; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019123 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019123
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationscaffold20:1700095..1700410
RNA-Seq ExpressionMS019123
SyntenyMS019123
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0041397.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-0736.54Show/hide
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KAA0044556.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-0736.54Show/hide
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TYK29578.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-0534.62Show/hide
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XP_031744692.1 uncharacterized protein LOC116405125 [Cucumis sativus]2.1e-0635.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T9I7 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein4.9e-0633.65Show/hide
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A0A5A7TIB8 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein2.0e-0736.54Show/hide
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A0A5A7TR15 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein2.0e-0736.54Show/hide
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A0A5A7TSA7 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein4.9e-0634.62Show/hide
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A0A5D3E1E3 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein4.9e-0634.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATTGCAGAATGGGCAACTTTATCAGCCCTACTGTCCTCCTTTACTCCATCAAATAGAGTGAATTTATGGCTATGGAACCTGAAGAAACATGGCAGCTTCACAGCAAAATC
ATTGACTCAAAACCTTCCAACATTTTCGGTTTCCTCCACTGATAACCGCAATAAATCCATTTGGAAGATAAGGTCCATTTGGAAGGCCATGTATCCAAATAAGGTCAAGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
IAEWATLSALLSSFTPSNRVNLWLWNLKKHGSFTAKSLTQNLPTFSVSSTDNRNKSIWKIRSIWKAMYPNKVKFLIWELSHSCLNTFDKRMPLMISPTWCCLCK