; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS019988 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS019988
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationscaffold22:1035642..1038278
RNA-Seq ExpressionMS019988
SyntenyMS019988
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652777.1 hypothetical protein Csa_022701 [Cucumis sativus]5.1e-11381.23Show/hide
Query:  KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVS
        KSSAKMQ FRRINQLVRRQ PDA+FK IRGYPLNGDAGCSCSAPMSMEN FTI   FG  YGSL GSFLRSFS+  NQYPEAF NM SQ+EFV  RKH S
Subjt:  KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVS

Query:  STCSVFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEV
        ST S FQ  RP  FQLAE A PFSSRGIA TSS+ES  Q SP +   I PRIKFKRLDKTS+HIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEV
Subjt:  STCSVFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEV

Query:  PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        PENKRR+STLKGIVIARRNAGLN+TFR+RR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVL+KKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

KAG6573088.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.3e-11582.25Show/hide
Query:  KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVS
        KS+ +MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VS
Subjt:  KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVS

Query:  STCSVFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEV
        STCS FQ PR  LFQLAE+A PFSSRGIA TSS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEV
Subjt:  STCSVFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEV

Query:  PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

XP_022137703.1 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like [Momordica charantia]7.6e-14198.15Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
        FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR

Query:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

XP_022955270.1 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.9e-11282.29Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSSTC  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIA TSS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

XP_038896029.1 uncharacterized protein LOC120084206 [Benincasa hispida]6.7e-11382.35Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ FRRINQLVRRQSPDAHFK IRGYPLNG+AGCSCS PM MEN   I+  FGN Y S +GS LRSFS+L NQ PEAF NM SQ+EFV SRKHVSS CS 
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        F   RP LFQLAE+  PFSSRGIA TSS+ES  Q SP +  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKAQREIPDI+PGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV41 Uncharacterized protein2.5e-11381.23Show/hide
Query:  KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVS
        KSSAKMQ FRRINQLVRRQ PDA+FK IRGYPLNGDAGCSCSAPMSMEN FTI   FG  YGSL GSFLRSFS+  NQYPEAF NM SQ+EFV  RKH S
Subjt:  KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVS

Query:  STCSVFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEV
        ST S FQ  RP  FQLAE A PFSSRGIA TSS+ES  Q SP +   I PRIKFKRLDKTS+HIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEV
Subjt:  STCSVFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEV

Query:  PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        PENKRR+STLKGIVIARRNAGLN+TFR+RR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVL+KKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  PENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A6J1CB38 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like3.7e-14198.15Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
        FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRR

Query:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
        VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ
Subjt:  VSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ

A0A6J1GUP7 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X29.4e-11382.29Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSSTC  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIA TSS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

A0A6J1GVN3 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X12.3e-11181.99Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAF-INMGSQVEFVSSRKHVSSTCS
        MQ+FRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDA C CSA MSME  FT  R FGNPY SLNGS  RSFSKL NQYPEAF  +MGSQ+EF+ S K VSSTC 
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAF-INMGSQVEFVSSRKHVSSTCS

Query:  VFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
         FQ P+  LFQLAE+A PFSSRGIA TSS+ES  Q S  I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEA+EEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENK
Subjt:  VFQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENK

Query:  RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKM +LKK
Subjt:  RRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

A0A6J1K1Y5 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X23.3e-11081.55Show/hide
Query:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV
        MQ+F RINQLVRRQS  AHFK IRGYPLNGDA   CSA MSMEN  T  R F NPYGSLNGS  RSFSKL NQYPEAF +MGSQ+EF+ S K VSS C  
Subjt:  MQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSV

Query:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
        FQ PR  LFQLAE+A PFSSRGIA TSS+ES  Q SP I  DITPRIKFKRLDKTSKHIMQ    L+KEAIEEVKA+REIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR
Subjt:  FQRPRPLLFQLAEVAPPFSSRGIA-TSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKR

Query:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRR+VAGVGIESLFPLYSPNIKEI VLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALK+
Subjt:  RVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic6.6e-3143.32Show/hide
Query:  VEFVSSRKHVSSTCSVFQRPRPLLFQL---AEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPD
        V   SS    S+  S+F  P    F +   AE +    +  +A  + E +  ES     +  PR +  +L          +  LNK+A+   +  R +P 
Subjt:  VEFVSSRKHVSSTCSVFQRPRPLLFQL---AEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPD

Query:  IKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        I+ G IVQ+++EVPENKRR+S  KGIVI+R+NAG++TT R+RR++AGVG+E +FPLYSPNIKEIKV+  +KVR+A+LYYLRDK+  L
Subjt:  IKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

Q2RV56 50S ribosomal protein L191.7e-1845.79Show/hide
Query:  MQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAK
        M  +    KE IE++  QR +P   PG  +++ V+V E N++RV   +G+ IARRNA LN++F +R++  G G+E +FPLY+P I  I+V+ + KVRRAK
Subjt:  MQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAK

Query:  LYYLRDK
        LYYLR +
Subjt:  LYYLRDK

Q2VZV5 50S ribosomal protein L192.6e-1949.5Show/hide
Query:  LNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRD
        L KE IE++ A R +P   PG  +++ V+V E N+ RV   +G+ IAR+N GLN++F +R++  G G+E +FPLYSPNI  I+V+ +  VRRAKLYYLRD
Subjt:  LNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPE-NKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRD

Query:  K
        +
Subjt:  K

Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic5.1e-3156.03Show/hide
Query:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK
        KT   +   +  LNK+AIE  +  R +P ++ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +K
Subjt:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK

Query:  VRRAKLYYLRDKMNAL
        VRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VRRAKLYYLRDKMNAL

Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic5.1e-3149.65Show/hide
Query:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL
        +  E   +E  E  P   PRIK          +   +  LN++AIE  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR+
Subjt:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL

Query:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        +AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein4.8e-5373.2Show/hide
Query:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN
        FSSR  +T+  +SV Q SPE    +  RIKFKRLDKT+KHIMQ    ++KEA+EEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN
Subjt:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN

Query:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        +TFR+RRLVAGVG+ES+FPLYSPN++ IKV+DKKKVRRAKLYYLR+K+NALKK
Subjt:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein1.5e-5473.2Show/hide
Query:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN
        ++SR  +T+   SV Q SPE    +  RIKFKRLDKT+KHIMQ    ++KEA+EEV++ REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN
Subjt:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN

Query:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        +TFR+RRLVAGVG+ES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
Subjt:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein3.6e-3249.65Show/hide
Query:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL
        +  E   +E  E  P   PRIK          +   +  LN++AIE  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR+
Subjt:  SSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRL

Query:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL
        +AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +KVRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNAL

AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein8.8e-5573.86Show/hide
Query:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN
        FS+ G    SV+S  Q SPE    +  RIKFKRLDKT+KHIMQ    ++KEA+EEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRRVS +KG+VIARRNAGLN
Subjt:  FSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLN

Query:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK
        +TFR+RRLVAGVG+ES+FPLYSPN++EIKV+DKKKVRRAKLYYLRDK+NALKK
Subjt:  TTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKK

AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein3.6e-3256.03Show/hide
Query:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK
        KT   +   +  LNK+AIE  +  R +P ++ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG++TT R+RR++AG+G+E +FP+YSPNIKEIKV+  +K
Subjt:  KTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAGLNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKK

Query:  VRRAKLYYLRDKMNAL
        VRRA+LYYLRDK+  L
Subjt:  VRRAKLYYLRDKMNAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
AAATCTAGCGCGAAAATGCAAAGTTTTCGCAGAATTAATCAGTTGGTACGAAGGCAAAGTCCCGATGCTCATTTCAAATCGATTAGAGGTTACCCACTTAATGGGGATGC
TGGCTGTAGCTGCTCGGCGCCAATGTCGATGGAAAACGGTTTTACTATTGCTCGGCCTTTTGGAAATCCATATGGGTCTTTGAATGGTTCCTTCTTGAGGTCTTTCTCAA
AGTTGAGCAATCAATATCCGGAAGCCTTCATAAATATGGGTTCTCAAGTGGAATTTGTGTCTTCGAGAAAGCATGTATCTTCAACTTGTTCAGTATTCCAGAGGCCTAGG
CCACTTTTATTTCAGTTGGCAGAAGTTGCCCCTCCTTTTTCTAGCAGGGGCATTGCGACTAGTTCCGTGGAATCAGTTTCACAAGAATCTCCTGAAATTACCCCTGATAT
AACTCCTCGCATCAAATTTAAGAGGCTGGATAAAACCTCAAAACACATAATGCAGGCACTCACATTTCTGAATAAGGAAGCTATTGAGGAGGTAAAAGCACAGAGAGAAA
TTCCAGATATTAAGCCAGGCTATATTGTGCAGCTCAAAGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGCCGTGTCTCGACATTGAAAGGCATTGTAATAGCCAGACGCAATGCTGGT
CTAAACACAACTTTTAGACTAAGGAGGCTAGTTGCTGGTGTTGGGATTGAGTCGCTCTTTCCTCTATACTCACCAAACATAAAAGAGATTAAGGTGTTGGACAAGAAGAA
AGTGCGGAGGGCCAAGCTTTATTATCTTAGGGACAAAATGAACGCACTTAAGAAGCAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATCTAGCGCGAAAATGCAAAGTTTTCGCAGAATTAATCAGTTGGTACGAAGGCAAAGTCCCGATGCTCATTTCAAATCGATTAGAGGTTACCCACTTAATGGGGATGC
TGGCTGTAGCTGCTCGGCGCCAATGTCGATGGAAAACGGTTTTACTATTGCTCGGCCTTTTGGAAATCCATATGGGTCTTTGAATGGTTCCTTCTTGAGGTCTTTCTCAA
AGTTGAGCAATCAATATCCGGAAGCCTTCATAAATATGGGTTCTCAAGTGGAATTTGTGTCTTCGAGAAAGCATGTATCTTCAACTTGTTCAGTATTCCAGAGGCCTAGG
CCACTTTTATTTCAGTTGGCAGAAGTTGCCCCTCCTTTTTCTAGCAGGGGCATTGCGACTAGTTCCGTGGAATCAGTTTCACAAGAATCTCCTGAAATTACCCCTGATAT
AACTCCTCGCATCAAATTTAAGAGGCTGGATAAAACCTCAAAACACATAATGCAGGCACTCACATTTCTGAATAAGGAAGCTATTGAGGAGGTAAAAGCACAGAGAGAAA
TTCCAGATATTAAGCCAGGCTATATTGTGCAGCTCAAAGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGCCGTGTCTCGACATTGAAAGGCATTGTAATAGCCAGACGCAATGCTGGT
CTAAACACAACTTTTAGACTAAGGAGGCTAGTTGCTGGTGTTGGGATTGAGTCGCTCTTTCCTCTATACTCACCAAACATAAAAGAGATTAAGGTGTTGGACAAGAAGAA
AGTGCGGAGGGCCAAGCTTTATTATCTTAGGGACAAAATGAACGCACTTAAGAAGCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
KSSAKMQSFRRINQLVRRQSPDAHFKSIRGYPLNGDAGCSCSAPMSMENGFTIARPFGNPYGSLNGSFLRSFSKLSNQYPEAFINMGSQVEFVSSRKHVSSTCSVFQRPR
PLLFQLAEVAPPFSSRGIATSSVESVSQESPEITPDITPRIKFKRLDKTSKHIMQALTFLNKEAIEEVKAQREIPDIKPGYIVQLKVEVPENKRRVSTLKGIVIARRNAG
LNTTFRLRRLVAGVGIESLFPLYSPNIKEIKVLDKKKVRRAKLYYLRDKMNALKKQ