; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019908 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019908
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionprotein TAPETUM DETERMINANT 1-like
Genome locationscaffold22:490217..492007
RNA-Seq ExpressionMS019908
SyntenyMS019908
Gene Ontology termsGO:0001709 - cell fate determination (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR040361 - Tapetum determinant 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019756.1 Protein TAPETUM DETERMINANT 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-8689.89Show/hide
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XP_022137731.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like isoform X1 [Momordica charantia]3.0e-101100Show/hide
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XP_022137736.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like isoform X2 [Momordica charantia]3.7e-9999.46Show/hide
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XP_022923940.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Cucurbita moschata]1.1e-8789.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B0P8 protein TAPETUM DETERMINANT 11.5e-8586.49Show/hide
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A0A5A7UPF3 Protein TAPETUM DETERMINANT 11.5e-8586.49Show/hide
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A0A6J1C7I8 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like isoform X21.8e-9999.46Show/hide
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A0A6J1C840 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like isoform X11.5e-101100Show/hide
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A0A6J1EDD3 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like5.4e-8889.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8MS78 Uncharacterized protein At1g058359.3e-0538.89Show/hide
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        + VEV+N C   C I  +  KC  F  + L++P   + L     +C+VNDG PL    TLSF Y+NT  + L
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Q1G3T1 TPD1 protein homolog 12.2e-3858.02Show/hide
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        + +N    A  RKLLL+ +  I + T   G+ C+K DIV+ QG T PLP+G+P+YTVE+ N+CV+ C+I  IH  CGWFSS  L+NPRVF+RL YDDCLV
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        NDG+PL  G +LSFQYAN+F YPLSV+SV C
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Q2QR54 TPD1 protein homolog 1A1.4e-2957.43Show/hide
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        DI I QG   PLP+G+P YTV+V+N C  G      C I GIH +CGWFSS  L++PRVF+RL +DDCL+NDG+PL+ G T+SF+Y N+FPY LSVS   
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        C
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Q6TLJ2 Protein TAPETUM DETERMINANT 15.2e-4060.29Show/hide
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        TT  +P   HRK+LL    T +     EP RI GEKC  +DIV+NQ  T P+P GIP Y VE+ N C++GC I  IH  CGWFSSA LINPRVFKR+ YD
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        DCLVN+GKPL +G TLSF YANTFPY LSV+ V C+
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Q8S6P9 TPD1 protein homolog 1B2.6e-2343.81Show/hide
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        R+  + C++ ++V+ Q     LP+GIPTY+VE++N C T C +Y +H  CG F+SA L++P  F+R+ ++DCLV  G  L     +SFQY+N+F YPL+V
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        ++V C
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05835.1 PHD finger protein6.6e-0638.89Show/hide
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AT1G32583.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown1.6e-3958.02Show/hide
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        + +N    A  RKLLL+ +  I + T   G+ C+K DIV+ QG T PLP+G+P+YTVE+ N+CV+ C+I  IH  CGWFSS  L+NPRVF+RL YDDCLV
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        NDG+PL  G +LSFQYAN+F YPLSV+SV C
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AT4G24972.1 tapetum determinant 13.7e-4160.29Show/hide
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        TT  +P   HRK+LL    T +     EP RI GEKC  +DIV+NQ  T P+P GIP Y VE+ N C++GC I  IH  CGWFSSA LINPRVFKR+ YD
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        DCLVN+GKPL +G TLSF YANTFPY LSV+ V C+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGAAAGACGATCTATCTACTACTACTACTGCTACTCGGCGCGTCTCGGTGATTTTCGCCTCAGTTTTCTTCATCTTCTTTTCGCTGTCTGCGCTCCTTACAGATCT
GGATATTATTGGTTCCTTTATGAACTCCAGTCCACCGAGTTATCTTCCGCTGGGACTCAACACCACAATAGTTGCTCCTCATCGCAAGCTTCTCCTGACTAAAGAAGCAA
CAATTGAGGAACCAACCAGAATTTGGGGTGAAAAGTGTACAAAATCAGACATTGTGATTAACCAAGGCCCCACTGCTCCACTTCCCACTGGAATTCCCACCTACACTGTG
GAGGTGGTGAACGCTTGCGTTACTGGGTGTGACATCTATGGCATTCACTTCAAATGCGGCTGGTTCAGCTCAGCTCACCTCATAAACCCCAGAGTTTTCAAGCGCCTTCG
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GCAGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GCAGC
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EVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLRYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTFPYPLSVSSVVCS