; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019052 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019052
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationscaffold20:1008922..1010628
RNA-Seq ExpressionMS019052
SyntenyMS019052
Gene Ontology termsGO:0016554 - cytidine to uridine editing (biological process)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR032867 - DYW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606966.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.8e-30790.86Show/hide
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XP_022143265.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial [Momordica charantia]0.0e+0098.59Show/hide
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XP_022948359.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial [Cucurbita moschata]1.1e-30690.69Show/hide
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XP_022998145.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial [Cucurbita maxima]6.9e-30690.69Show/hide
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XP_038903469.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial [Benincasa hispida]1.3e-30791.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BZM7 LOW QUALITY PROTEIN: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial8.0e-30088.77Show/hide
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A0A5D3E178 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.0e-29988.77Show/hide
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A0A6J1CPR6 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial0.0e+0098.59Show/hide
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A0A6J1G9N5 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial5.1e-30790.69Show/hide
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        VKSSLIDMYAKCG PDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYA+SGRK DAIELF RVPVRNLFSWTALISGLIQSGNG+YSFSLF+EMRREGID+VDPLV 
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        SSVVGA ANLALLELGKQ+H LVIA+GFESCLFISN LVDMYAKCSDILAAKDIF  MPRKDVISWTSIIVGTAQHG+AEEAL+LYDEMVL+G+KPNEVT
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        FVGLLYACSH GLV +GR+LF SM ADY+INPSLQHYTCLLDLLSRSGHL+EAE+++N+MPFKPDEPTWASLLSACKRHN+M+MGVRIADHVLDLKP+DP
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        STYILLSNVYA AEMWESVSKVR+LMS MEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGET HPM+DEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFW
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A0A6J1KBS5 pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial3.3e-30690.69Show/hide
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        NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHN+AILPRRTLSML+ M   DGLQPDHF+FA IV ACASLG LRLGKQVHARFMLSSF DDEV
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        VKSSLIDMYAKCG PDDARAVFDSI FKNSVSWTAMISGYA+SGRK DAIELF RVPVRNLFSWTALISGLIQSGNG+YSFSLF+EMRREGID+VDPLV 
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        SSVVGA ANLALLELGKQIH LVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIF  MPRKDVISWTSIIVGTAQHG+AEEAL+LYDEMVL+G+KPNEVT
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        STYILLSNVYA AEMW+SVSKVR+LMS MEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGET HPM++EIFHLLKDLDA MRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFW
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        HSERLAMAYGLLKAVPGT+IRIVKNLRICGDCHNVLKF SDIVKREIVVRDATRYHHFK+GKCSCNDFW
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23169 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g371701.3e-12940.07Show/hide
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        N +++ Y + GL+ +A +LFDEM  +D  SW +++T + +   P   L + + M  +   +P+ F  +  V A A++  +R GK++H   + +    DEV
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        + SSL+DMY KCG  D+AR +FD I+ K+ VSWT+MI  Y +S R                  W                FSLFSE+     +  +    
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        + V+ A A+L   ELGKQ+H  +  +GF+   F S++LVDMY KC +I +AK +  G P+ D++SWTS+I G AQ+GQ +EAL  +D ++ +G KP+ VT
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Query:  FVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDP
        FV +L AC+HAGLV +G + F S+   +R++ +  HYTCL+DLL+RSG  ++ +S+I+EMP KP +  WAS+L  C  + ++ +    A  +  ++PE+P
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Query:  STYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFW
         TY+ ++N+YA+A  WE   K+RK M  + V K PG S  +  ++  VF A +T HPM ++I   L++L  +M+  GYVP TS VLHD+E ++KE+ L +
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Query:  HSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        HSE+LA+A+ +L    GT I++ KNLR C DCH  +KF S+I KR+I VRD+TR+H F+ G+CSC D+W
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O23266 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g14050, mitochondrial1.9e-23767.95Show/hide
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        NTL++VYGKCG    ALQ+FDEMPHRDH++WAS+LTA NQA L  +TLS+ +++ +  GL+PD F+F+++V+ACA+LG++  G+QVH  F++S + +DEV
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Query:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVL
        VKSSL+DMYAKCG  + A+AVFDSI  KN++SWTAM+SGYA+SGRK +A+ELF  +PV+NL+SWTALISG +QSG G+ +FS+F+EMRRE +DI+DPLVL
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Query:  SSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVT
        SS+VGA ANLA    G+Q+H LVIALGF+SC+FISNAL+DMYAKCSD++AAKDIF  M  +DV+SWTS+IVG AQHGQAE+ALALYD+MV  GVKPNEVT
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Query:  FVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADH-VLDLKPED
        FVGL+YACSH G V +GR+LF SM  DY I PSLQHYTCLLDLL RSG LDEAE++I+ MPF PDEPTWA+LLSACKR    +MG+RIADH V   K +D
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Query:  PSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMR-RRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQL
        PSTYILLSN+YASA +W  VS+ R+ +  MEVRK+PG+SS++  KE++VF+AGET HP++++IF LLK L+ EMR R GYVP+TS++LHDM++QEKEK L
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Query:  FWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        FWHSER A+AYGLLKAVPGT IRIVKNLR+CGDCH VLK  S+I +REI+VRDATRYHHFK GKCSCNDFW
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O23337 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g148202.8e-12438.99Show/hide
Query:  LDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEVVKS
        +D+Y  CG I  A  +FDEM HRD V+W +++  + +  L      +   M     + PD  I  +IV AC   GN+R  + ++   + +    D  + +
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Query:  SLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSV
        +L+ MYA  G  D AR  F  +  +N    TAM+SGY++ GR  DA  +F +   ++L  WT +IS  ++S     +  +F EM   GI   D + + SV
Subjt:  SLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSV

Query:  VGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVG
        + A ANL +L+  K +H  +   G ES L I+NAL++MYAKC  + A +D+F  MPR++V+SW+S+I   + HG+A +AL+L+  M    V+PNEVTFVG
Subjt:  VGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVG

Query:  LLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTY
        +LY CSH+GLV  G+K+F SM  +Y I P L+HY C++DL  R+  L EA  +I  MP   +   W SL+SAC+ H  +++G   A  +L+L+P+     
Subjt:  LLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTY

Query:  ILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFWHSE
        +L+SN+YA  + WE V  +R++M    V KE G S ID   +S  F  G+  H   +EI+  L ++ ++++  GYVP+   VL D+E++EK+  + WHSE
Subjt:  ILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFWHSE

Query:  RLAMAYGLLKAVPGT------IIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        +LA+ +GL+            +IRIVKNLR+C DCH   K  S + +REI+VRD TR+H +K G CSC D+W
Subjt:  RLAMAYGLLKAVPGT------IIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW

Q9FRI5 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g253603.7e-13741.87Show/hide
Query:  NTLLDVYGKC----GLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILT-------------------------AHNQAI-------LPRRTLSMLNTMLALDGLQPDH
        N L+ VY KC     L+  A ++FDE+  +D  SW +++T                         A+N  I         +  L M+  M++  G++ D 
Subjt:  NTLLDVYGKC----GLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILT-------------------------AHNQAI-------LPRRTLSMLNTMLALDGLQPDH

Query:  FIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLS---SFHDDEVVKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNL
        F + S++RACA+ G L+LGKQVHA  +     SFH D    +SL+ +Y KCG+ D+ARA+F+ +  K+ VSW A++SGY  SG   +A  +F  +  +N+
Subjt:  FIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLS---SFHDDEVVKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNL

Query:  FSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRK
         SW  +ISGL ++G G     LFS M+REG +  D    S  + + A L     G+Q H  ++ +GF+S L   NAL+ MYAKC  +  A+ +F  MP  
Subjt:  FSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRK

Query:  DVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMP
        D +SW ++I    QHG   EA+ +Y+EM+  G++P+ +T + +L ACSHAGLV++GRK F SM   YRI P   HY  L+DLL RSG   +AES+I  +P
Subjt:  DVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMP

Query:  FKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDE
        FKP    W +LLS C+ H +M++G+  AD +  L PE   TY+LLSN++A+   WE V++VRKLM    V+KE   S I+   +   F   +T HP  + 
Subjt:  FKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDE

Query:  IFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQ-EKEKQLFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKE
        ++  L+DL  EMRR GYVP+TSFVLHD+E    KE  L  HSE++A+A+GL+K  PGT IRI KNLR CGDCHN  +F S +V+R+I++RD  R+HHF+ 
Subjt:  IFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQ-EKEKQLFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKE

Query:  GKCSCNDFW
        G+CSC +FW
Subjt:  GKCSCNDFW

Q9SHZ8 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g220701.3e-12639.86Show/hide
Query:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV
        N ++ ++ + G +  A+  F++M  RD V+W S+++  NQ     R L + + ML    L PD F  AS++ ACA+L  L +GKQ+H+  + + F    +
Subjt:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV

Query:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKN--SVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPL
        V ++LI MY++CG  + AR + +    K+     +TA++ GY + G    A  +F  +  R++ +WTA+I G  Q G+   + +LF  M   G    +  
Subjt:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKN--SVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPL

Query:  VLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIF-LGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPN
         L++++  +++LA L  GKQIH   +  G    + +SNAL+ MYAK  +I +A   F L    +D +SWTS+I+  AQHG AEEAL L++ M++ G++P+
Subjt:  VLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIF-LGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPN

Query:  EVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKP
         +T+VG+  AC+HAGLVN+GR+ F  M    +I P+L HY C++DL  R+G L EA+  I +MP +PD  TW SLLSAC+ H ++ +G   A+ +L L+P
Subjt:  EVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKP

Query:  EDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQ
        E+   Y  L+N+Y++   WE  +K+RK M    V+KE G+S I+   +  VF   +  HP ++EI+  +K +  E+++ GYVP+T+ VLHD+E++ KE+ 
Subjt:  EDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQ

Query:  LFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        L  HSE+LA+A+GL+     T +RI+KNLR+C DCH  +KF S +V REI+VRD TR+HHFK+G CSC D+W
Subjt:  LFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G25360.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.7e-13841.87Show/hide
Query:  NTLLDVYGKC----GLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILT-------------------------AHNQAI-------LPRRTLSMLNTMLALDGLQPDH
        N L+ VY KC     L+  A ++FDE+  +D  SW +++T                         A+N  I         +  L M+  M++  G++ D 
Subjt:  NTLLDVYGKC----GLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILT-------------------------AHNQAI-------LPRRTLSMLNTMLALDGLQPDH

Query:  FIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLS---SFHDDEVVKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNL
        F + S++RACA+ G L+LGKQVHA  +     SFH D    +SL+ +Y KCG+ D+ARA+F+ +  K+ VSW A++SGY  SG   +A  +F  +  +N+
Subjt:  FIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLS---SFHDDEVVKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNL

Query:  FSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRK
         SW  +ISGL ++G G     LFS M+REG +  D    S  + + A L     G+Q H  ++ +GF+S L   NAL+ MYAKC  +  A+ +F  MP  
Subjt:  FSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRK

Query:  DVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMP
        D +SW ++I    QHG   EA+ +Y+EM+  G++P+ +T + +L ACSHAGLV++GRK F SM   YRI P   HY  L+DLL RSG   +AES+I  +P
Subjt:  DVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMP

Query:  FKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDE
        FKP    W +LLS C+ H +M++G+  AD +  L PE   TY+LLSN++A+   WE V++VRKLM    V+KE   S I+   +   F   +T HP  + 
Subjt:  FKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDE

Query:  IFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQ-EKEKQLFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKE
        ++  L+DL  EMRR GYVP+TSFVLHD+E    KE  L  HSE++A+A+GL+K  PGT IRI KNLR CGDCHN  +F S +V+R+I++RD  R+HHF+ 
Subjt:  IFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQ-EKEKQLFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKE

Query:  GKCSCNDFW
        G+CSC +FW
Subjt:  GKCSCNDFW

AT2G22070.1 pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein9.5e-12839.86Show/hide
Query:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV
        N ++ ++ + G +  A+  F++M  RD V+W S+++  NQ     R L + + ML    L PD F  AS++ ACA+L  L +GKQ+H+  + + F    +
Subjt:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV

Query:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKN--SVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPL
        V ++LI MY++CG  + AR + +    K+     +TA++ GY + G    A  +F  +  R++ +WTA+I G  Q G+   + +LF  M   G    +  
Subjt:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKN--SVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPL

Query:  VLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIF-LGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPN
         L++++  +++LA L  GKQIH   +  G    + +SNAL+ MYAK  +I +A   F L    +D +SWTS+I+  AQHG AEEAL L++ M++ G++P+
Subjt:  VLSSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIF-LGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPN

Query:  EVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKP
         +T+VG+  AC+HAGLVN+GR+ F  M    +I P+L HY C++DL  R+G L EA+  I +MP +PD  TW SLLSAC+ H ++ +G   A+ +L L+P
Subjt:  EVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKP

Query:  EDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQ
        E+   Y  L+N+Y++   WE  +K+RK M    V+KE G+S I+   +  VF   +  HP ++EI+  +K +  E+++ GYVP+T+ VLHD+E++ KE+ 
Subjt:  EDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQ

Query:  LFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        L  HSE+LA+A+GL+     T +RI+KNLR+C DCH  +KF S +V REI+VRD TR+HHFK+G CSC D+W
Subjt:  LFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW

AT4G14050.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein1.3e-23867.95Show/hide
Query:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV
        NTL++VYGKCG    ALQ+FDEMPHRDH++WAS+LTA NQA L  +TLS+ +++ +  GL+PD F+F+++V+ACA+LG++  G+QVH  F++S + +DEV
Subjt:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV

Query:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVL
        VKSSL+DMYAKCG  + A+AVFDSI  KN++SWTAM+SGYA+SGRK +A+ELF  +PV+NL+SWTALISG +QSG G+ +FS+F+EMRRE +DI+DPLVL
Subjt:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVL

Query:  SSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVT
        SS+VGA ANLA    G+Q+H LVIALGF+SC+FISNAL+DMYAKCSD++AAKDIF  M  +DV+SWTS+IVG AQHGQAE+ALALYD+MV  GVKPNEVT
Subjt:  SSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVT

Query:  FVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADH-VLDLKPED
        FVGL+YACSH G V +GR+LF SM  DY I PSLQHYTCLLDLL RSG LDEAE++I+ MPF PDEPTWA+LLSACKR    +MG+RIADH V   K +D
Subjt:  FVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADH-VLDLKPED

Query:  PSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMR-RRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQL
        PSTYILLSN+YASA +W  VS+ R+ +  MEVRK+PG+SS++  KE++VF+AGET HP++++IF LLK L+ EMR R GYVP+TS++LHDM++QEKEK L
Subjt:  PSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMR-RRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQL

Query:  FWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        FWHSER A+AYGLLKAVPGT IRIVKNLR+CGDCH VLK  S+I +REI+VRDATRYHHFK GKCSCNDFW
Subjt:  FWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW

AT4G14820.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein2.0e-12538.99Show/hide
Query:  LDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEVVKS
        +D+Y  CG I  A  +FDEM HRD V+W +++  + +  L      +   M     + PD  I  +IV AC   GN+R  + ++   + +    D  + +
Subjt:  LDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEVVKS

Query:  SLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSV
        +L+ MYA  G  D AR  F  +  +N    TAM+SGY++ GR  DA  +F +   ++L  WT +IS  ++S     +  +F EM   GI   D + + SV
Subjt:  SLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSV

Query:  VGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVG
        + A ANL +L+  K +H  +   G ES L I+NAL++MYAKC  + A +D+F  MPR++V+SW+S+I   + HG+A +AL+L+  M    V+PNEVTFVG
Subjt:  VGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVG

Query:  LLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTY
        +LY CSH+GLV  G+K+F SM  +Y I P L+HY C++DL  R+  L EA  +I  MP   +   W SL+SAC+ H  +++G   A  +L+L+P+     
Subjt:  LLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTY

Query:  ILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFWHSE
        +L+SN+YA  + WE V  +R++M    V KE G S ID   +S  F  G+  H   +EI+  L ++ ++++  GYVP+   VL D+E++EK+  + WHSE
Subjt:  ILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFWHSE

Query:  RLAMAYGLLKAVPGT------IIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        +LA+ +GL+            +IRIVKNLR+C DCH   K  S + +REI+VRD TR+H +K G CSC D+W
Subjt:  RLAMAYGLLKAVPGT------IIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW

AT4G37170.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein9.1e-13140.07Show/hide
Query:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV
        N +++ Y + GL+ +A +LFDEM  +D  SW +++T + +   P   L + + M  +   +P+ F  +  V A A++  +R GK++H   + +    DEV
Subjt:  NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEV

Query:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVL
        + SSL+DMY KCG  D+AR +FD I+ K+ VSWT+MI  Y +S R                  W                FSLFSE+     +  +    
Subjt:  VKSSLIDMYAKCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVL

Query:  SSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVT
        + V+ A A+L   ELGKQ+H  +  +GF+   F S++LVDMY KC +I +AK +  G P+ D++SWTS+I G AQ+GQ +EAL  +D ++ +G KP+ VT
Subjt:  SSVVGASANLALLELGKQIHCLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVT

Query:  FVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDP
        FV +L AC+HAGLV +G + F S+   +R++ +  HYTCL+DLL+RSG  ++ +S+I+EMP KP +  WAS+L  C  + ++ +    A  +  ++PE+P
Subjt:  FVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRINPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDP

Query:  STYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFW
         TY+ ++N+YA+A  WE   K+RK M  + V K PG S  +  ++  VF A +T HPM ++I   L++L  +M+  GYVP TS VLHD+E ++KE+ L +
Subjt:  STYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSIDFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFW

Query:  HSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW
        HSE+LA+A+ +L    GT I++ KNLR C DCH  +KF S+I KR+I VRD+TR+H F+ G+CSC D+W
Subjt:  HSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVRDATRYHHFKEGKCSCNDFW


