; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019661 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019661
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionsyntaxin-71
Genome locationscaffold729:1358121..1359917
RNA-Seq ExpressionMS019661
SyntenyMS019661
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0048278 - vesicle docking (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR006012 - Syntaxin/epimorphin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607729.1 Syntaxin-71, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-13196.54Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPD+IQAIPDGT T+TKK GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

KAG7037304.1 Syntaxin-71 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.0e-13196.55Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALP+RIQAIPDGT T+TKK GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLYK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLYK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLYK

XP_022145692.1 syntaxin-71 [Momordica charantia]2.2e-134100Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

XP_022981579.1 syntaxin-71-like [Cucurbita maxima]5.1e-13196.92Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T+TKK GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

XP_023521570.1 syntaxin-71-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-13196.92Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T+TKK GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B689 syntaxin-712.1e-13096.54Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T TK  GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

A0A5A7TS26 Syntaxin-714.2e-13196.55Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T TK  GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLYK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLYK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLYK

A0A6J1CXF0 syntaxin-711.1e-134100Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

A0A6J1FSW5 syntaxin-71-like2.5e-13196.54Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALP+RIQAIPDGT T+TKK GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

A0A6J1J294 syntaxin-71-like2.5e-13196.92Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDAS EKNRASVVALNAEIRRTKARLLEE+PKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT T+TKK GGWTSSASRT+IKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDI+LLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54IX6 Probable syntaxin-8B5.0e-0424.03Show/hide
Query:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEEVPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTTTA
        D   +L  ++ ADI+      E + +++N   +V  N  A++R     +  E+ +LQ  L     + +  ++L  R + V   +++ +++ +  D     
Subjt:  DAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALN--AEIRRTKARLLEEVPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV---LALPDRIQAIPDGTTTA

Query:  TKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
        T +      + +   I + S+ +F     + TE + QF        Q++ MR  +QD+ LD++S+ +   KNMAH M+ E+D+   ++D+++   D  + 
Subjt:  TKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS

Query:  DLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIIL
         L+N N R++ T+ Q   S    + IV+L I++
Subjt:  DLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIIL

Q94KK5 Syntaxin-731.5e-8866.54Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S ++I+FD   SD R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLK TV +LRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAA++Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

Q94KK6 Syntaxin-725.2e-8664.26Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL E+V KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGG-W-TSSASRTDIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K+    W  +SA   +IKFD S+   DD +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGG-W-TSSASRTDIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRLK  + Q+RSSRNFCIDI+LLC+ILGI +Y+Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

Q9SF29 Syntaxin-713.4e-10979.77Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL EEVPKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWT--SSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K T  WT  S+ SR DIKFDSDGRFDD+YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWT--SSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDIVLLCI+LGIAAYLY
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09740.1 syntaxin of plants 712.4e-11079.77Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  +KEKNRA+ VA+NAEIRRTKARL EEVPKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWT--SSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K T  WT  S+ SR DIKFDSDGRFDD+YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWT--SSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRLK TVNQLRSSRNFCIDIVLLCI+LGIAAYLY
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

AT3G45280.1 syntaxin of plants 723.7e-8764.26Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+RRTKARL E+V KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGG-W-TSSASRTDIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG     K+    W  +SA   +IKFD S+   DD +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGG-W-TSSASRTDIKFD-SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRLK  + Q+RSSRNFCIDI+LLC+ILGI +Y+Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

AT3G61450.1 syntaxin of plants 731.0e-8966.54Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S ++I+FD   SD R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLK TV +LRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAA++Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY

AT3G61450.2 syntaxin of plants 733.5e-9367.68Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY+ VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIRRTKARLLE +PKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+ +       GGW +S S ++I+FD   SD R   EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQDQGLD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFD---SDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRLK TV +LRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAA++Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGACGCGATCTGCCAGAAGTATGACAAGTACGATGTAGAGAAGCAGAGGGATCTCAATGTCTCCGGCGACGACGCCTTCGC
TCGACTCTATGCAACCGTCGAAGCCGACATTGAAGCCGCTCTCCAGAAAGCGGAGGATGCTTCCAAAGAGAAGAATAGGGCATCGGTGGTGGCGTTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACTAAGGCTCGATTACTGGAGGAGGTCCCCAAGTTGCAGAGATTGGCCGTGAAGAGGGTAAAAGGGCTATCAACGGAAGATCTTACTACTCGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCGGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGGACTACCACTGCAACCAAGAAGACTGGGGGTTGGACATCCTCAGCTTCACGTACTGATATAAAATTTGACTC
AGATGGACGATTCGATGATGAATACTTCCAACACACCGAGGAGTCAAGTCAGTTCAGGCAAGAGTATGAAATGCGGAAAATGAAACAGGATCAAGGATTGGACATGATAT
CAGAAGGGTTGGATACTCTGAAGAACATGGCTCATGATATGAATGAGGAAATAGATAGGCAAGTTCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAATGTTAGATTAAAGCACACAGTTAATCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGTATTGATATTGTTTTGTTGTGTATAATCTTGGGTATTGCTGC
CTATCTATACAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGCGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGACGCGATCTGCCAGAAGTATGACAAGTACGATGTAGAGAAGCAGAGGGATCTCAATGTCTCCGGCGACGACGCCTTCGC
TCGACTCTATGCAACCGTCGAAGCCGACATTGAAGCCGCTCTCCAGAAAGCGGAGGATGCTTCCAAAGAGAAGAATAGGGCATCGGTGGTGGCGTTGAATGCGGAGATTC
GTCGTACTAAGGCTCGATTACTGGAGGAGGTCCCCAAGTTGCAGAGATTGGCCGTGAAGAGGGTAAAAGGGCTATCAACGGAAGATCTTACTACTCGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCGGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGGACTACCACTGCAACCAAGAAGACTGGGGGTTGGACATCCTCAGCTTCACGTACTGATATAAAATTTGACTC
AGATGGACGATTCGATGATGAATACTTCCAACACACCGAGGAGTCAAGTCAGTTCAGGCAAGAGTATGAAATGCGGAAAATGAAACAGGATCAAGGATTGGACATGATAT
CAGAAGGGTTGGATACTCTGAAGAACATGGCTCATGATATGAATGAGGAAATAGATAGGCAAGTTCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAATGTTAGATTAAAGCACACAGTTAATCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGTATTGATATTGTTTTGTTGTGTATAATCTTGGGTATTGCTGC
CTATCTATACAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYATVEADIEAALQKAEDASKEKNRASVVALNAEIRRTKARLLEEVPKLQRLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV
LALPDRIQAIPDGTTTATKKTGGWTSSASRTDIKFDSDGRFDDEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
DLKNTNVRLKHTVNQLRSSRNFCIDIVLLCIILGIAAYLYK