; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019613 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019613
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRAB GTPase homolog C2A
Genome locationscaffold729:1010652..1012110
RNA-Seq ExpressionMS019613
SyntenyMS019613
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596496.1 Ras-related protein RABC2a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-8594.35Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLL+VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NLSD+WAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAKELGS+FLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

XP_022144607.1 ras-related protein RABC2a-like [Momordica charantia]1.5e-8998.87Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNLSDIWAKEVELY TNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

XP_022936998.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita moschata]2.9e-8594.35Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLL+VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NLSD+WAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAKELGS+FLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

XP_023005146.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita maxima]6.4e-8593.79Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIST+AENLAPTIGVDFKIKLL+VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NLSD+WAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAKELGS+FLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

XP_038905103.1 ras-related protein RABC2a-like [Benincasa hispida]8.4e-8593.22Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIST+A+NLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NLSD+WAKEVELYSTNK+CVKMLIGNKVDR+SER VSREEGI+LAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGE4 Uncharacterized protein5.3e-8593.22Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIST+A+NLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNLSD+WAKEVELYSTNK+CVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAK LGSYFLECSAKTRENVEKCFE+LALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

A0A5A7TKX7 Ras-related protein RABC2a2.6e-8493.22Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIST+A+NLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNLSD+WAKEVELYSTNK+CVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAK LGS FLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

A0A6J1CU51 ras-related protein RABC2a-like7.2e-9098.87Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNLSDIWAKEVELY TNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

A0A6J1FET8 ras-related protein RABC2a-like1.4e-8594.35Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLL+VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NLSD+WAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAKELGS+FLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

A0A6J1KU45 ras-related protein RABC2a-like3.1e-8593.79Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQS S+YDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIST+AENLAPTIGVDFKIKLL+VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NLSD+WAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDR+SERAVSREEGI+LAKELGS+FLECSAKTRENVEKCFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC13.8e-7275.14Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQ    +D  FKVLLIGDSGVGKSSLLLSF S + ++L+PTIGVDFK+K L +G K+LKL IWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI++VYDVTRR+
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNLSDIWAKE++LYSTN++C+KML+GNKVD++SERAVS++EGI  A+E G  FLECSAKTR NVE+CFEEL LK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

O49841 Ras-related protein RABC2a1.7e-8084.75Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSG  YDLSFK+LLIGDSGVGKSSLL+SFIS+S E+LAPTIGVDFKIK L VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNL D+W KE+ELYSTN+ECV+ML+GNKVDR+SER VSREEGI+LAKEL   FLECSA+TR+NVE+CFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

P36862 GTP-binding protein yptV38.5e-4858.33Show/hide
Query:  SYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIS-TSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRETFTNLSDIW
        S+D +FKVLL+GDSGVGKS +L  F S    E+   TIGVDFK+K L   GKR KLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+ VYDVTRR+TF +L   W
Subjt:  SYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFIS-TSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRETFTNLSDIW

Query:  AKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
         +E ++YST +  +KM++ NKVD  ++R VS EEG   A+  G  F+E SA+    V + FEEL LK+
Subjt:  AKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

Q6DHC1 Ras-related protein Rab-18-B4.2e-4758.54Show/hide
Query:  SFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFI-STSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRETFTNLSDIWAKEV
        + K+L+IG+SGVGKSSLLL F   T    LA TIGVDFK+K + + G R KL IWDTAGQERFRTLT SYYRGAQG++LVYDVT+R+TFT L + W  E+
Subjt:  SFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFI-STSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRETFTNLSDIWAKEV

Query:  ELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        E Y T  + VKML+GNK+D+D+ R V R EG+  A++    F+E SAKTR+ V+  FEEL  K+
Subjt:  ELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

Q9SF92 Ras-related protein RABC2b1.5e-7680.79Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSG  YDLSFK+LLIGDSGVGKSSLLLSFIS+S E+LAPTIGVDFKIK +KV GKRLKLTIWDTAGQE+FRTLTSSY+RG+QGI+LVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NL+DIWAKE+ELYSTN +C+KML+GNKVDR+SER VSREEG++LAK+L   F ECSA+TRENV  CFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B182.7e-7375.14Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQ    +D  FKVLLIGDSGVGKSSLLLSF S + ++L+PTIGVDFK+K L +G K+LKL IWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI++VYDVTRR+
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNLSDIWAKE++LYSTN++C+KML+GNKVD++SERAVS++EGI  A+E G  FLECSAKTR NVE+CFEEL LK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B1.1e-7780.79Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSG  YDLSFK+LLIGDSGVGKSSLLLSFIS+S E+LAPTIGVDFKIK +KV GKRLKLTIWDTAGQE+FRTLTSSY+RG+QGI+LVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NL+DIWAKE+ELYSTN +C+KML+GNKVDR+SER VSREEG++LAK+L   F ECSA+TRENV  CFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