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AACACCCTTTTGGATGTCTACGGCAAATGCGGTCTCATTCCCCAAGCCCTCCAACTGTTCGACGAAATGCCCCACAGGGATCACGTCTCCTGGGCCTCGATTCTCACCGC
CCATAACCAAGCCATTCTTCCCCGACGGACCCTTTCGATGCTCAACACCATGTTGGCGCTTGATGGGTTGCAGCCCGACCATTTTATCTTCGCCTCCATAGTCAGGGCCT
GTGCGAGCTTGGGAAATTTGCGGCTAGGTAAGCAAGTCCATGCTCGGTTTATGTTGTCTTCGTTTCATGATGATGAGGTTGTCAAGTCTTCTTTGATTGATATGTATGCC
AAATGTGGGCAACCCGATGATGCTCGGGCTGTTTTTGATTCCATTTTGTTCAAGAATTCTGTTTCTTGGACTGCTATGATTTCTGGGTATGCTAGAAGTGGGAGGAAATA
CGATGCTATTGAGCTTTTTCATCGAGTTCCGGTGAGAAACTTGTTCTCGTGGACTGCTTTGATTTCGGGGTTGATTCAAAGTGGCAATGGAATGTATTCGTTTTCTTTGT
TTAGTGAAATGAGGAGAGAAGGAATTGATATTGTTGACCCTTTAGTTCTTTCAAGTGTTGTTGGAGCTTCTGCAAATTTGGCTCTTCTGGAGCTAGGAAAGCAAATTCAT
TGCTTGGTTATAGCTCTTGGCTTTGAGTCTTGTTTATTTATAAGCAATGCACTTGTAGATATGTATGCTAAATGTAGTGACATTTTAGCAGCCAAGGATATCTTTCTTGG
AATGCCCCGAAAAGATGTAATTTCTTGGACTTCAATCATAGTTGGTACTGCTCAACATGGGCAAGCAGAGGAGGCATTAGCTTTATATGATGAGATGGTTTTGGCTGGAG
TAAAACCGAATGAAGTGACTTTCGTTGGGTTACTTTATGCTTGCAGTCATGCCGGGCTAGTTAACAGAGGTCGCAAATTATTTGGGTCTATGGTAGCTGATTATAGGATT
AATCCTTCTCTCCAGCACTACACATGTTTATTAGATCTCCTGAGTCGCTCCGGACACCTTGATGAGGCAGAGAGTATAATTAATGAAATGCCATTTAAACCCGATGAGCC
TACTTGGGCATCTCTATTGAGCGCGTGCAAGCGACATAATAGTATGAAAATGGGAGTTCGAATTGCTGATCATGTGTTGGATTTAAAACCTGAAGATCCTTCGACATACA
TACTCTTGTCGAATGTTTATGCCAGTGCTGAAATGTGGGAAAGTGTTTCAAAGGTGAGAAAGTTGATGAGTTCTATGGAAGTAAGAAAGGAACCGGGTTATAGTAGCATT
GACTTTGGGAAGGAGAGTCAAGTATTTCATGCTGGGGAGACTTGTCATCCTATGAGGGATGAGATTTTCCATCTACTGAAGGATTTAGATGCAGAAATGAGAAGGAGAGG
CTATGTTCCTAACACCAGCTTTGTTTTGCATGACATGGAGCAGCAAGAAAAGGAAAAACAGCTCTTTTGGCACAGTGAGAGGTTGGCCATGGCATATGGACTTCTCAAGG
CTGTTCCAGGGACGATTATTCGGATTGTGAAAAATCTTCGCATTTGTGGAGATTGTCATAATGTCTTGAAATTTGCTAGCGATATAGTGAAAAGAGAAATTGTCGTCCGT
GACGCCACGAGATATCATCATTTCAAGGAAGGGAAATGTTCGTGCAATGATTTCTGG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACACCCTTTTGGATGTCTACGGCAAATGCGGTCTCATTCCCCAAGCCCTCCAACTGTTCGACGAAATGCCCCACAGGGATCACGTCTCCTGGGCCTCGATTCTCACCGC
CCATAACCAAGCCATTCTTCCCCGACGGACCCTTTCGATGCTCAACACCATGTTGGCGCTTGATGGGTTGCAGCCCGACCATTTTATCTTCGCCTCCATAGTCAGGGCCT
GTGCGAGCTTGGGAAATTTGCGGCTAGGTAAGCAAGTCCATGCTCGGTTTATGTTGTCTTCGTTTCATGATGATGAGGTTGTCAAGTCTTCTTTGATTGATATGTATGCC
AAATGTGGGCAACCCGATGATGCTCGGGCTGTTTTTGATTCCATTTTGTTCAAGAATTCTGTTTCTTGGACTGCTATGATTTCTGGGTATGCTAGAAGTGGGAGGAAATA
CGATGCTATTGAGCTTTTTCATCGAGTTCCGGTGAGAAACTTGTTCTCGTGGACTGCTTTGATTTCGGGGTTGATTCAAAGTGGCAATGGAATGTATTCGTTTTCTTTGT
TTAGTGAAATGAGGAGAGAAGGAATTGATATTGTTGACCCTTTAGTTCTTTCAAGTGTTGTTGGAGCTTCTGCAAATTTGGCTCTTCTGGAGCTAGGAAAGCAAATTCAT
TGCTTGGTTATAGCTCTTGGCTTTGAGTCTTGTTTATTTATAAGCAATGCACTTGTAGATATGTATGCTAAATGTAGTGACATTTTAGCAGCCAAGGATATCTTTCTTGG
AATGCCCCGAAAAGATGTAATTTCTTGGACTTCAATCATAGTTGGTACTGCTCAACATGGGCAAGCAGAGGAGGCATTAGCTTTATATGATGAGATGGTTTTGGCTGGAG
TAAAACCGAATGAAGTGACTTTCGTTGGGTTACTTTATGCTTGCAGTCATGCCGGGCTAGTTAACAGAGGTCGCAAATTATTTGGGTCTATGGTAGCTGATTATAGGATT
AATCCTTCTCTCCAGCACTACACATGTTTATTAGATCTCCTGAGTCGCTCCGGACACCTTGATGAGGCAGAGAGTATAATTAATGAAATGCCATTTAAACCCGATGAGCC
TACTTGGGCATCTCTATTGAGCGCGTGCAAGCGACATAATAGTATGAAAATGGGAGTTCGAATTGCTGATCATGTGTTGGATTTAAAACCTGAAGATCCTTCGACATACA
TACTCTTGTCGAATGTTTATGCCAGTGCTGAAATGTGGGAAAGTGTTTCAAAGGTGAGAAAGTTGATGAGTTCTATGGAAGTAAGAAAGGAACCGGGTTATAGTAGCATT
GACTTTGGGAAGGAGAGTCAAGTATTTCATGCTGGGGAGACTTGTCATCCTATGAGGGATGAGATTTTCCATCTACTGAAGGATTTAGATGCAGAAATGAGAAGGAGAGG
CTATGTTCCTAACACCAGCTTTGTTTTGCATGACATGGAGCAGCAAGAAAAGGAAAAACAGCTCTTTTGGCACAGTGAGAGGTTGGCCATGGCATATGGACTTCTCAAGG
CTGTTCCAGGGACGATTATTCGGATTGTGAAAAATCTTCGCATTTGTGGAGATTGTCATAATGTCTTGAAATTTGCTAGCGATATAGTGAAAAGAGAAATTGTCGTCCGT
GACGCCACGAGATATCATCATTTCAAGGAAGGGAAATGTTCGTGCAATGATTTCTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
NTLLDVYGKCGLIPQALQLFDEMPHRDHVSWASILTAHNQAILPRRTLSMLNTMLALDGLQPDHFIFASIVRACASLGNLRLGKQVHARFMLSSFHDDEVVKSSLIDMYA
KCGQPDDARAVFDSILFKNSVSWTAMISGYARSGRKYDAIELFHRVPVRNLFSWTALISGLIQSGNGMYSFSLFSEMRREGIDIVDPLVLSSVVGASANLALLELGKQIH
CLVIALGFESCLFISNALVDMYAKCSDILAAKDIFLGMPRKDVISWTSIIVGTAQHGQAEEALALYDEMVLAGVKPNEVTFVGLLYACSHAGLVNRGRKLFGSMVADYRI
NPSLQHYTCLLDLLSRSGHLDEAESIINEMPFKPDEPTWASLLSACKRHNSMKMGVRIADHVLDLKPEDPSTYILLSNVYASAEMWESVSKVRKLMSSMEVRKEPGYSSI
DFGKESQVFHAGETCHPMRDEIFHLLKDLDAEMRRRGYVPNTSFVLHDMEQQEKEKQLFWHSERLAMAYGLLKAVPGTIIRIVKNLRICGDCHNVLKFASDIVKREIVVR
DATRYHHFKEGKCSCNDFW