; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019750 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019750
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationscaffold729:1942167..1943090
RNA-Seq ExpressionMS019750
SyntenyMS019750
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR010543 - Domain of unknown function DUF1117
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017281.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.1e-15688.96Show/hide
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XP_022935666.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like [Cucurbita moschata]7.1e-15688.96Show/hide
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XP_023526166.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-15689.29Show/hide
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XP_038906308.1 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like [Benincasa hispida]1.9e-16192.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B6J2 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like2.3e-15287.34Show/hide
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A0A5A7TL92 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like2.3e-15287.34Show/hide
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A0A6J1CXJ7 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A3.9e-176100Show/hide
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A0A6J1F5C6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like3.4e-15688.96Show/hide
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        RNNH   S
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A0A6J1J964 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF1-like1.0e-15588.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A2.9e-6748.81Show/hide
Query:  HDDASDPDPSFVPRLRRSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAG---GNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVN--
        H D S P P+ V R R       +R+P N +IVLR   +A A S++ +  G     +++YYDDGT S LRPLP +++EFL+GSGFDRLL+Q++Q+E+N  
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Query:  -GVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHV--PVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLP----TDGHGSGRSS-PAS
          + S EHPPASK+AIE+LP+++I  +H+    +SHCAVCKE F L S AREMPC HIYH DCILPWL+IRNSCPVCRH+LP    TDG G+  ++  A+
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Query:  AEE----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISWAS------SGRRSSEGGGFR-RVFRNFFSFFGRFRS--SS
        AEE      GLTIWRLPGGGFAVGR   G    +  +PVVYTE+DGG      +PRR++W S       G     GGGF  R+ R F  F G   S  ++
Subjt:  AEE----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISWAS------SGRRSSEGGGFR-RVFRNFFSFFGRFRS--SS

Query:  HHSSSGTG----LMRRSFSSTLF---NRRSRRNNHL
          +SSG+G    + RR+ S ++F   +  SRR N L
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P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING14.8e-3054.13Show/hide
Query:  LPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHVPVE-SHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCP
        LP+NI ++ +G G ++L+ QLA+ + N  G+   PPASK+AIE+LP+V I  S++  E + CAVC + FE  +EA++MPCKH+YH DC+LPWL + NSCP
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Query:  VCRHQLPTD
        VCRH+LPTD
Subjt:  VCRHQLPTD

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like1.7e-2737.14Show/hide
Query:  PSFVPRLRRSRRNGEDRA--PF----NRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEH
        PS  P+ R +++N +  A  PF    N +  LR              +G ++E   ++        +P N  ++  G G ++L+ QLA+ + N  G+   
Subjt:  PSFVPRLRRSRRNGEDRA--PF----NRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEH

Query:  PPASKAAIESLPVVKILASHVPVE-SHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTD
        PPASK+AI++LP VK+    +  E + CAVC + FE  S+ ++MPCKH++H DC+LPWL + NSCPVCR +LPTD
Subjt:  PPASKAAIESLPVVKILASHVPVE-SHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTD

Q940T5 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF23.5e-6549.48Show/hide
Query:  RSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGN--YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVN--GVGSLEHPPASKAAIES
        R RR+G  R  FN +IVL+  +        G  A     +E YYDDG+GS LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E +  G+G   +PPASK+AIES
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Query:  LPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWG
        LP V+I   H+  E++CAVC E FE ++EAREMPCKH++H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LP++   + RS+    +  VG+TIWRLPGGGFAVGRF   
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Query:  RGAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGIPRRISWASS-----------GRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSSGTGLMRRS
            E  LPVV TE+D GG   +   PRRISW  S           G  S  GG  RR+ R   S   R R +   SSS   +   S
Subjt:  RGAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGIPRRISWASS-----------GRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSSGTGLMRRS

Q9SNB6 E3 ubiquitin-protein ligase RDUF13.4e-6851.85Show/hide
Query:  ASDPDPSFVPRLRRS---RRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGA----ISNNGIGAGGN---YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLE
        AS P+   V    RS   RR    R  FN +IVL      GA     +  G GA      YE YYDDG+GS LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E
Subjt:  ASDPDPSFVPRLRRS---RRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGA----ISNNGIGAGGN---YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLE

Query:  V--NGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEV
           NG+G   +PPASK+AIESLP V+I   H   E++CAVC E FE   E REMPCKHI+H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LP+D     RS+    E  
Subjt:  V--NGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEV

Query:  VGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISW---------ASSGRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSS
        VG+TIWRLPGGGFAVGRF  G    E  LPVV TE+DGG   ++  PRRISW         + +G RS  GG  RR  R   SF  R R S   S+S
Subjt:  VGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISW---------ASSGRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39720.1 RING-H2 finger C2A2.0e-6848.81Show/hide
Query:  HDDASDPDPSFVPRLRRSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAG---GNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVN--
        H D S P P+ V R R       +R+P N +IVLR   +A A S++ +  G     +++YYDDGT S LRPLP +++EFL+GSGFDRLL+Q++Q+E+N  
Subjt:  HDDASDPDPSFVPRLRRSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAG---GNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVN--

Query:  -GVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHV--PVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLP----TDGHGSGRSS-PAS
          + S EHPPASK+AIE+LP+++I  +H+    +SHCAVCKE F L S AREMPC HIYH DCILPWL+IRNSCPVCRH+LP    TDG G+  ++  A+
Subjt:  -GVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHV--PVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLP----TDGHGSGRSS-PAS

Query:  AEE----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISWAS------SGRRSSEGGGFR-RVFRNFFSFFGRFRS--SS
        AEE      GLTIWRLPGGGFAVGR   G    +  +PVVYTE+DGG      +PRR++W S       G     GGGF  R+ R F  F G   S  ++
Subjt:  AEE----VVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISWAS------SGRRSSEGGGFR-RVFRNFFSFFGRFRS--SS

Query:  HHSSSGTG----LMRRSFSSTLF---NRRSRRNNHL
          +SSG+G    + RR+ S ++F   +  SRR N L
Subjt:  HHSSSGTG----LMRRSFSSTLF---NRRSRRNNHL

AT3G19950.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-2837.14Show/hide
Query:  PSFVPRLRRSRRNGEDRA--PF----NRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEH
        PS  P+ R +++N +  A  PF    N +  LR              +G ++E   ++        +P N  ++  G G ++L+ QLA+ + N  G+   
Subjt:  PSFVPRLRRSRRNGEDRA--PF----NRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEH

Query:  PPASKAAIESLPVVKILASHVPVE-SHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTD
        PPASK+AI++LP VK+    +  E + CAVC + FE  S+ ++MPCKH++H DC+LPWL + NSCPVCR +LPTD
Subjt:  PPASKAAIESLPVVKILASHVPVE-SHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTD

AT3G46620.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein2.4e-6951.85Show/hide
Query:  ASDPDPSFVPRLRRS---RRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGA----ISNNGIGAGGN---YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLE
        AS P+   V    RS   RR    R  FN +IVL      GA     +  G GA      YE YYDDG+GS LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E
Subjt:  ASDPDPSFVPRLRRS---RRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGA----ISNNGIGAGGN---YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLE

Query:  V--NGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEV
           NG+G   +PPASK+AIESLP V+I   H   E++CAVC E FE   E REMPCKHI+H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LP+D     RS+    E  
Subjt:  V--NGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEV

Query:  VGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISW---------ASSGRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSS
        VG+TIWRLPGGGFAVGRF  G    E  LPVV TE+DGG   ++  PRRISW         + +G RS  GG  RR  R   SF  R R S   S+S
Subjt:  VGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEHDLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISW---------ASSGRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSS

AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein6.7e-2747.83Show/hide
Query:  SNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHV-PVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVC
        +N  ++  G G + L+ QL+    +G      PPA K++I++LP +KI   H+   +SHC VCK+ FEL SEA++MPC HIYHSDCI+PWL   NSCPVC
Subjt:  SNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEHPPASKAAIESLPVVKILASHV-PVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVC

Query:  RHQLPTDGHGSGRSS
        R +LP+ G  S   S
Subjt:  RHQLPTDGHGSGRSS

AT5G59550.1 zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein2.5e-6649.48Show/hide
Query:  RSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGN--YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVN--GVGSLEHPPASKAAIES
        R RR+G  R  FN +IVL+  +        G  A     +E YYDDG+GS LRPLP ++SE LMGSGF+RLL QL+Q+E +  G+G   +PPASK+AIES
Subjt:  RSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGN--YEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVN--GVGSLEHPPASKAAIES

Query:  LPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWG
        LP V+I   H+  E++CAVC E FE ++EAREMPCKH++H DCI+PWLSIRNSCPVCR +LP++   + RS+    +  VG+TIWRLPGGGFAVGRF   
Subjt:  LPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWG

Query:  RGAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGIPRRISWASS-----------GRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSSGTGLMRRS
            E  LPVV TE+D GG   +   PRRISW  S           G  S  GG  RR+ R   S   R R +   SSS   +   S
Subjt:  RGAAEHDLPVVYTEID-GGFSTTSGIPRRISWASS-----------GRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSSGTGLMRRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTACCACGATGACGCTTCCGACCCAGACCCCTCCTTCGTCCCAAGATTGCGTCGCAGCAGAAGAAACGGTGAGGATCGCGCCCCTTTTAATCGTATCATCGTTCTACG
CGATCCCTCTAATGCGGGCGCTATTAGCAATAATGGTATTGGAGCTGGAGGTAATTACGAGATTTATTATGATGATGGTACTGGGTCTACCCTGCGGCCCTTACCTTCTA
ATATATCCGAATTCTTGATGGGATCGGGGTTCGACCGCCTTCTTAATCAATTGGCGCAGCTGGAGGTGAATGGGGTCGGCTCATTGGAACACCCACCAGCTTCAAAGGCT
GCAATTGAATCTTTGCCCGTGGTTAAGATTCTTGCTAGCCATGTGCCCGTGGAATCACATTGTGCTGTCTGTAAGGAACCATTTGAACTGGACTCTGAGGCTCGAGAAAT
GCCGTGTAAGCATATCTACCATTCGGATTGTATACTTCCTTGGCTTTCTATCCGGAATTCATGTCCGGTTTGTCGGCATCAGTTGCCTACCGATGGACATGGCAGTGGTC
GGAGCTCCCCTGCGTCTGCAGAAGAAGTTGTTGGATTAACAATTTGGAGGCTTCCGGGTGGGGGATTTGCTGTTGGGAGGTTTACCTGGGGTAGGGGAGCTGCAGAGCAC
GACCTTCCTGTTGTTTACACTGAAATTGATGGTGGGTTTAGTACCACCAGCGGTATTCCAAGGAGGATTTCATGGGCGTCAAGCGGAAGGAGATCAAGTGAGGGTGGTGG
TTTTCGTCGTGTTTTTCGCAATTTCTTCTCTTTTTTTGGCAGGTTTAGGAGTTCATCACATCATTCTAGTTCAGGGACTGGTTTAATGAGAAGGAGTTTCTCATCTACAT
TATTCAACAGACGCTCAAGGAGGAACAATCACCTTACGGCGTCC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTACCACGATGACGCTTCCGACCCAGACCCCTCCTTCGTCCCAAGATTGCGTCGCAGCAGAAGAAACGGTGAGGATCGCGCCCCTTTTAATCGTATCATCGTTCTACG
CGATCCCTCTAATGCGGGCGCTATTAGCAATAATGGTATTGGAGCTGGAGGTAATTACGAGATTTATTATGATGATGGTACTGGGTCTACCCTGCGGCCCTTACCTTCTA
ATATATCCGAATTCTTGATGGGATCGGGGTTCGACCGCCTTCTTAATCAATTGGCGCAGCTGGAGGTGAATGGGGTCGGCTCATTGGAACACCCACCAGCTTCAAAGGCT
GCAATTGAATCTTTGCCCGTGGTTAAGATTCTTGCTAGCCATGTGCCCGTGGAATCACATTGTGCTGTCTGTAAGGAACCATTTGAACTGGACTCTGAGGCTCGAGAAAT
GCCGTGTAAGCATATCTACCATTCGGATTGTATACTTCCTTGGCTTTCTATCCGGAATTCATGTCCGGTTTGTCGGCATCAGTTGCCTACCGATGGACATGGCAGTGGTC
GGAGCTCCCCTGCGTCTGCAGAAGAAGTTGTTGGATTAACAATTTGGAGGCTTCCGGGTGGGGGATTTGCTGTTGGGAGGTTTACCTGGGGTAGGGGAGCTGCAGAGCAC
GACCTTCCTGTTGTTTACACTGAAATTGATGGTGGGTTTAGTACCACCAGCGGTATTCCAAGGAGGATTTCATGGGCGTCAAGCGGAAGGAGATCAAGTGAGGGTGGTGG
TTTTCGTCGTGTTTTTCGCAATTTCTTCTCTTTTTTTGGCAGGTTTAGGAGTTCATCACATCATTCTAGTTCAGGGACTGGTTTAATGAGAAGGAGTTTCTCATCTACAT
TATTCAACAGACGCTCAAGGAGGAACAATCACCTTACGGCGTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MYHDDASDPDPSFVPRLRRSRRNGEDRAPFNRIIVLRDPSNAGAISNNGIGAGGNYEIYYDDGTGSTLRPLPSNISEFLMGSGFDRLLNQLAQLEVNGVGSLEHPPASKA
AIESLPVVKILASHVPVESHCAVCKEPFELDSEAREMPCKHIYHSDCILPWLSIRNSCPVCRHQLPTDGHGSGRSSPASAEEVVGLTIWRLPGGGFAVGRFTWGRGAAEH
DLPVVYTEIDGGFSTTSGIPRRISWASSGRRSSEGGGFRRVFRNFFSFFGRFRSSSHHSSSGTGLMRRSFSSTLFNRRSRRNNHLTAS