AT3G09910.2 RAB GTPase homolog C2B1.1e-7780.79Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSG  YDLSFK+LLIGDSGVGKSSLLLSFIS+S E+LAPTIGVDFKIK +KV GKRLKLTIWDTAGQE+FRTLTSSY+RG+QGI+LVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NL+DIWAKE+ELYSTN +C+KML+GNKVDR+SER VSREEG++LAK+L   F ECSA+TRENV  CFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

AT3G09910.3 RAB GTPase homolog C2B1.1e-7780.79Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSG  YDLSFK+LLIGDSGVGKSSLLLSFIS+S E+LAPTIGVDFKIK +KV GKRLKLTIWDTAGQE+FRTLTSSY+RG+QGI+LVYDVT+RE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TF NL+DIWAKE+ELYSTN +C+KML+GNKVDR+SER VSREEG++LAK+L   F ECSA+TRENV  CFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A1.2e-8184.75Show/hide
Query:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE
        MGSSSGQSG  YDLSFK+LLIGDSGVGKSSLL+SFIS+S E+LAPTIGVDFKIK L VGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGI+LVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRE

Query:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV
        TFTNL D+W KE+ELYSTN+ECV+ML+GNKVDR+SER VSREEGI+LAKEL   FLECSA+TR+NVE+CFEELALK+
Subjt:  TFTNLSDIWAKEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATCTTCTTCTGGCCAGAGTGGCAGCAGCTACGATCTGTCGTTTAAGGTTTTGCTGATCGGCGATTCTGGTGTCGGCAAAAGTAGTCTTCTCCTCAGCTTCATCTC
TACTTCTGCTGAAAATCTTGCCCCCACGATTGGGGTGGATTTTAAGATCAAGCTGCTCAAGGTGGGTGGGAAGAGATTGAAGCTAACAATCTGGGACACTGCTGGACAGG
AGAGGTTCAGAACATTAACAAGCTCCTACTATAGAGGTGCCCAAGGGATTGTTCTTGTCTATGATGTCACACGGAGAGAAACGTTCACGAACTTATCCGACATATGGGCT
AAAGAAGTCGAACTCTACTCGACAAATAAGGAATGTGTCAAGATGCTTATTGGTAATAAGGTTGACAGAGATTCTGAAAGGGCTGTGAGCAGAGAGGAGGGGATTTCTCT
AGCAAAAGAGCTTGGATCCTATTTTCTTGAATGCAGTGCTAAAACCAGAGAAAATGTGGAGAAATGCTTTGAAGAGTTGGCATTGAAGGTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGATCTTCTTCTGGCCAGAGTGGCAGCAGCTACGATCTGTCGTTTAAGGTTTTGCTGATCGGCGATTCTGGTGTCGGCAAAAGTAGTCTTCTCCTCAGCTTCATCTC
TACTTCTGCTGAAAATCTTGCCCCCACGATTGGGGTGGATTTTAAGATCAAGCTGCTCAAGGTGGGTGGGAAGAGATTGAAGCTAACAATCTGGGACACTGCTGGACAGG
AGAGGTTCAGAACATTAACAAGCTCCTACTATAGAGGTGCCCAAGGGATTGTTCTTGTCTATGATGTCACACGGAGAGAAACGTTCACGAACTTATCCGACATATGGGCT
AAAGAAGTCGAACTCTACTCGACAAATAAGGAATGTGTCAAGATGCTTATTGGTAATAAGGTTGACAGAGATTCTGAAAGGGCTGTGAGCAGAGAGGAGGGGATTTCTCT
AGCAAAAGAGCTTGGATCCTATTTTCTTGAATGCAGTGCTAAAACCAGAGAAAATGTGGAGAAATGCTTTGAAGAGTTGGCATTGAAGGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSSSGQSGSSYDLSFKVLLIGDSGVGKSSLLLSFISTSAENLAPTIGVDFKIKLLKVGGKRLKLTIWDTAGQERFRTLTSSYYRGAQGIVLVYDVTRRETFTNLSDIWA
KEVELYSTNKECVKMLIGNKVDRDSERAVSREEGISLAKELGSYFLECSAKTRENVEKCFEELALKV