; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019343 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019343
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionprotein TAPETUM DETERMINANT 1-like
Genome locationscaffold611:504935..505222
RNA-Seq ExpressionMS019343
SyntenyMS019343
Gene Ontology termsGO:0001709 - cell fate determination (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR040361 - Tapetum determinant 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CBI22881.3 unnamed protein product, partial [Vitis vinifera]1.5e-4083.16Show/hide
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OMO58452.1 hypothetical protein COLO4_34617 [Corchorus olitorius]3.8e-3983.16Show/hide
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XP_010649517.1 PREDICTED: TPD1 protein homolog 1 [Vitis vinifera]1.5e-4083.16Show/hide
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XP_022138822.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Momordica charantia]6.9e-49100Show/hide
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XP_038876241.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Benincasa hispida]3.1e-4185.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1R3GK42 Uncharacterized protein1.8e-3983.16Show/hide
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A0A438GAZ0 TPD1 protein-like 17.4e-4183.16Show/hide
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A0A5C7IQE2 Uncharacterized protein7.0e-3980Show/hide
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        C+NRDISISQS+DST+GIPQYIVQI NTC+S CAPS+I LHC WFASA+IVNPR FKR+ YDDCLVNGGKPL  S+ IRFTYSNSFMYP+ FKSA
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A0A6J1CCA7 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like3.3e-49100Show/hide
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D7SYL1 Uncharacterized protein7.4e-4183.16Show/hide
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        C+NRDISISQS+DS++GIPQYIVQI NTC+S CAPS+I LHCGWFASA+IVNPRIFKR+FYDDCLVNGGKPL  S+ IRFTYSNSFMYPL FKSA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3T1 TPD1 protein homolog 15.2e-2347.92Show/hide
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        CS  DI + Q   +   +G+P Y V+I N+C+S+C  +EI + CGWF+S ++VNPR+F+R+ YDDCLVN G+PL   +++ F Y+NSF YPL   S
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Q2QR54 TPD1 protein homolog 1A1.1e-1743.62Show/hide
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        DI+I Q + +   +G+P Y V + N C        ECA + I + CGWF+S  +V+PR+F+R+ +DDCL+N G+PL   ET+ F Y+NSF Y L
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Q6TLJ2 Protein TAPETUM DETERMINANT 11.8e-2350.54Show/hide
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        +C + DI ++Q  ++    GIP Y+V+I N C+S C  S I ++CGWF+SAK++NPR+FKR+ YDDCLVN GKPL    T+ F Y+N+F Y L
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Q8S6P9 TPD1 protein homolog 1B1.4e-1543.48Show/hide
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        CS +++ + Q  ++   +GIP Y V+I N C + C   ++ + CG FASA++V+P  F+R+ ++DCLV GG  L  SE + F YSNSF YPL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05835.1 PHD finger protein2.5e-0431.08Show/hide
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        ++ V++ N C   C    +RL C  F  + +V+P   + +     +C+VN G PL+  +T+ F YSN+  + LR
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AT1G32583.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown3.7e-2447.92Show/hide
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        CS  DI + Q   +   +G+P Y V+I N+C+S+C  +EI + CGWF+S ++VNPR+F+R+ YDDCLVN G+PL   +++ F Y+NSF YPL   S
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AT4G24972.1 tapetum determinant 11.3e-2450.54Show/hide
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        +C + DI ++Q  ++    GIP Y+V+I N C+S C  S I ++CGWF+SAK++NPR+FKR+ YDDCLVN GKPL    T+ F Y+N+F Y L
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AGATGCAGTAACAGAGATATAAGCATCTCGCAGAGCAAGGATTCGACAGCGGGAATTCCGCAGTACATAGTTCAAATTGCAAATACTTGTCTCTCAGAATGCGCTCCCTC
CGAAATTCGTCTCCATTGCGGCTGGTTTGCCTCTGCAAAAATCGTAAACCCTAGAATTTTCAAGAGGATGTTTTACGACGATTGCTTGGTGAACGGAGGGAAGCCATTGA
ATATCAGTGAAACGATCAGATTCACTTACTCCAACTCCTTCATGTATCCTCTCAGATTCAAGTCGGCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGATGCAGTAACAGAGATATAAGCATCTCGCAGAGCAAGGATTCGACAGCGGGAATTCCGCAGTACATAGTTCAAATTGCAAATACTTGTCTCTCAGAATGCGCTCCCTC
CGAAATTCGTCTCCATTGCGGCTGGTTTGCCTCTGCAAAAATCGTAAACCCTAGAATTTTCAAGAGGATGTTTTACGACGATTGCTTGGTGAACGGAGGGAAGCCATTGA
ATATCAGTGAAACGATCAGATTCACTTACTCCAACTCCTTCATGTATCCTCTCAGATTCAAGTCGGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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