CuGenDBv2

Gene ID	MS018581
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 isoform X1
Genome location	scaffold313:64816..68563
RNA-Seq Expression	MS018581
Synteny	MS018581
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008460469.1 PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 isoform X1 [Cucumis melo]

1.7e-278

86.5

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDV SL+QSRNR SKT GDFDTSRS+FLDR+SSSNSRRSSSNGS+KHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRL+FGD+WDRD+ DPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRR+ T+ K     S N+  G+ SGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQG S+I
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEEL
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI GGEGWTSALAEVP++IGS+ GSSSFQQTVPA SGAG LSVTAGLNMAEALVQ+PSR R  PQ   L VKTQRLEEL
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEEL

Query:  AIKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNA
        AIKQSRQLIPVTPSMPKAMVL+SSDKSKPKLASRTGELN TIKGGQPQP  V H NQ+R GHVK DAQKSSHGKFLVLKP RENGVSLA KDV SPTSNA
Subjt:  AIKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNA

Query:  NNMAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEI
        N+MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNN+NVSSVERKIASLDLK+G+TLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKT  SSSA+LSDSC +VKSP+IGQSNELT EE+
Subjt:  NNMAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEI

Query:  NIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
         IPASPRV+ENGAVE RNG+SSEEVQ S DSGEK  SHV AESLDEEEAAFLRSLGWDES GEDEGLTEEEINSFY EYMNLKP  K+ RCIQPKIFVPS
Subjt:  NIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS

Query:  ESHEDSK-DGAGSELSSSDSEA
        ES EDSK DGAGSELSSSDSEA
Subjt:  ESHEDSK-DGAGSELSSSDSEA

XP_008460470.1 PREDICTED: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 isoform X2 [Cucumis melo]

4.1e-280

86.91

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDV SL+QSRNR SKT GDFDTSRS+FLDR+SSSNSRRSSSNGS+KHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRL+FGD+WDRD+ DPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRR+ T+ K     S N+  G+ SGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQG S+I
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIK
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI GGEGWTSALAEVP++IGS+ GSSSFQQTVPA SGAG LSVTAGLNMAEALVQ+PSR R  PQL VKTQRLEELAIK
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIK

Query:  QSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNANNM
        QSRQLIPVTPSMPKAMVL+SSDKSKPKLASRTGELN TIKGGQPQP  V H NQ+R GHVK DAQKSSHGKFLVLKP RENGVSLA KDV SPTSNAN+M
Subjt:  QSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNANNM

Query:  AANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIP
        AANSQFALAPSVPHAPLRSPNN+NVSSVERKIASLDLK+G+TLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKT  SSSA+LSDSC +VKSP+IGQSNELT EE+ IP
Subjt:  AANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIP

Query:  ASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH
        ASPRV+ENGAVE RNG+SSEEVQ S DSGEK  SHV AESLDEEEAAFLRSLGWDES GEDEGLTEEEINSFY EYMNLKP  K+ RCIQPKIFVPSES 
Subjt:  ASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH

Query:  EDSK-DGAGSELSSSDSEA
        EDSK DGAGSELSSSDSEA
Subjt:  EDSK-DGAGSELSSSDSEA

XP_022141428.1 flocculation protein FLO11 isoform X1 [Momordica charantia]

0.0e+00

99.03

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFP SSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ   LFVKTQRLEELA
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA

Query:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
        IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
Subjt:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN

Query:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
        MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
Subjt:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI

Query:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
        PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE  YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
Subjt:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS

Query:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
        ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
Subjt:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA

XP_022141429.1 uncharacterized protein LOC111011833 isoform X2 [Momordica charantia]

0.0e+00

99.51

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFP SSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQ
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQ
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQ

Query:  SRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAA
        SRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAA
Subjt:  SRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAA

Query:  NSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPAS
        NSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPAS
Subjt:  NSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPAS

Query:  PRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH
        PRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE  YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH
Subjt:  PRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH

Query:  EDSKDGAGSELSSSDSEA
        EDSKDGAGSELSSSDSEA
Subjt:  EDSKDGAGSELSSSDSEA

XP_022141430.1 flocculation protein FLO11 isoform X3 [Momordica charantia]

0.0e+00

99.03

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFP SSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ   LFVKTQRLEELA
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA

Query:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
        IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
Subjt:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN

Query:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
        MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
Subjt:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI

Query:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
        PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE  YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
Subjt:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS

Query:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
        ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
Subjt:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3CC42 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 isoform X2

