CuGenDBv2

Gene ID	MS019297
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	phylloplanin-like
Genome location	scaffold611:164993..165271
RNA-Seq Expression	MS019297
Synteny	MS019297
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR040404 - Phylloplanin-like

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7026315.1 hypothetical protein SDJN02_12816 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.3e-32

78.72

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A VEM CG+ GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL+NCSLVVTTPL +C+ A+PSFG L SPLQLIGNTFLGLFN+TNI+P+GFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

XP_022138800.1 phylloplanin-like [Momordica charantia]

2.3e-41

97.85

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +AGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQ IGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

XP_022930242.1 uncharacterized protein LOC111436755 isoform X1 [Cucurbita moschata]

3.3e-32

78.72

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A VEM CG+ GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL+NCSLVVTTPL +C+ A+PSFG L SPLQLIGNTFLGLFN+TNI+P+GFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

XP_022930243.1 phylloplanin-like isoform X2 [Cucurbita moschata]

3.3e-32

78.72

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A VEM CG+ GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL+NCSLVVTTPL +C+ A+PSFG L SPLQLIGNTFLGLFN+TNI+P+GFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

XP_038906580.1 phylloplanin-like [Benincasa hispida]

3.3e-32

76.34

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A V+MQCG+G V+SSVKTD +G FS+LLDAP LLLSFLL NCSLVVTTPL DC+ ALPSFG L+SPLQL+GNTFLGLFNVTN +P+ FRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3C7U3 phylloplanin-like

7.5e-30

72.83

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFL
        +A V+MQCG+GTV+SSVKTD +G FS+L+DAP L+L FLL NC+LVVTTPL DC+A LPSFG L+SPLQLIGNTF GLFNVTN +P+GFRF+
Subjt:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFL

A0A6J1CAI6 phylloplanin-like

1.1e-41

97.85

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +AGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQ IGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

A0A6J1EPU9 uncharacterized protein LOC111436755 isoform X1

1.6e-32

78.72

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A VEM CG+ GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL+NCSLVVTTPL +C+ A+PSFG L SPLQLIGNTFLGLFN+TNI+P+GFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

A0A6J1EUI5 phylloplanin-like isoform X2

1.6e-32

78.72

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A VEM CG+ GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL+NCSLVVTTPL +C+ A+PSFG L SPLQLIGNTFLGLFN+TNI+P+GFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

A0A6J1KIA9 phylloplanin-like

6.1e-32

79.79

Show/hide

Query:  DAGVEMQCG-SGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP
        +A VEM CG +GTVISSVK+D +GRFSMLLDAP LLLSFLL+NCSLVVTTPL +C+ ALPSFG L SPLQLI NTFLGLFNVTNI+P+GFRFLP
Subjt:  DAGVEMQCG-SGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q56S59 Phylloplanin

2.7e-08

42.39

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTF---LGLFNVTNIVPLGF
        +A V+++CG+  VISS  T+ SG FS+ ++      +F L NC+LVV TPL+ C+A L S G L S L+L+  T     GL  V  + P GF
Subjt:  DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTF---LGLFNVTNIVPLGF

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G16660.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein

2.2e-18

49.46

Show/hide

Query:  DAGVEMQCG-SGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFL
        +AGVE+QCG    V+S+  T+ +G FS+  D+  +LLS LL +C +VVTTPL+ C+A LPS G L+S L +IGN+  GL N+ +I+P GF  L
Subjt:  DAGVEMQCG-SGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFL

AT3G16670.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein

5.3e-12

41.11

Show/hide

Query:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGF
        +A V++QCG+   V++   T+ +G F+   +   + L  LL++C +VV TP + CDA LPS G LIS L L+G+   GL N+  I+P GF
Subjt:  DAGVEMQCGS-GTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

GATGCTGGGGTGGAAATGCAATGTGGATCCGGAACCGTAATTTCGTCGGTGAAAACCGACACGTCGGGAAGGTTTTCGATGCTTCTGGATGCGCCTCTGTTGCTGCTCTC
CTTCTTACTCGACAACTGCAGTCTCGTCGTCACGACGCCGCTCGCCGACTGCGACGCCGCGCTGCCGTCGTTCGGCGGCCTCATCTCGCCGCTGCAACTCATCGGAAACA
CATTTCTCGGACTCTTCAACGTCACCAATATCGTTCCCTTAGGCTTCCGCTTCCTCCCC

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

DAGVEMQCGSGTVISSVKTDTSGRFSMLLDAPLLLLSFLLDNCSLVVTTPLADCDAALPSFGGLISPLQLIGNTFLGLFNVTNIVPLGFRFLP

MS019297 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome