; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS018926 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS018926
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionThylakoidal processing peptidase 1
Genome locationscaffold89:438793..442728
RNA-Seq ExpressionMS018926
SyntenyMS018926
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0010027 - thylakoid membrane organization (biological process)
GO:0005887 - integral component of plasma membrane (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000223 - Peptidase S26A, signal peptidase I
IPR019533 - Peptidase S26
IPR019756 - Peptidase S26A, signal peptidase I, serine active site
IPR019758 - Peptidase S26A, signal peptidase I, conserved site
IPR036286 - LexA/Signal peptidase-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020547.1 Thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-17485.79Show/hide
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XP_022951822.1 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]4.9e-17586.06Show/hide
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XP_023537459.1 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.4e-17485.52Show/hide
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XP_038884798.1 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like [Benincasa hispida]6.8e-17786.6Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNI7 Peptidase_S26 domain-containing protein1.1e-16783.42Show/hide
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A0A1S3BBL0 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like6.2e-16883.69Show/hide
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A0A5A7VHF7 Thylakoidal processing peptidase 14.0e-16783.42Show/hide
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A0A6J1CT20 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like9.8e-20699.73Show/hide
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A0A6J1GIQ5 thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic-like isoform X12.3e-17586.06Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04348 Thylakoidal processing peptidase 1, chloroplastic2.6e-9456.34Show/hide
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P72660 Probable signal peptidase I-12.0e-3849.69Show/hide
Query:  EDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVN
        E+   L  AL +++L + F+AEP+ IPS SM PTLE GDR++ EKVSY F  P+V DI+VF  P++LQ  G    + FIKRV+A  G  VEV  G +  +
Subjt:  EDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVN

Query:  GVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWP
        G    E++ILEP  Y +  + VP+G V+VMGDNRNNS DSH WG L  +NI+G +LF+++P
Subjt:  GVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWP

P73157 Probable signal peptidase I-21.9e-3342.94Show/hide
Query:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGK
        +T+ E  K + TA+ +++  ++F+AE + IPSSSM PTL++ DR++ EK+SY  R PE  +IVVF     L+    +  + FIKR++   GD V V +G 
Subjt:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGK

Query:  LVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKG
        + VNG + DE++I  P AYE  P+ VP+    V+GDNRNNS DSH WG +  E ++GR+  ++WP P  G
Subjt:  LVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKG

Q8H0W1 Chloroplast processing peptidase1.1e-5754.81Show/hide
Query:  RSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPE
        +S  S D   GGG       G G +       EK+      L   S+DA+ +F A+ VS+ F+ F+AEP+ IPS SMYPT +VGDR++AEKVSY+FRKP 
Subjt:  RSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPE

Query:  VSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGR
         +DIV+FK+P +LQE+G + ++VFIKR+VA  GD+VEV  GKL+VNGV ++E FILEP  YEM P+ VPE  V+VMGDNRNNS DSH WGPL ++NI+GR
Subjt:  VSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGR

Query:  SLFKYWPP
        S+F+YWPP
Subjt:  SLFKYWPP

Q9M9Z2 Probable thylakoidal processing peptidase 2, chloroplastic4.1e-9253.14Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVL
        MAIRVT +YS YVA+++ASS G R   G+ R   E WVR    G    P++  KS GS     S   R +P+      +SMYST+A E++ E  KSP+VL
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVL

Query:  GLMSMLKSVASASGSSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGGTI-------VSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLL
        G++S++    +   S    TG+ G S FK +S+IPFL+GSKW+P   I + +S D   VD+GG          +SD    G N           WV++LL
Subjt:  GLMSMLKSVASASGSSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGGTI-------VSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLL

Query:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGK
        +  SEDAKA FTA+TVS+LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+VGDRV+AEKVSYFFRKPEVSDIV+FKAP IL E G S ++VFIKR+VA+ GD VEV  GK
Subjt:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGK

Query:  LVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKGSSMADSPHASKI
        L+VN  VQ EDF+LEPI YEM+P+ VPEGYV+V+GDNRN S DSHNWGPL I+NI+GRS+F+YWPP    S ++D  H  ++
Subjt:  LVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKGSSMADSPHASKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06870.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein2.9e-9353.14Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVL
        MAIRVT +YS YVA+++ASS G R   G+ R   E WVR    G    P++  KS GS     S   R +P+      +SMYST+A E++ E  KSP+VL
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLR--AGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPEL--KSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVL

Query:  GLMSMLKSVASASGSSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGGTI-------VSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLL
        G++S++    +   S    TG+ G S FK +S+IPFL+GSKW+P   I + +S D   VD+GG          +SD    G N           WV++LL
Subjt:  GLMSMLKSVASASGSSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDD---VDKGGGTI-------VSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLL

Query:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGK
        +  SEDAKA FTA+TVS+LF+S LAEPKSIPS+SM PTL+VGDRV+AEKVSYFFRKPEVSDIV+FKAP IL E G S ++VFIKR+VA+ GD VEV  GK
Subjt:  STYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGK

Query:  LVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKGSSMADSPHASKI
        L+VN  VQ EDF+LEPI YEM+P+ VPEGYV+V+GDNRN S DSHNWGPL I+NI+GRS+F+YWPP    S ++D  H  ++
Subjt:  LVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKGSSMADSPHASKI

AT1G23465.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein8.6e-1335.11Show/hide
Query:  SMYPTLE-VGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPI-AYEMDPLVVPEGYV
        SM PTL   G+ +LAE++S  ++KP   DIVV ++P+       + ++  IKRVV   GD +                 F+++P+ + E   +VVP+G+V
Subjt:  SMYPTLE-VGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPI-AYEMDPLVVPEGYV

Query:  YVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFK
        +V GD  +NS DS N+GP+    I GR L++
Subjt:  YVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFK

AT1G29960.1 Peptidase S24/S26A/S26B/S26C family protein9.6e-1232.48Show/hide
Query:  LFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLE-VGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQ
        L+  L V+  +  F+A        SM PTL   G+ +LAE++S  ++KP   DIVV ++P+       + ++  IKRV+   GD +       V++    
Subjt:  LFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLE-VGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQ

Query:  DEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWP
        DE             +VVP+G+V+V GD  +NS DS N+G +    I GR L++ WP
Subjt:  DEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWP

AT2G30440.1 thylakoid processing peptide1.8e-9556.34Show/hide
Query:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVLGLMS
        MAIR+T +YS +VA+NL  +     G C            F S   P          + S  R F  S    +PASMY ++A E++GE  +SP+V+GL+S
Subjt:  MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVLGLMS

Query:  MLKSVASASGSSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTAL
        +LK   S +G  S T  + G SSFKA+SIIPFLQGSKW+        V DDVDK GGT+  D D        E+    S WV++LLS  SEDAKA FTA+
Subjt:  MLKSVASASGSSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTAL

Query:  TVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQIL---QEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDED
        TVS+LF+S LAEPKSIPS+SMYPTL+ GDRV+AEKVSYFFRKPEVSDIV+FKAP IL    E G SS++VFIKR+VA+ GD VEVR GKL VN +VQ+ED
Subjt:  TVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQIL---QEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDED

Query:  FILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPP
        F+LEP++YEM+P+ VP+GYV+V+GDNRN S DSHNWGPL IENIVGRS+F+YWPP
Subjt:  FILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGRSLFKYWPP

AT3G24590.1 plastidic type i signal peptidase 18.0e-5954.81Show/hide
Query:  RSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPE
        +S  S D   GGG       G G +       EK+      L   S+DA+ +F A+ VS+ F+ F+AEP+ IPS SMYPT +VGDR++AEKVSY+FRKP 
Subjt:  RSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSSMYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPE

Query:  VSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGR
         +DIV+FK+P +LQE+G + ++VFIKR+VA  GD+VEV  GKL+VNGV ++E FILEP  YEM P+ VPE  V+VMGDNRNNS DSH WGPL ++NI+GR
Subjt:  VSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDSHNWGPLAIENIVGR

Query:  SLFKYWPP
        S+F+YWPP
Subjt:  SLFKYWPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATCCGTGTTACTCTCTCTTACTCTGGCTATGTCGCCCAAAACCTTGCCTCCTCCACCGGCCTTCGGGCTGGTAACTGCCGCGTCTTTCAGGAGTTTTGGGTCCG
ATCTTGTATTTTTGGCTCGACCCATAATCCAGAGCTCAAATCTGCTGGAAGCGCGCGCAATTATCGGTCCGATAGCCGGCGGTTCAAACCGAGTGGCTCTATGAAGAAGC
CAGCTTCTATGTACAGCACCCTTGCCGGAGAAATGGTTGGGGAAAATCCAAAGAGTCCTGTGGTTCTGGGTTTGATGTCGATGCTGAAATCGGTGGCTTCTGCTTCTGGT
TCTTCTTCGATTACTACGGGGATTTTTGGGGCTTCTTCGTTTAAAGCCACTTCGATTATACCATTTCTACAAGGATCGAAGTGGCTTCCCGGTTACGATATACGATCTCA
TGTAAGCGACGACGTGGATAAAGGCGGCGGAACAATTGTTAGTGATTATGATGGAATTGGGAGCAACCAGATTTATGAGAATGATTTTGAGAAGAGCAGCTGGGTTTCGC
GCTTGTTGAGTACCTACTCTGAGGACGCGAAGGCTCTGTTTACGGCTTTGACTGTTAGTGTGCTCTTTAAATCGTTCTTGGCGGAGCCAAAATCGATTCCTTCTTCTTCT
ATGTATCCTACTCTGGAAGTAGGAGATCGCGTTTTAGCGGAAAAGGTTTCATACTTTTTCAGGAAACCTGAAGTTTCAGATATAGTGGTCTTTAAAGCTCCTCAAATCTT
GCAGGAAATCGGAGTTAGTTCAAGTGAGGTGTTTATTAAGAGAGTCGTGGCTACGTCTGGCGATGTGGTTGAAGTTCGTAAAGGGAAATTGGTGGTGAACGGTGTTGTTC
AAGATGAGGACTTCATCTTAGAGCCAATTGCTTATGAGATGGATCCGTTGGTTGTGCCTGAAGGTTATGTGTATGTTATGGGAGACAACCGTAACAATAGTTGTGATTCT
CATAACTGGGGTCCACTCGCTATTGAAAATATTGTTGGTAGATCATTGTTCAAGTATTGGCCTCCTCCCCCCAAAGGGTCCAGTATGGCAGATTCACCTCATGCAAGCAA
GATAAAACTGGGGATTTCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTATCCGTGTTACTCTCTCTTACTCTGGCTATGTCGCCCAAAACCTTGCCTCCTCCACCGGCCTTCGGGCTGGTAACTGCCGCGTCTTTCAGGAGTTTTGGGTCCG
ATCTTGTATTTTTGGCTCGACCCATAATCCAGAGCTCAAATCTGCTGGAAGCGCGCGCAATTATCGGTCCGATAGCCGGCGGTTCAAACCGAGTGGCTCTATGAAGAAGC
CAGCTTCTATGTACAGCACCCTTGCCGGAGAAATGGTTGGGGAAAATCCAAAGAGTCCTGTGGTTCTGGGTTTGATGTCGATGCTGAAATCGGTGGCTTCTGCTTCTGGT
TCTTCTTCGATTACTACGGGGATTTTTGGGGCTTCTTCGTTTAAAGCCACTTCGATTATACCATTTCTACAAGGATCGAAGTGGCTTCCCGGTTACGATATACGATCTCA
TGTAAGCGACGACGTGGATAAAGGCGGCGGAACAATTGTTAGTGATTATGATGGAATTGGGAGCAACCAGATTTATGAGAATGATTTTGAGAAGAGCAGCTGGGTTTCGC
GCTTGTTGAGTACCTACTCTGAGGACGCGAAGGCTCTGTTTACGGCTTTGACTGTTAGTGTGCTCTTTAAATCGTTCTTGGCGGAGCCAAAATCGATTCCTTCTTCTTCT
ATGTATCCTACTCTGGAAGTAGGAGATCGCGTTTTAGCGGAAAAGGTTTCATACTTTTTCAGGAAACCTGAAGTTTCAGATATAGTGGTCTTTAAAGCTCCTCAAATCTT
GCAGGAAATCGGAGTTAGTTCAAGTGAGGTGTTTATTAAGAGAGTCGTGGCTACGTCTGGCGATGTGGTTGAAGTTCGTAAAGGGAAATTGGTGGTGAACGGTGTTGTTC
AAGATGAGGACTTCATCTTAGAGCCAATTGCTTATGAGATGGATCCGTTGGTTGTGCCTGAAGGTTATGTGTATGTTATGGGAGACAACCGTAACAATAGTTGTGATTCT
CATAACTGGGGTCCACTCGCTATTGAAAATATTGTTGGTAGATCATTGTTCAAGTATTGGCCTCCTCCCCCCAAAGGGTCCAGTATGGCAGATTCACCTCATGCAAGCAA
GATAAAACTGGGGATTTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAIRVTLSYSGYVAQNLASSTGLRAGNCRVFQEFWVRSCIFGSTHNPELKSAGSARNYRSDSRRFKPSGSMKKPASMYSTLAGEMVGENPKSPVVLGLMSMLKSVASASG
SSSITTGIFGASSFKATSIIPFLQGSKWLPGYDIRSHVSDDVDKGGGTIVSDYDGIGSNQIYENDFEKSSWVSRLLSTYSEDAKALFTALTVSVLFKSFLAEPKSIPSSS
MYPTLEVGDRVLAEKVSYFFRKPEVSDIVVFKAPQILQEIGVSSSEVFIKRVVATSGDVVEVRKGKLVVNGVVQDEDFILEPIAYEMDPLVVPEGYVYVMGDNRNNSCDS
HNWGPLAIENIVGRSLFKYWPPPPKGSSMADSPHASKIKLGIS