoform X2
Genome locationscaffold1336:175401..176458
RNA-Seq ExpressionMS018046
SyntenyMS018046
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578909.1 hypothetical protein SDJN03_23357, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-2069.15Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIST  V AA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYNS+EPNGRSGYN  E NGRSGYN  +P GR GYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

KAG7016430.1 hypothetical protein SDJN02_21539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.6e-2069.15Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIST  V AA        QE ALG KVLE KYE  GRSGYNS+EPNGRSGYN  EPNGRSGYN  +P GR GYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

XP_022939479.1 dormancy-associated protein 2-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.2e-2069.15Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIS   V AA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYNS+EPNGRSGYN  EPNGRSGYN  +P GR GYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

XP_022993935.1 P granule abnormality protein 1-like [Cucurbita maxima]3.8e-2271.28Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAAGL------QESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIST  VAAA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYNS+EP GR GYN YEPNGRSGYN  +P GRGGYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAAGL------QESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

XP_023551561.1 N66 matrix protein-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-1967.02Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIS   V AA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYN++EPNGRSGYN  E NGRSGYN  +P GR GYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0E0JUX0 Uncharacterized protein4.9e-0775.61Show/hide
Query:  PTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        P GRSGYNS  PNGRSGYN   PNGRSGYN V P GR GYN
Subjt:  PTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

A0A0E0JUX1 Uncharacterized protein3.8e-0775.61Show/hide
Query:  PTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        P GRSGYNS  PNGRSGYN   PNGRSGYN V P GR GYN
Subjt:  PTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

A0A6J1FHA4 dormancy-associated protein 2-like isoform X26.0e-2169.15Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIS   V AA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYNS+EPNGRSGYN  EPNGRSGYN  +P GR GYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

A0A6J1FLR8 N66 matrix protein-like isoform X11.6e-1865.96Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIS   V AA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYNS++PNGRSG N  EPNGRS YN  +P GR GYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAA------GLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

A0A6J1JZW6 P granule abnormality protein 1-like1.9e-2271.28Show/hide
Query:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAAGL------QESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN
        M +SK AG M MAAFLAVFLLIST  VAAA        QE ALGRKVLE KYE  GRSGYNS+EP GR GYN YEPNGRSGYN  +P GRGGYN
Subjt:  MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAAGL------QESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGAACTCTAAGGTTGCCGGAGCCATGGCGATGGCTGCTTTCCTTGCTGTCTTCCTCCTCATATCCACCAATGAAGTGGCTGCCGCCGGTCTGCAAGAATCCGCACT
TGGACGAAAAGTTCTTGAAGCTAAATATGAACCTACCGGCAGAAGTGGCTACAACAGCCACGAGCCCAATGGCAGAAGTGGCTACAATGGCTATGAACCCAATGGCAGAA
GTGGCTACAATGGCGTCAAGCCCACGGGAAGGGGAGGATACAAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGAACTCTAAGGTTGCCGGAGCCATGGCGATGGCTGCTTTCCTTGCTGTCTTCCTCCTCATATCCACCAATGAAGTGGCTGCCGCCGGTCTGCAAGAATCCGCACT
TGGACGAAAAGTTCTTGAAGCTAAATATGAACCTACCGGCAGAAGTGGCTACAACAGCCACGAGCCCAATGGCAGAAGTGGCTACAATGGCTATGAACCCAATGGCAGAA
GTGGCTACAATGGCGTCAAGCCCACGGGAAGGGGAGGATACAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVNSKVAGAMAMAAFLAVFLLISTNEVAAAGLQESALGRKVLEAKYEPTGRSGYNSHEPNGRSGYNGYEPNGRSGYNGVKPTGRGGYN