| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA8542646.1 hypothetical protein F0562_023855 [Nyssa sinensis] | 5.9e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAA8547639.1 hypothetical protein F0562_004068 [Nyssa sinensis] | 5.9e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAB1227682.1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 [Morella rubra] | 5.9e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| KAF8398634.1 hypothetical protein HHK36_014489 [Tetracentron sinense] | 5.9e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| XP_022155134.1 sm-like protein LSM8 [Momordica charantia] | 5.9e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LT86 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.8e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A1S3ATI1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.8e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6A1WQX6 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.8e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1GT46 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.8e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| A0A6J1K221 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 2.8e-32 | 98.65 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O95777 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 64.86 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q3ZCE0 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 64.86 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q5RCP3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 64.86 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q6ZWM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 | 1.4e-23 | 64.86 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I G LKGFDQ N+ILDESHERV+S+ +GV+Q+VLGLYI+RGDN++++GE+DEE DS LDL +RA PL V H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Q8VYI0 Sm-like protein LSM8 | 2.3e-31 | 86.49 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G19120.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 8.2e-08 | 46.3 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
+ G+L+ FDQ N +L+E++ERV + + LGLYIIRG+N+ ++GELD E
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
| AT1G65700.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-32 | 86.49 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.2 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 1.7e-32 | 86.49 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
I GVLKGFDQATNIILDESHERV+STKEGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD++LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDSNLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT1G65700.3 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 3.0e-26 | 54.7 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDS
I GVLKGFDQATNIILDESHERV+STK EGVQQ VLGLYIIRGDNI ++GELDEELD+
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTK-------------------------------------------EGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEELDS
Query: NLDLSKLRAHPLKPVIH
+LD SKLRAHPLKPV+H
Subjt: NLDLSKLRAHPLKPVIH
|
|
| AT3G14080.1 Small nuclear ribonucleoprotein family protein | 7.0e-07 | 44.44 | Show/hide |
Query: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
+ G L+ FDQ N +L+ + ERV E + LGLY+IRG+N+ ++GELD E
Subjt: IQGVLKGFDQATNIILDESHERVYSTKEGVQQLVLGLYIIRGDNISIVGELDEE
|
|
