CuGenDBv2

Gene ID	MS019555
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	RAB6-interacting golgin
Genome location	scaffold729:488913..490489
RNA-Seq Expression	MS019555
Synteny	MS019555
Gene Ontology terms	GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domains	IPR007033 - RAB6-interacting golgin

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004137876.1 GRB10-interacting GYF protein 2 [Cucumis sativus]

2.4e-70

94.61

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQLMVQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+AL+AFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_008442808.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486581 [Cucumis melo]

5.4e-70

94.01

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQLMVQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRK+ID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+AL+AFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_022144720.1 uncharacterized protein LOC111014340 [Momordica charantia]

6.6e-76

100

Show/hide

Query:  MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAV
        MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAV
Subjt:  MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAV

Query:  NKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        NKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  NKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_022945279.1 uncharacterized protein LOC111449572 [Cucurbita moschata]

1.9e-70

94.61

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQL+VQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRK+ID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+ALDAFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

XP_038903091.1 GRB10-interacting GYF protein 2-like [Benincasa hispida]

4.9e-71

95.21

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQTE  Q QQQLMVQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+AL+AFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LGI7 RAB6-interacting golgin

1.2e-70

94.61

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQLMVQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+AL+AFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A5D3DPH8 RAB6-interacting golgin

2.6e-70

94.01

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQLMVQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQ QLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRK+ID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+AL+AFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1CSF5 RAB6-interacting golgin

3.2e-76

100

Show/hide

Query:  MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAV
        MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAV
Subjt:  MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAV

Query:  NKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        NKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  NKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1G0J9 RAB6-interacting golgin

9.1e-71

94.61

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQL+VQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRK+ID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+ALDAFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

A0A6J1KYK3 RAB6-interacting golgin

9.1e-71

94.61

Show/hide

Query:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID
        MQ E  Q QQQL+VQNN GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRK+ID
Subjt:  MQTE--QPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKID

Query:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
        AVNKELKPLGHTCQKKEKEYK+ALDAFN+KNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR
Subjt:  AVNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G36410.1 Family of unknown function (DUF662)

4.0e-55

72.02

Show/hide

Query:  QPQQQLMVQNNQ-----GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDA
        QPQ Q   Q+N+     GSLSFSSH+S+EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++Q QLGRVE+ETKRL+ IREELE++ADPMRKEV+ VRKKID+
Subjt:  QPQQQLMVQNNQ-----GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDA

Query:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLME---LVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        VNKELKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN+EKVQLITKLME   LV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLME---LVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)

9.6e-57

73.33

Show/hide

Query:  QPQQQLMVQNNQ-----GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDA
        QPQ Q   Q+N+     GSLSFSSH+S+EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++Q QLGRVE+ETKRL+ IREELE++ADPMRKEV+ VRKKID+
Subjt:  QPQQQLMVQNNQ-----GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDA

Query:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        VNKELKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN+EKVQLITKLMELV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)

1.4e-55

72.73

Show/hide

Query:  QPQQQLMVQNNQ-----GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDA
        QPQ Q   Q+N+     GSLSFSSH+S+EDEE++RSALS FRAKE+EIE+++MEVRE++Q QLGRVE+ETKRL+ IREELE++ADPMRKEV+ VRKKID+
Subjt:  QPQQQLMVQNNQ-----GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDA

Query:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        VNKELKPLG T QKK  EYK+ALD FNEKN+EKVQLITKLMELV ESE+LR+ KLEELSK+I+T+
Subjt:  VNKELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)

1.2e-59

83.11

Show/hide

Query:  GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEK
        GS+SFSS +SKEDEE+SR+ALS FRAKEEEIE+KKME+RE+VQ QLGRVEEETKRLA IREELE LADPMRKEVA VRKKID+VNKELKPLGHT QKKE+
Subjt:  GSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHTCQKKEK

Query:  EYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI
        EYK+AL+AFNEKN+EKVQLIT+LMELV ESE++R+KKLEELSKNID+I
Subjt:  EYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTI

AT3G52920.2 Family of unknown function (DUF662)

2.8e-56

76.4

Show/hide

Query:  TEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAVNK
        T QP QQ+M      SLSFSS +SKEDEE++RSALS FRAKE+EIE++KMEVRE+V+ QLGRVEEET+RLA IREELE +ADPMRKEV  VRKKID+VNK
Subjt:  TEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAVNK

Query:  ELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDT
        ELKPLG T QKKE+EYK+ALD FNEKN+EKVQLITKLMELV ESE+LRLKKL+ELS++IDT
Subjt:  ELKPLGHTCQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCAGACGGAGCAGCCTCAGCAGCAATTAATGGTGCAGAACAACCAGGGAAGCCTCAGCTTCAGCAGCCATTTGTCGAAGGAAGATGAAGAAATTTCGAGGTCCGCTCT
CTCAACTTTCAGAGCCAAGGAAGAGGAGATCGAGAGGAAGAAGATGGAGGTTCGAGAGAAGGTTCAGGTCCAGCTCGGCCGCGTTGAAGAAGAGACCAAACGCCTCGCCT
GCATCAGGGAGGAACTCGAAGCGCTGGCAGATCCGATGAGGAAAGAAGTGGCTCAGGTTCGTAAAAAGATCGATGCGGTGAACAAGGAATTAAAGCCTCTGGGACATACC
TGTCAAAAGAAGGAAAAAGAGTACAAGGACGCCCTCGACGCCTTTAACGAGAAGAACAAGGAAAAAGTTCAGCTCATCACGAAATTAATGGAGCTGGTGAGCGAAAGCGA
GAGGTTGAGGCTGAAGAAGCTGGAGGAGCTGAGTAAGAACATAGATACAATTCGG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MQTEQPQQQLMVQNNQGSLSFSSHLSKEDEEISRSALSTFRAKEEEIERKKMEVREKVQVQLGRVEEETKRLACIREELEALADPMRKEVAQVRKKIDAVNKELKPLGHT
CQKKEKEYKDALDAFNEKNKEKVQLITKLMELVSESERLRLKKLEELSKNIDTIR

MS019555 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome