| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| TYK01611.1 THO complex subunit 4D [Cucumis melo var. makuwa] | 2.7e-107 | 89.61 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI KASFKL GSV +LF GESHCGSPS P LPP RM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTYV
L DNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLTYV
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTYV
|
|
| XP_022143379.1 THO complex subunit 4D-like [Momordica charantia] | 7.9e-99 | 86.4 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISK PPRRMK
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: HVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Subjt: HVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Query: RDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
DNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
Subjt: RDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 9.9e-94 | 82.1 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
L DNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 9.9e-94 | 82.1 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
L DNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 9.9e-94 | 82.1 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
L DNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 1.3e-91 | 80.35 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI K PP RM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
L DNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| A0A5D3BPA9 THO complex subunit 4D | 1.3e-107 | 89.61 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M TPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPL IN R SA+SI KASFKL GSV +LF GESHCGSPS P LPP RM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTYV
L DNAEMPVSARINVTG NGR+RRTVVLTYV
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLTYV
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 3.8e-99 | 86.4 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISK PPRRMK
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: HVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Subjt: HVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEIL
Query: RDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
DNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
Subjt: RDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 4.8e-94 | 82.1 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
L DNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 4.8e-94 | 82.1 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGS+RRGPL IN RPSAFSISK PPRRM
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR-VVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
K+VQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
L DNA+ PVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: LRDNAEMPVSARINVTGLNGRSRRTVVLT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 9.5e-31 | 40.39 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNG---GRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPR
MA +DMSL+D+IK N ++ +RG R GRG GG+ G GR +G R G + RP RG G + P + P+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNG---GRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPR
Query: RMKHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKI
++ +WQHDLF+ A +G+E G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I
Subjt: RMKHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKI
Query: EIL
+++
Subjt: EIL
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 4.5e-57 | 53.45 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL++N RPS+F+I+K P RR+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+ + WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++EI
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVL
L N +E P+S R +NVTGLNGR +RTVV+
Subjt: LRDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVL
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 2.2e-35 | 44.55 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY-RHLPPRRM
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G GG+ GGR GS N+ PS ++ G+ + PY R + ++
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY-RHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLF--EDSLRAS----------GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNN
WQ+D+F + S+ A+ G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNN
Subjt: KHVQWQHDLF--EDSLRAS----------GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNN
Query: VLLDGKPMKIEILRDNAEMP
V LDGK MKIEI+ N P
Subjt: VLLDGKPMKIEILRDNAEMP
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 4.1e-34 | 42.11 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
M+T LDMSL+DMI KN ++RG A RG G G + R P +TR + + +KA
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRMK
Query: HVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMK
W HD+F ED +GIE GTKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMK
Subjt: HVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMK
Query: IEILRDNAE
IEI+ N +
Subjt: IEILRDNAE
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 1.6e-54 | 50.21 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R RGRG GG G +RRGPL++NTRP S+FSI+K +
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
Query: RHLPPRRMKHVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
RR + + W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVL
Subjt: RHLPPRRMKHVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
Query: LDGKPMKIEILRDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVL
LDG+PMK+EIL N E PV+AR+NVTGLNGR +R+V +
Subjt: LDGKPMKIEILRDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVL
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-55 | 50.21 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R RGRG GG G +RRGPL++NTRP S+FSI+K +
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
Query: RHLPPRRMKHVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
RR + + W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVL
Subjt: RHLPPRRMKHVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
Query: LDGKPMKIEILRDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVL
LDG+PMK+EIL N E PV+AR+NVTGLNGR +R+V +
Subjt: LDGKPMKIEILRDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVL
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-55 | 50.21 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R RGRG GG G +RRGPL++NTRP S+FSI+K +
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRA-----RGRAR---RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRP-SAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY
Query: RHLPPRRMKHVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
RR + + W Q+DL+E++LRA G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA A+++YNNVL
Subjt: RHLPPRRMKHVQW--QHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVL
Query: LDGKPMKIEILRDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVL
LDG+PMK+EIL N E PV+AR+NVTGLNGR +R+V +
Subjt: LDGKPMKIEILRDNAE-MPVSARINVTGLNGRSRRTVVL
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.6e-36 | 44.55 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY-RHLPPRRM
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G GG+ GGR GS N+ PS ++ G+ + PY R + ++
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPY-RHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLF--EDSLRAS----------GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNN
WQ+D+F + S+ A+ G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR G+AEVV++RR DA AA+KRYNN
Subjt: KHVQWQHDLF--EDSLRAS----------GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNN
Query: VLLDGKPMKIEILRDNAEMP
V LDGK MKIEI+ N P
Subjt: VLLDGKPMKIEILRDNAEMP
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 3.2e-58 | 53.45 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL++N RPS+F+I+K P RR+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+ + WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++EI
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVL
L N +E P+S R +NVTGLNGR +RTVV+
Subjt: LRDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVL
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 3.2e-58 | 53.45 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGR G RRGPL++N RPS+F+I+K P RR+
Subjt: MATPLDMSLEDMIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRVVIGSIRRGPLSINTRPSAFSISKASFKLRGSVKLLFYGESHCGSPSYPYRHLPPRRM
Query: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
+ + WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++EI
Subjt: KHVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEI
Query: LRDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVL
L N +E P+S R +NVTGLNGR +RTVV+
Subjt: LRDN--AEMPVSAR--INVTGLNGRSRRTVVL
|
|
