; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS018597 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS018597
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description60S ribosomal protein L30
Genome locationscaffold313:203645..203997
RNA-Seq ExpressionMS018597
SyntenyMS018597
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR004038 - Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45
IPR022991 - Ribosomal protein L30e, conserved site
IPR029064 - 50S ribosomal protein L30e-like
IPR039109 - Ribosomal protein L30/YlxQ


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF9848163.1 hypothetical protein H0E87_002587 [Populus deltoides]1.5e-3195.83Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKC
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVL+T+RSSKGKLI+LSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKC
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKC

KAG6602049.1 60S ribosomal protein L30, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-3192.21Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

XP_008460497.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L30-like [Cucumis melo]3.3e-3190.91Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

XP_022141723.1 60S ribosomal protein L30-like [Momordica charantia]2.5e-3192.21Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

XP_022952815.1 60S ribosomal protein L30-like [Cucurbita moschata]2.5e-3192.21Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3DSZ7 60S ribosomal protein L30-like1.6e-3190.91Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

A0A6J1CLC5 60S ribosomal protein L30-like1.2e-3192.21Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

A0A6J1FH91 60S ribosomal protein L30-like1.6e-3190.91Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

A0A6J1GMT2 60S ribosomal protein L30-like1.2e-3192.21Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

A0A6J1JWW8 60S ribosomal protein L30-like1.6e-3190.91Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAK+GVHHYNGS   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49884 60S ribosomal protein L303.1e-3284.42Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVL+++RSSKGKLII++NNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNG+   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

Q8VZ19 60S ribosomal protein L30-27.2e-2975.32Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++R SKGKLI++S NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYNG+   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

Q9C8F7 Putative 60S ribosomal protein L30-11.6e-2875.32Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYN +   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

Q9LSA3 60S ribosomal protein L30-31.6e-2875.32Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVH YNG+   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

Q9M5M6 60S ribosomal protein L301.3e-3080.52Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KKTHESIN+RLALVMKSGK+TLGYKTVL ++RS+KGKLII++NNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNG+   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G36240.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein1.1e-2975.32Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYN +   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

AT1G77940.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein5.1e-3075.32Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++R SKGKLI++S NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVHHYNG+   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA

AT3G18740.1 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein1.1e-2975.32Show/hide
Query:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA
        KK+HE IN+RLALVMKSGKYTLGYK+VL+++RSSKGKLI++S+NCPPLR+SEIEYYAMLAKVGVH YNG+   + +A
Subjt:  KKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCTGTGGTATTTTATTTGCAGAAGAAGACTCATGAGAGCATTAACAACAGGCTCGCCCTTGTGATGAAGAGCGGCAAGTACACACTGGGCTATAAAACCGTCCTACGCAC
TATTCGCAGCTCCAAAGGGAAGCTTATAATCCTATCGAACAACTGCCCGCCGCTGCGTAAGTCTGAAATTGAGTACTACGCGATGCTTGCTAAAGTTGGGGTTCACCACT
ACAACGGAAGTAAGTGTAGTATAGACTCTGCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTGTGGTATTTTATTTGCAGAAGAAGACTCATGAGAGCATTAACAACAGGCTCGCCCTTGTGATGAAGAGCGGCAAGTACACACTGGGCTATAAAACCGTCCTACGCAC
TATTCGCAGCTCCAAAGGGAAGCTTATAATCCTATCGAACAACTGCCCGCCGCTGCGTAAGTCTGAAATTGAGTACTACGCGATGCTTGCTAAAGTTGGGGTTCACCACT
ACAACGGAAGTAAGTGTAGTATAGACTCTGCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SVVFYLQKKTHESINNRLALVMKSGKYTLGYKTVLRTIRSSKGKLIILSNNCPPLRKSEIEYYAMLAKVGVHHYNGSKCSIDSA