; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019056 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019056
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationscaffold20:1040585..1040935
RNA-Seq ExpressionMS019056
SyntenyMS019056
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-4480.99Show/hide
Query:  MGNS----AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNC
        MGNS    AF +LIFTIA F+SSS LAV A+S D++L+WLSTE RCHGRSI+EC+M  IEFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNC
Subjt:  MGNS----AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        QPGAEANPYQRGCT ITRCR+
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTVITRCRN

KAG6581259.1 Protein RALF-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.0e-4681.15Show/hide
Query:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
        MGNS+     F MLIFT+AFF+SSS L V A+SGDR+LSWLSTE RCHGRS++EC+M N+E E+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
Subjt:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        CQPGAEANPYQRGCTVITRCR+
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]7.8e-4781.97Show/hide
Query:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
        MGNS+     F MLIFTIAFF+SSS L V A+SGDR+LSWLSTE+RCHGRS++EC+M ++EFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
Subjt:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        CQPGAEANPYQRGCTVITRCR+
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]1.3e-4681.97Show/hide
Query:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
        MGNS+     F MLIFTIAFF+SSS L V A+SGDR+LSWLSTE+RCHGR ++EC+M N+EFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
Subjt:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        CQPGAEANPYQRGCTVITRCR+
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-4681.15Show/hide
Query:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
        MGNS+     F MLIFTIAFF+ SS L V A+SGD +LSWLSTE+RCHGRS++EC+M N+EFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
Subjt:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        CQPGAEANPYQRGCTVITRCR+
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein1.7e-4277.24Show/hide
Query:  MGNS----AFFMLIFTIAFFI--SSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYY
        MG+S    A  +LIFTIAFF+  SSS L V  +S DR+L+WLSTE+RCHGRSI+EC+M +IEFE+DSEINRRILATSSYISYKSL+ANNIPCSRRGSSYY
Subjt:  MGNS----AFFMLIFTIAFFI--SSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYY

Query:  NCQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        NCQPGAEANPYQRGCT ITRCR+
Subjt:  NCQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

A0A1U8APG9 rapid alkalinization factor-like3.3e-2758.97Show/hide
Query:  NSAFFML--IFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGA
        +S FF++  +F  A  ISSS    A  SG+  L WL T S C G S+ EC+    EFE+DSEINRRILATS YISY +L+ N +PCSRRG+SYYNC+PGA
Subjt:  NSAFFML--IFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGA

Query:  EANPYQRGCTVITRCRN
        +ANPY RGC+ ITRCR+
Subjt:  EANPYQRGCTVITRCRN

A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 337.9e-4580.99Show/hide
Query:  MGNS----AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNC
        MGNS    AF +LIFTIA F+SSS LAV A+S D++L+WLSTE RCHGRSI+EC+M  IEFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNC
Subjt:  MGNS----AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNC

Query:  QPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        QPGAEANPYQRGCT ITRCR+
Subjt:  QPGAEANPYQRGCTVITRCRN

A0A6J1F244 protein RALF-like 13.8e-4781.97Show/hide
Query:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
        MGNS+     F MLIFTIAFF+SSS L V A+SGDR+LSWLSTE+RCHGRS++EC+M ++EFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
Subjt:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        CQPGAEANPYQRGCTVITRCR+
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

A0A6J1J798 protein RALF-like 16.5e-4781.97Show/hide
Query:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
        MGNS+     F MLIFTIAFF+SSS L V A+SGDR+LSWLSTE+RCHGR ++EC+M N+EFE+DSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN
Subjt:  MGNSA-----FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYN

Query:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN
        CQPGAEANPYQRGCTVITRCR+
Subjt:  CQPGAEANPYQRGCTVITRCRN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 333.7e-2350.88Show/hide
Query:  AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNI--EFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA
        A  + I T+ F         AA++   +  ++  ES+C+G +I EC ++    EFE+DSEINRRILAT+ YISY +L+ N +PCSRRG+SYYNC+ GA+A
Subjt:  AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNI--EFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA

Query:  NPYQRGCTVITRCR
        NPY RGC+ ITRCR
Subjt:  NPYQRGCTVITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor3.9e-2553.7Show/hide
Query:  IAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWL---STESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGC
        +   I + F+++AA        W+    +   C G SI ECI    EFELDSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+PGA+ANPY RGC
Subjt:  IAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWL---STESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGC

Query:  TVITRCRN
        + ITRCR+
Subjt:  TVITRCRN

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.3e-2045.04Show/hide
Query:  GNSAFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMN----------------NIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIP
        G +A F ++  +A  + +  +AV++ S +    +   E+ C G +I EC ++                  EFE+DSEINRRILAT  YISY +L+ N IP
Subjt:  GNSAFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMN----------------NIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIP

Query:  CSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR
        CSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 229.1e-2263.64Show/hide
Query:  SRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR
        S C G SI ECI    E E DS+I+RRILA   YISY +++ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  SRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 11.3e-2354.78Show/hide
Query:  FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLST---ESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA
        F  L   + F ISS  +     +    ++W +T    S CHG SI ECI    E E+DSEINRRILAT+ YISY+SLK N++PCSRRG+SYYNCQ GA+A
Subjt:  FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLST---ESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA

Query:  NPYQRGCTVITRCRN
        NPY RGC+ I RCR+
Subjt:  NPYQRGCTVITRCRN

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 19.0e-2554.78Show/hide
Query:  FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLST---ESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA
        F  L   + F ISS  +     +    ++W +T    S CHG SI ECI    E E+DSEINRRILAT+ YISY+SLK N++PCSRRG+SYYNCQ GA+A
Subjt:  FFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLST---ESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA

Query:  NPYQRGCTVITRCRN
        NPY RGC+ I RCR+
Subjt:  NPYQRGCTVITRCRN

AT2G33775.1 ralf-like 191.2e-1643.4Show/hide
Query:  IAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNN--IEFELDSEINRRILAT-SSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGC
        I   +    L +A ++     +W  T+S  +G+    CI  +  +++ +DSE NRR LA   SYISY +L+ NN+PCSRRG SYY+C+    ANPY+RGC
Subjt:  IAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNN--IEFELDSEINRRILAT-SSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGC

Query:  TVITRC
        +VIT C
Subjt:  TVITRC

AT3G05490.1 ralf-like 226.4e-2363.64Show/hide
Query:  SRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR
        S C G SI ECI    E E DS+I+RRILA   YISY +++ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  SRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 239.3e-2245.04Show/hide
Query:  GNSAFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMN----------------NIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIP
        G +A F ++  +A  + +  +AV++ S +    +   E+ C G +I EC ++                  EFE+DSEINRRILAT  YISY +L+ N IP
Subjt:  GNSAFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMN----------------NIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIP

Query:  CSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR
        CSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+ ITRCR
Subjt:  CSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTVITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 332.6e-2450.88Show/hide
Query:  AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNI--EFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA
        A  + I T+ F         AA++   +  ++  ES+C+G +I EC ++    EFE+DSEINRRILAT+ YISY +L+ N +PCSRRG+SYYNC+ GA+A
Subjt:  AFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNI--EFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEA

Query:  NPYQRGCTVITRCR
        NPY RGC+ ITRCR
Subjt:  NPYQRGCTVITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAACTCAGCCTTCTTTATGCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCATCTCTTCCTCCTTTCTCGCCGTCGCAGCCTTGAGCGGTGACCGTACTCTCAGCTGGCTCTC
GACGGAATCTCGATGCCACGGGCGTTCGATAAACGAGTGCATCATGAATAATATTGAGTTTGAATTGGATTCTGAGATCAATCGCCGTATCTTGGCTACTTCGAGCTACA
TAAGTTACAAGTCATTGAAGGCAAACAACATTCCATGCTCTCGTAGAGGCTCTTCGTACTACAATTGCCAGCCAGGGGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGGGGTTGCACC
GTCATTACTCGTTGCAGAAAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGCAACTCAGCCTTCTTTATGCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCATCTCTTCCTCCTTTCTCGCCGTCGCAGCCTTGAGCGGTGACCGTACTCTCAGCTGGCTCTC
GACGGAATCTCGATGCCACGGGCGTTCGATAAACGAGTGCATCATGAATAATATTGAGTTTGAATTGGATTCTGAGATCAATCGCCGTATCTTGGCTACTTCGAGCTACA
TAAGTTACAAGTCATTGAAGGCAAACAACATTCCATGCTCTCGTAGAGGCTCTTCGTACTACAATTGCCAGCCAGGGGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGGGGTTGCACC
GTCATTACTCGTTGCAGAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGNSAFFMLIFTIAFFISSSFLAVAALSGDRTLSWLSTESRCHGRSINECIMNNIEFELDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCT
VITRCRN