; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019351 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019351
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRrna intron-encoded homing endonuclease
Genome locationscaffold611:540943..541246
RNA-Seq ExpressionMS019351
SyntenyMS019351
Gene Ontology termsGO:0006278 - RNA-dependent DNA biosynthetic process (biological process)
GO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0090305 - nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0003964 - RNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
GO:0004190 - aspartic-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0004519 - endonuclease activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8637441.1 hypothetical protein CSA_023571 [Cucumis sativus]1.2e-3692.86Show/hide
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KAG9444583.1 hypothetical protein H6P81_015923 [Aristolochia fimbriata]1.8e-2982.72Show/hide
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TKR78379.1 uncharacterized protein D5086_0000283000 [Populus alba]5.0e-1997.96Show/hide
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TKS17479.1 uncharacterized protein D5086_0000013030 [Populus alba]5.0e-1997.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPG1 Uncharacterized protein5.8e-3792.86Show/hide
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A0A2N9IL11 Uncharacterized protein2.0e-2175Show/hide
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A0A4U5PNX9 Uncharacterized protein2.4e-1997.96Show/hide
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A0A5C7H450 Uncharacterized protein2.4e-1997.96Show/hide
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A0A6P6FTJ6 LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC1124899362.4e-1987.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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