2.0e-280

86.91

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDV SL+QSRNR SKT GDFDTSRS+FLDR+SSSNSRRSSSNGS+KHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRL+FGD+WDRD+ DPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRR+ T+ K     S N+  G+ SGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQG S+I
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIK
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI GGEGWTSALAEVP++IGS+ GSSSFQQTVPA SGAG LSVTAGLNMAEALVQ+PSR R  PQL VKTQRLEELAIK
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIK

Query:  QSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNANNM
        QSRQLIPVTPSMPKAMVL+SSDKSKPKLASRTGELN TIKGGQPQP  V H NQ+R GHVK DAQKSSHGKFLVLKP RENGVSLA KDV SPTSNAN+M
Subjt:  QSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNANNM

Query:  AANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIP
        AANSQFALAPSVPHAPLRSPNN+NVSSVERKIASLDLK+G+TLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKT  SSSA+LSDSC +VKSP+IGQSNELT EE+ IP
Subjt:  AANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIP

Query:  ASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH
        ASPRV+ENGAVE RNG+SSEEVQ S DSGEK  SHV AESLDEEEAAFLRSLGWDES GEDEGLTEEEINSFY EYMNLKP  K+ RCIQPKIFVPSES 
Subjt:  ASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH

Query:  EDSK-DGAGSELSSSDSEA
        EDSK DGAGSELSSSDSEA
Subjt:  EDSK-DGAGSELSSSDSEA

A0A5D3DT29 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1 isoform X1

8.4e-279

86.5

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDV SL+QSRNR SKT GDFDTSRS+FLDR+SSSNSRRSSSNGS+KHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRL+FGD+WDRD+ DPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRR+ T+ K     S N+  G+ SGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQG S+I
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEEL
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI GGEGWTSALAEVP++IGS+ GSSSFQQTVPA SGAG LSVTAGLNMAEALVQ+PSR R  PQ   L VKTQRLEEL
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALI-GGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEEL

Query:  AIKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNA
        AIKQSRQLIPVTPSMPKAMVL+SSDKSKPKLASRTGELN TIKGGQPQP  V H NQ+R GHVK DAQKSSHGKFLVLKP RENGVSLA KDV SPTSNA
Subjt:  AIKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNA

Query:  NNMAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEI
        N+MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNN+NVSSVERKIASLDLK+G+TLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKT  SSSA+LSDSC +VKSP+IGQSNELT EE+
Subjt:  NNMAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEI

Query:  NIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
         IPASPRV+ENGAVE RNG+SSEEVQ S DSGEK  SHV AESLDEEEAAFLRSLGWDES GEDEGLTEEEINSFY EYMNLKP  K+ RCIQPKIFVPS
Subjt:  NIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS

Query:  ESHEDSK-DGAGSELSSSDSEA
        ES EDSK DGAGSELSSSDSEA
Subjt:  ESHEDSK-DGAGSELSSSDSEA

A0A6J1CI28 flocculation protein FLO11 isoform X3

0.0e+00

99.03

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFP SSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ   LFVKTQRLEELA
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA

Query:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
        IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
Subjt:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN

Query:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
        MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
Subjt:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI

Query:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
        PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE  YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
Subjt:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS

Query:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
        ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
Subjt:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA

A0A6J1CIL7 uncharacterized protein LOC111011833 isoform X2

0.0e+00

99.51

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFP SSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQ
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQ
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQ

Query:  SRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAA
        SRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAA
Subjt:  SRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAA

Query:  NSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPAS
        NSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPAS
Subjt:  NSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPAS

Query:  PRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH
        PRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE  YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH
Subjt:  PRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESH

Query:  EDSKDGAGSELSSSDSEA
        EDSKDGAGSELSSSDSEA
Subjt:  EDSKDGAGSELSSSDSEA

A0A6J1CKG8 flocculation protein FLO11 isoform X1

0.0e+00

99.03

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
        MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFP SSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEK

Query:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
        DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI
Subjt:  DRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDI

Query:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA
        GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ   LFVKTQRLEELA
Subjt:  GRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQ---LFVKTQRLEELA

Query:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
        IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN
Subjt:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANN

Query:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
        MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI
Subjt:  MAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINI

Query:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
        PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE  YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS
Subjt:  PASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEE--YMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPS

Query:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
        ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA
Subjt:  ESHEDSKDGAGSELSSSDSEA

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G36990.1 unknown protein

3.8e-122

51.28

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLA-QSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSS--FNRGHRDKDRE
        M++ E +L PEWLRS+G  +GGG+SNH   SSSSHSD +SL   SRNR S++  D D+  S FLDRSSS+NSRR SSNGSAKHAYSS  FNR  RDKDR 
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLA-QSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSS--FNRGHRDKDRE

Query:  KEKDRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGT
        ++KDR+S+ D WD D+S PL  IL+ R D D LRRSHSMV+RKQGE   R +      G SS+  NG G+ SG S+G+S Q+  F+KDFPSLG+EEKQ  
Subjt:  KEKDRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGT

Query:  SDIGRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELA
         D+ RVSSPG+SS VQ+LP+GNSALIGGEGWTSALAEVPN+I  +   S       A+S AG L+  +GLNMAEALVQAP+R    PQ  VKTQRLE+LA
Subjt:  SDIGRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELA

Query:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVT-IKGGQPQPLPVHHTNQTR-GGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSN
        IKQSRQLIPV PS PK + LNSSDKSK K   RTGE  +   +    QP  +  + Q+   G +K +       K LVLKP RENGVS AVK+  SP++N
Subjt:  IKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVT-IKGGQPQPLPVHHTNQTR-GGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSN

Query:  ANNMAANSQ-FALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIAS-LDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTR
         N  AA+SQ  +   S   AP+RS N    S  E K AS   + SG T+EK+PS +Q QSR+ F++ +K+K   S+S I +D       P    ++  + 
Subjt:  ANNMAANSQ-FALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIAS-LDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTR

Query:  EEINIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKP
         E+ + +S  ++ +    +    S  EV  S       +     ++ DEEEA FLRSLGW E+ GE E LTEEEI+SF E+Y  L+P
Subjt:  EEINIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKP

AT4G08510.1 unknown protein

3.6e-88

42.76

Show/hide

Query:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSS--FNRGHRDKDREK
        ME+ EP+LVPEWLRS+G  +G G+SN       S SD  SL  S+NR +++  D D+  S FLDRSSS+N+RR SSNGS KHAYSS  FNR +RDKDR +
Subjt:  MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSS--FNRGHRDKDREK

Query:  EKDRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTS
        EKDR+S+ D WD DSS P G  L  R  ++ LRRSHSM +RKQG    +      K G + +  NG G+  GTS   S ++  F KDFP L  EE+ G  
Subjt:  EKDRLSFGDHWDRDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTS

Query:  DIGRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAI
        D+ R+SSPG S   QSL + N ALI GEGWTSALAEVPN+I  S G+ S       +  +  LS  A  NMAEALVQAP R    PQ     Q LE+ AI
Subjt:  DIGRVSSPGLSSPVQSLPIGNSALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAI

Query:  KQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTN--QTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNA
        +QSRQLIPV PS PK  V NSSDKSK K   R+GE  +       Q   V   N     G  +K D  K    K ++LKP RENG       V +  S  
Subjt:  KQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASRTGELNVTIKGGQPQPLPVHHTN--QTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKP-RENGVSLAVKDVPSPTSNA

Query:  NNMAANSQFALAPSVPH-APLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREE
        N+  A SQ   APS    A +RS N       + + AS+++ +G   EK+ SL+Q QSR+ F++ +K+KT  + S   S +   + S    Q+N      
Subjt:  NNMAANSQFALAPSVPH-APLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGSTLEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREE

Query:  INIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEY
         + P+SP+  E   +        E V+   +  E+++    A   D +EAAFL+SLGWDE+  ++   T EE+  + +++
Subjt:  INIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSLGWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEY

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAAAGAAGTGAACCCACATTAGTGCCAGAATGGTTGAGAAGTACTGGAAGCGTTACTGGTGGGGGCAATTCAAACCACCATTTCCCGTCGTCTTCTTCCCACTCGGA
TGTGTCCTCTCTAGCTCAATCGAGAAATAGAACTTCCAAGACCATTGGTGATTTTGATACTTCACGCTCTGCTTTTCTGGATCGGTCATCTTCATCGAATTCAAGGAGAA
GTTCGAGCAATGGTTCTGCTAAACATGCATATAGTAGTTTTAACAGGGGTCACCGTGATAAGGATCGTGAGAAAGAAAAGGATAGGTTAAGCTTTGGGGATCATTGGGAC
CGTGATTCTTCTGACCCTCTGGGAAAGATCCTTTCCAATAGAATTGATAAAGATGCTTTGCGGCGCTCTCATTCAATGGTATCCAGGAAGCAAGGTGAGCTGTTTCACCG
AAGAATTGCGACAGATCCAAAAATTGGTGTCAGCAGCAGTCTCAACAATGGCACTGGAATGCCTTCTGGAACTAGTGTCGGTAGTAGCATTCAGAAAGCTGTATTTGAAA
AGGATTTCCCTTCACTGGGATCTGAAGAAAAGCAAGGAACATCAGATATTGGAAGAGTTTCATCTCCTGGTTTGAGCTCACCAGTACAGAGCTTGCCTATTGGGAATTCA
GCCTTAATTGGTGGAGAGGGATGGACATCTGCTCTTGCTGAGGTTCCCAATATTATTGGAAGCAGCACAGGATCATCGTCATTTCAACAAACTGTTCCTGCTATATCAGG
GGCAGGGCTGCTGAGTGTGACAGCTGGGCTTAATATGGCTGAGGCATTGGTGCAGGCTCCATCTCGAGCTCGTGCTGTTCCTCAGTTATTCGTCAAGACCCAAAGGCTTG
AGGAATTGGCTATTAAACAGTCCAGGCAATTAATACCAGTAACGCCTTCCATGCCAAAAGCTATGGTGCTTAATTCTTCTGATAAATCAAAGCCCAAGCTGGCATCAAGA
ACCGGAGAACTTAATGTAACCATCAAGGGTGGACAGCCACAGCCCTTGCCAGTCCATCATACCAACCAAACTCGTGGTGGACATGTCAAGTCTGACGCTCAAAAGAGTTC
TCATGGGAAGTTTCTTGTTCTCAAACCACGAGAAAATGGTGTCTCCCTTGCTGTAAAGGATGTCCCAAGTCCAACTAGTAATGCAAACAACATGGCAGCAAACAGCCAGT
TCGCTCTTGCACCTTCAGTTCCACATGCTCCTTTGAGAAGCCCAAACAATTCAAATGTTTCCTCTGTGGAGCGCAAGATTGCTAGCTTGGATCTCAAATCCGGATCAACT
TTGGAAAAAAGACCATCCTTATCACAAGTCCAGAGTCGGAATGATTTCTTTAACCTCATTAAGAAGAAAACTCCAAAGAGTTCTTCTGCTATTCTCTCAGATTCATGCCC
TGCTGTGAAATCTCCTACAATTGGCCAATCTAATGAACTAACAAGGGAAGAAATCAACATTCCTGCAAGTCCTCGTGTTGTTGAAAATGGTGCTGTGGAGACTAGAAATG
GCGATAGTTCTGAAGAGGTTCAGGCATCTTGTGACAGTGGTGAAAAACTTGCGAGCCACGTTGGTGCAGAATCTTTAGATGAAGAGGAGGCTGCTTTTCTTCGTTCTCTT
GGATGGGATGAGAGCTATGGTGAAGACGAAGGCCTTACTGAAGAAGAGATCAATTCTTTCTATGAGGAGTATATGAACTTGAAGCCACCTACAAAAATGGTCCGGTGCAT
ACAGCCAAAGATATTTGTGCCGTCTGAATCTCATGAGGATAGCAAGGATGGAGCCGGTTCTGAATTGAGCTCATCTGACTCAGAAGCC

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MERSEPTLVPEWLRSTGSVTGGGNSNHHFPSSSSHSDVSSLAQSRNRTSKTIGDFDTSRSAFLDRSSSSNSRRSSSNGSAKHAYSSFNRGHRDKDREKEKDRLSFGDHWD
RDSSDPLGKILSNRIDKDALRRSHSMVSRKQGELFHRRIATDPKIGVSSSLNNGTGMPSGTSVGSSIQKAVFEKDFPSLGSEEKQGTSDIGRVSSPGLSSPVQSLPIGNS
ALIGGEGWTSALAEVPNIIGSSTGSSSFQQTVPAISGAGLLSVTAGLNMAEALVQAPSRARAVPQLFVKTQRLEELAIKQSRQLIPVTPSMPKAMVLNSSDKSKPKLASR
TGELNVTIKGGQPQPLPVHHTNQTRGGHVKSDAQKSSHGKFLVLKPRENGVSLAVKDVPSPTSNANNMAANSQFALAPSVPHAPLRSPNNSNVSSVERKIASLDLKSGST
LEKRPSLSQVQSRNDFFNLIKKKTPKSSSAILSDSCPAVKSPTIGQSNELTREEINIPASPRVVENGAVETRNGDSSEEVQASCDSGEKLASHVGAESLDEEEAAFLRSL
GWDESYGEDEGLTEEEINSFYEEYMNLKPPTKMVRCIQPKIFVPSESHEDSKDGAGSELSSSDSEA

MS018581 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome