CuGenDBv2

Gene ID	MS018723
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	High chlorophyll fluorescence
Genome location	scaffold313:1384324..1385961
RNA-Seq Expression	MS018723
Synteny	MS018723
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6601944.1 hypothetical protein SDJN03_07177, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7032638.1 hypothetical protein SDJN02_06688 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.2e-43

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XP_022146328.1 uncharacterized protein LOC111015566 [Momordica charantia]

2.6e-56

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XP_022961614.1 uncharacterized protein LOC111462310 [Cucurbita moschata]

3.6e-42

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XP_023525740.1 uncharacterized protein LOC111789252 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.5e-43

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TrEMBL top hits

e value

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A0A6J1CYA7 uncharacterized protein LOC111015566

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A0A6J1FJ66 uncharacterized protein LOC111444753

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79.03

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A0A6J1HEK5 uncharacterized protein LOC111462310

1.7e-42

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A0A6J1JTZ0 uncharacterized protein LOC111487491

2.8e-40

80.51

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A0A6J1K146 uncharacterized protein LOC111489690

1.2e-38

76.61

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G31560.1 high chlorophyll fluorescence 153

2.6e-14

41.86

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        P+ P  ++ P    +P    PA  F+          R +R   + TRAG STSSY+ AF+IP +LI  TV T++KI D LD+ FLE++ LN+AI +A E+
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         ++   +IS +    +P L RTRNRPKRE
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

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TTTCCCATTCCCCCTCTCCCCGTCGCTCCTCCGCGGTTGTTCTTCAGACCCTCCACTCCCTCGCCGGCGCTCAGATTCTCCGGCGACCCCAGACCCCTGCGCCTGCGACT
GCTGACCACTCGTGCCGGCGCCAGCACCAGCAGCTACATCTTCGCCTTCTCCATCCCCTTCTCTCTCATTCTCATCACTGTTCTCACCGCTCTTAAAATCGGCGATAACC
TCGACAAGAAATTTCTCGAGGAGGTTACTCTGAATGAAGCCATTATGGAAGCAGATGAGGAGAACAAAGATGATAATTCAGAAATATCCTTCGAACCAAAACCTGCTCTT
CCACGAACTCGCAACCGCCCTAAAAGGGAAGCTGAGGTG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

FPIPPLPVAPPRLFFRPSTPSPALRFSGDPRPLRLRLLTTRAGASTSSYIFAFSIPFSLILITVLTALKIGDNLDKKFLEEVTLNEAIMEADEENKDDNSEISFEPKPAL
PRTRNRPKREAEV

MS018723 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome